52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4779 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4779  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4328  hypothetical protein  86.96 
 
 		 233 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2390  hypothetical protein  74.89 
 
 		 231 aa  359  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.351246  hitchhiker  0.000408238 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2868  hypothetical protein  66.52 
 
 		 231 aa  321  7e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.505053 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3495  hypothetical protein  64.78 
 
 		 230 aa  311  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.84074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2276  hypothetical protein  65.22 
 
 		 230 aa  311  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.699979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2433  hypothetical protein  64.78 
 
 		 251 aa  307  9e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1228  hypothetical protein  46.02 
 
 		 228 aa  201  9e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0746  hypothetical protein  44.59 
 
 		 235 aa  195  5.000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1203  hypothetical protein  43.18 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1173  SAM-dependent methyltransferase  45.98 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0722958  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3017  hypothetical protein  42.52 
 
 		 235 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0496127  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4424  hypothetical protein  42.18 
 
 		 235 aa  168  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4370  hypothetical protein  42.18 
 
 		 235 aa  168  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00679884  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2411  protein of unknown function DUF633  40.85 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00449661  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0770  SAM-dependent methyltransferase  43.33 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.217429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4030  hypothetical protein  41.71 
 
 		 235 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000059354  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4513  hypothetical protein  41.71 
 
 		 235 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000472419  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4312  hypothetical protein  41.71 
 
 		 235 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95415e-51 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4192  hypothetical protein  41.71 
 
 		 235 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00200706  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4142  hypothetical protein  41.12 
 
 		 235 aa  164  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000128061  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4040  hypothetical protein  41.71 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000619844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4407  hypothetical protein  41.71 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0829  hypothetical protein  41.23 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000387788  hitchhiker  1.2637100000000002e-18 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0160  protein of unknown function DUF633  39.32 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1126  hypothetical protein  37.72 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000295652  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1111  SAM-dependent methyltransferase  33.62 
 
 		 237 aa  141  9e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0101071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1652  hypothetical protein  42.63 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00296039  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1618  hypothetical protein  42.63 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0130761  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0997  SAM-dependent methyltransferase  38.66 
 
 		 231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219057  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2460  hypothetical protein  33.94 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1316  hypothetical protein  30.84 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00516293  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3035  protein of unknown function DUF633  40.65 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.143624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1973  hypothetical protein  28.26 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0572365  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2262  hypothetical protein  28.14 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.21581  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4215  protein of unknown function DUF633  37.5 
 
 		 265 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866297  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0496  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  96.3  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000915457  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0543  protein of unknown function DUF633  32.28 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000632736  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1620  protein of unknown function DUF633  30.37 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.282895  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl271  putative SAM-dependent methyltransferase  25.79 
 
 		 229 aa  92.4  5e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0014027  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0502  hypothetical protein  28.65 
 
 		 225 aa  91.7  9e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00991935  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0893  hypothetical protein  31.32 
 
 		 234 aa  90.1  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000579541  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0625  hypothetical protein  33.52 
 
 		 240 aa  89.4  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.155945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0645  hypothetical protein  33.15 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000274924  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0009  hypothetical protein  35.58 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.400013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0102  hypothetical protein  32.67 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.210812 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0357  hypothetical protein  28.5 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.298514  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3520  hypothetical protein  30.32 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1134  protein of unknown function DUF633  26.29 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000709417  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1975  protein of unknown function DUF633  35 
 
 		 256 aa  72  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0819547  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1216  protein of unknown function DUF633  23.91 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000079225  hitchhiker  0.00246839 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1400  hypothetical protein  23.21 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>