33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1811 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1811  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  100 
 
 		 235 aa  487  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183017 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1357  hypothetical protein  46.89 
 
 		 239 aa  217  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2945  hypothetical protein  46.64 
 
 		 245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2328  hypothetical protein  48.36 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0340  hypothetical protein  46.02 
 
 		 217 aa  201  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0562312  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2444  hypothetical protein  45.63 
 
 		 263 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1916  hypothetical protein  44.4 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2328  hypothetical protein  44.53 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2722  hypothetical protein  42.86 
 
 		 235 aa  191  8e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0155766  hitchhiker  0.000528217 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1400  hypothetical protein  44.59 
 
 		 234 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2018  hypothetical protein  43.68 
 
 		 271 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00140757  hitchhiker  0.00602396 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2668  hypothetical protein  45.06 
 
 		 242 aa  186  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2449  hypothetical protein  44.31 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1932  hypothetical protein  40.74 
 
 		 274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2101  hypothetical protein  39.86 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.102691  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1877  hypothetical protein  39.64 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.591711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0578  hypothetical protein  39.11 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2403  hypothetical protein  35.39 
 
 		 283 aa  162  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1557  hypothetical protein  28.12 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.275394  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl271  putative SAM-dependent methyltransferase  21.26 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0014027  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2262  hypothetical protein  24.86 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.21581  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1973  hypothetical protein  24.28 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0572365  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1620  protein of unknown function DUF633  25.9 
 
 		 221 aa  49.7  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.282895  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0997  SAM-dependent methyltransferase  22.55 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219057  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1316  hypothetical protein  27.81 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00516293  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3495  hypothetical protein  23.7 
 
 		 230 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.84074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2276  hypothetical protein  20.81 
 
 		 230 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.699979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0357  hypothetical protein  26.9 
 
 		 221 aa  44.3  0.002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.298514  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1173  SAM-dependent methyltransferase  25.41 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0722958  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1111  SAM-dependent methyltransferase  23.17 
 
 		 237 aa  42.4  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0101071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3520  hypothetical protein  22.67 
 
 		 251 aa  42.4  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1203  hypothetical protein  22.95 
 
 		 227 aa  42.4  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2433  hypothetical protein  21.39 
 
 		 251 aa  42  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850819  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>