92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0198 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0198  PTS system, IIA component  100 
 
 		 146 aa  305  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166332  normal  0.313506 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0203  PTS system IIA component  91.1 
 
 		 146 aa  281  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0212  PTS system, IIA component  91.1 
 
 		 146 aa  281  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0195  PTS system transporter subunit IIA  90.41 
 
 		 146 aa  278  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0194  PTS system transporter subunit IIA  90.41 
 
 		 146 aa  278  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00128  predicted PTS Enzyme IIA  78.77 
 
 		 146 aa  253  4e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00127  hypothetical protein  78.77 
 
 		 146 aa  253  4e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3530  PTS system fructose subfamily IIA component  78.08 
 
 		 146 aa  252  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0122  PTS system IIA component domain protein  78.08 
 
 		 146 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3473  PTS system fructose subfamily IIA component  78.08 
 
 		 146 aa  252  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0133  PTS system IIA component domain-containing protein  78.08 
 
 		 146 aa  252  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0137  PTS system IIA component domain protein  77.4 
 
 		 146 aa  251  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0131  PTS system, IIA component  77.4 
 
 		 146 aa  250  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0139  PTS system IIA component domain-containing protein  76.71 
 
 		 146 aa  249  9.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0677  PTS system fructose subfamily IIA component  72.41 
 
 		 146 aa  233  9e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.717474  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3844  PTS system fructose subfamily IIA component  37.59 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3326  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  33.86 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0564  PTS system fructose subfamily IIA component  33.86 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.576662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3616  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  33.86 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02952  hypothetical protein  33.86 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03001  putative phosphotransferase system enzyme subunit (N-acetyl-galactosamine/galactosamine PTS system enzyme IIA component)  33.86 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3433  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  33.86 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4450  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  33.07 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.236223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2390  PTS system fructose subfamily IIA component  33.07 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3576  PTS system fructose subfamily IIA component  32.28 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.440401  normal  0.531464 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0989  PTS system fructose subfamily IIA component  31.54 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3371  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIA component  31.54 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.530615 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0937  PTS system, N-acetylgalactosamine-specific IIA component  31.54 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3396  PTS system fructose subfamily IIA component  29.03 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0148  phosphotransferase system, fructose subfamily IIA component  29.37 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0155  PTS system fructose subfamily IIA component  28.57 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0166  PTS system fructose subfamily IIA component  28.57 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1651  PTS system mannose/fructose/sorbose family transporter subunit IIB  27.08 
 
 		 324 aa  57.4  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.133869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0150  PTS system fructose subfamily IIA component  25.6 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2464  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  27.08 
 
 		 324 aa  57.4  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.134183  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2368  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  27.08 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.15235  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0153  PTS system fructose subfamily IIA component  29.69 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.327367 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2965  PTS system, IIA component  26.8 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2065  PTS system fructose subfamily IIA component  26.67 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2903  PTS system fructose subfamily IIA component  30.58 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312046  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0114  PTS system fructose subfamily IIA component  29.06 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0358  PTS system fructose subfamily IIA component  30.28 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2051  PTS system fructose subfamily IIA component  28.57 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5089  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0594  PTS system fructose subfamily IIA component  29.25 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0232573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0451  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIAB subunit  28.43 
 
 		 322 aa  47.4  0.00007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178007  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0971  PTS system fructose subfamily IIA component  27.88 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0466  PTS system fructose subfamily IIA component  29.25 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0440  PTS system fructose subfamily IIA component  28.44 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0345  PTS system fructose subfamily IIA component  28.3 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0370  PTS system fructose subfamily IIA component  29.25 
 
 		 152 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1953  PTS system fructose subfamily IIA component  33.67 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.478218  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2021  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  26.12 
 
 		 313 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2813  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  25.42 
 
 		 323 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.047129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0252  PTS system fructose subfamily IIA component  27.52 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0825  PTS system fructose subfamily IIA component  30.48 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01787  fused mannose-specific PTS enzymes: IIA component/IIB component  29.57 
 
 		 323 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0965607  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1371  PTS system, mannose-specific IIAB component  29.57 
 
 		 323 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000647863  normal  0.0229749 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1826  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  29.57 
 
 		 323 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000156617  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01775  hypothetical protein  29.57 
 
 		 323 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0856085  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2045  PTS system, mannose-specific IIAB component  29.57 
 
 		 323 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000183907  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2546  PTS system, mannose-specific IIAB component  29.57 
 
 		 323 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000579402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1907  PTS system, mannose-specific IIAB component  29.57 
 
 		 323 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000431359  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2083  PTS system, mannose-specific IIAB component  29.57 
 
 		 323 aa  44.7  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000444348  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2013  PTS system, IIA component  32.11 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0744543  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1983  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  27.68 
 
 		 318 aa  44.3  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2386  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIA subunit  28.7 
 
 		 320 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1068  PTS system fructose subfamily IIA component  26.79 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1926  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  26.4 
 
 		 322 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1973  PTS system, mannose-specific IIAB component  28.7 
 
 		 322 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00730165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1302  PTS system, mannose-specific IIAB component  28.7 
 
 		 322 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000497751  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1486  PTS system mannose-specific transporter subunit IIAB  28.7 
 
 		 322 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2030  PTS system mannose-specific IIAB component  28.7 
 
 		 322 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0638718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1969  PTS system mannose-specific transporter subunit IIAB  28.7 
 
 		 322 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000485794  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2094  PTS system, IIA component  32.11 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.98601  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2219  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  25.4 
 
 		 322 aa  43.5  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.854974  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0398  PTS system fructose subfamily IIA component  30.63 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0287233  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2738  PTS system fructose subfamily IIA component  26.42 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3009  PTS system fructose subfamily IIA component  24.35 
 
 		 142 aa  42.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0677471  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3574  PTS system fructose subfamily IIA component  32 
 
 		 133 aa  42  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1397  PTS system fructose subfamily IIA component  28.18 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136359 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3022  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  23.33 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1235  PTS system fructose subfamily IIA component  28.18 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1176  PTS system fructose subfamily IIA component  28.18 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459375  normal  0.718803 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1902  PTS system, IIA component  27.62 
 
 		 144 aa  42  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3447  PTS system fructose subfamily IIA component  27.27 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2967  PTS system fructose subfamily IIA component  25.77 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.434901  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4293  PTS system fructose subfamily IIA component  29.91 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3966  PTS system fructose subfamily IIA component  29.91 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.997411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3249  PTS system fructose subfamily IIA component  30.84 
 
 		 133 aa  40.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0208  PTS system IIA component  24.78 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.787809 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0948  PTS system fructose subfamily IIA component  29.41 
 
 		 137 aa  40  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1992  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  23.02 
 
 		 135 aa  40  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>