28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2722 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2722  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  484  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0155766  hitchhiker  0.000528217 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2945  hypothetical protein  48.95 
 
 		 245 aa  230  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1357  hypothetical protein  46.41 
 
 		 239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2403  hypothetical protein  44.67 
 
 		 283 aa  201  9e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2328  hypothetical protein  45.2 
 
 		 255 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2328  hypothetical protein  43.13 
 
 		 267 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1400  hypothetical protein  43.78 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2668  hypothetical protein  44.21 
 
 		 242 aa  192  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2444  hypothetical protein  43.41 
 
 		 263 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1811  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  42.86 
 
 		 235 aa  191  8e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183017 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2018  hypothetical protein  41.73 
 
 		 271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00140757  hitchhiker  0.00602396 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1932  hypothetical protein  40.8 
 
 		 274 aa  176  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1916  hypothetical protein  40.64 
 
 		 245 aa  175  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2101  hypothetical protein  40.47 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.102691  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0578  hypothetical protein  46.84 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0340  hypothetical protein  41.55 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0562312  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2449  hypothetical protein  40.97 
 
 		 251 aa  169  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1877  hypothetical protein  38.67 
 
 		 280 aa  164  8e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.591711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1557  hypothetical protein  33.05 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.275394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0997  SAM-dependent methyltransferase  25.73 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219057  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1316  hypothetical protein  25.56 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00516293  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2460  hypothetical protein  31.39 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0645  hypothetical protein  24.56 
 
 		 229 aa  46.6  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000274924  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3035  protein of unknown function DUF633  27.54 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.143624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2262  hypothetical protein  23.56 
 
 		 229 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.21581  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1973  hypothetical protein  25 
 
 		 229 aa  42.4  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0572365  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1203  hypothetical protein  27.34 
 
 		 227 aa  42.4  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2433  hypothetical protein  24.58 
 
 		 251 aa  42  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850819  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>