28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2945 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2945  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  506  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1357  hypothetical protein  51.85 
 
 		 239 aa  250  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2328  hypothetical protein  53.85 
 
 		 255 aa  242  5e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2328  hypothetical protein  51.82 
 
 		 267 aa  238  5e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2444  hypothetical protein  51.85 
 
 		 263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2722  hypothetical protein  48.95 
 
 		 235 aa  230  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0155766  hitchhiker  0.000528217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2018  hypothetical protein  49.23 
 
 		 271 aa  228  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00140757  hitchhiker  0.00602396 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1916  hypothetical protein  48.57 
 
 		 245 aa  227  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2101  hypothetical protein  45.79 
 
 		 280 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.102691  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2668  hypothetical protein  48.2 
 
 		 242 aa  220  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2449  hypothetical protein  52.89 
 
 		 251 aa  218  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1932  hypothetical protein  47.2 
 
 		 274 aa  214  8e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1811  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  46.64 
 
 		 235 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1877  hypothetical protein  44.32 
 
 		 280 aa  209  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.591711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2403  hypothetical protein  44.68 
 
 		 283 aa  207  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0340  hypothetical protein  50.47 
 
 		 217 aa  205  6e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0562312  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1400  hypothetical protein  46.67 
 
 		 234 aa  202  4e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0578  hypothetical protein  44.65 
 
 		 241 aa  175  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1557  hypothetical protein  31.28 
 
 		 264 aa  95.1  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.275394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0997  SAM-dependent methyltransferase  28.57 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219057  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0645  hypothetical protein  24.23 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000274924  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1316  hypothetical protein  26.06 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00516293  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1620  protein of unknown function DUF633  24.22 
 
 		 221 aa  48.9  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.282895  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1134  protein of unknown function DUF633  23.3 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000709417  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2460  hypothetical protein  27.91 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0357  hypothetical protein  25 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.298514  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3035  protein of unknown function DUF633  23.43 
 
 		 243 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.143624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3520  hypothetical protein  22.55 
 
 		 251 aa  42.4  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>