22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2444 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2444  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2328  hypothetical protein  94.01 
 
 
267 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2018  hypothetical protein  92.62 
 
 
271 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00140757  hitchhiker  0.00602396 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2328  hypothetical protein  93.54 
 
 
255 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1916  hypothetical protein  56.52 
 
 
245 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2449  hypothetical protein  57.31 
 
 
251 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1932  hypothetical protein  52.46 
 
 
274 aa  276  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482923  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2101  hypothetical protein  52.98 
 
 
280 aa  275  8e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.102691  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1877  hypothetical protein  52.98 
 
 
280 aa  270  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.591711  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2945  hypothetical protein  51.85 
 
 
245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1357  hypothetical protein  48.47 
 
 
239 aa  228  9e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2668  hypothetical protein  43.25 
 
 
242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1811  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  45.63 
 
 
235 aa  193  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.183017 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2722  hypothetical protein  43.41 
 
 
235 aa  193  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0155766  hitchhiker  0.000528217 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1400  hypothetical protein  42.5 
 
 
234 aa  187  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2403  hypothetical protein  42.69 
 
 
283 aa  188  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0340  hypothetical protein  44.26 
 
 
217 aa  187  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0562312  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0578  hypothetical protein  41.52 
 
 
241 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1557  hypothetical protein  26.77 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.275394  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1316  hypothetical protein  25.93 
 
 
234 aa  50.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00516293  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0997  SAM-dependent methyltransferase  32.53 
 
 
231 aa  47  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219057  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0357  hypothetical protein  25.97 
 
 
221 aa  44.3  0.002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.298514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>