126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3530 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_3473  PTS system fructose subfamily IIA component  100 
 
 
146 aa  306  5e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0133  PTS system IIA component domain-containing protein  100 
 
 
146 aa  306  5e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3530  PTS system fructose subfamily IIA component  100 
 
 
146 aa  306  5e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0122  PTS system IIA component domain protein  100 
 
 
146 aa  306  5e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00128  predicted PTS Enzyme IIA  99.32 
 
 
146 aa  305  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00127  hypothetical protein  99.32 
 
 
146 aa  305  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0131  PTS system, IIA component  99.32 
 
 
146 aa  305  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0137  PTS system IIA component domain protein  98.63 
 
 
146 aa  304  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0139  PTS system IIA component domain-containing protein  95.21 
 
 
146 aa  296  5e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0198  PTS system, IIA component  78.08 
 
 
146 aa  252  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166332  normal  0.313506 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0195  PTS system transporter subunit IIA  76.71 
 
 
146 aa  246  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0194  PTS system transporter subunit IIA  76.71 
 
 
146 aa  246  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0203  PTS system IIA component  76.71 
 
 
146 aa  245  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0212  PTS system, IIA component  76.71 
 
 
146 aa  245  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0677  PTS system fructose subfamily IIA component  69.66 
 
 
146 aa  216  7e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.717474  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3844  PTS system fructose subfamily IIA component  39.1 
 
 
144 aa  96.3  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03001  putative phosphotransferase system enzyme subunit (N-acetyl-galactosamine/galactosamine PTS system enzyme IIA component)  33.08 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3326  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  33.08 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3616  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  33.08 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0564  PTS system fructose subfamily IIA component  33.08 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.576662  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02952  hypothetical protein  33.08 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3433  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  33.08 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0937  PTS system, N-acetylgalactosamine-specific IIA component  35.43 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3371  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIA component  35.43 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.530615 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0989  PTS system fructose subfamily IIA component  35.43 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4450  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  32.31 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.236223  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3396  PTS system fructose subfamily IIA component  33.86 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2390  PTS system fructose subfamily IIA component  30.77 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0150  PTS system fructose subfamily IIA component  29.84 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3576  PTS system fructose subfamily IIA component  31.5 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.440401  normal  0.531464 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2065  PTS system fructose subfamily IIA component  30.4 
 
 
147 aa  67  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2965  PTS system, IIA component  28.91 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0148  phosphotransferase system, fructose subfamily IIA component  34.62 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0166  PTS system fructose subfamily IIA component  33.65 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0153  PTS system fructose subfamily IIA component  35.85 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.327367 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0155  PTS system fructose subfamily IIA component  33.65 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0114  PTS system fructose subfamily IIA component  30.71 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204192  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2051  PTS system fructose subfamily IIA component  34.17 
 
 
142 aa  57.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5089  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2903  PTS system fructose subfamily IIA component  32.74 
 
 
134 aa  57.4  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312046  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2013  PTS system, IIA component  34.62 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0744543  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0825  PTS system fructose subfamily IIA component  33.65 
 
 
133 aa  55.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1651  PTS system mannose/fructose/sorbose family transporter subunit IIB  25.69 
 
 
324 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.133869  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2464  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  25.69 
 
 
324 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.134183  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0358  PTS system fructose subfamily IIA component  31.43 
 
 
133 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2094  PTS system, IIA component  34.62 
 
 
133 aa  55.5  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.98601  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0345  PTS system fructose subfamily IIA component  29.63 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3574  PTS system fructose subfamily IIA component  34.91 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2368  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  25.69 
 
 
324 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.15235  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0370  PTS system fructose subfamily IIA component  30.48 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0466  PTS system fructose subfamily IIA component  30.48 
 
 
133 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0594  PTS system fructose subfamily IIA component  30.48 
 
 
133 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0232573  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0971  PTS system fructose subfamily IIA component  29.81 
 
 
147 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2967  PTS system fructose subfamily IIA component  27.07 
 
 
131 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.434901  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0440  PTS system fructose subfamily IIA component  29.52 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0451  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIAB subunit  29.1 
 
 
322 aa  53.1  0.000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178007  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0252  PTS system fructose subfamily IIA component  29.91 
 
 
133 aa  52.8  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1883  PTS system, IIA component, putative  29.46 
 
 
130 aa  52  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.821865  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2412  pentitol phosphotransferase enzyme IIA component  32.26 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2021  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  30.58 
 
 
313 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2738  PTS system fructose subfamily IIA component  29.36 
 
 
133 aa  51.6  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1969  PTS system mannose-specific transporter subunit IIAB  30.65 
 
 
322 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000485794  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2030  PTS system mannose-specific IIAB component  30.65 
 
 
322 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0638718  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1973  PTS system, mannose-specific IIAB component  30.65 
 
 
322 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00730165  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1302  PTS system, mannose-specific IIAB component  30.65 
 
 
322 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000497751  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1486  PTS system mannose-specific transporter subunit IIAB  30.65 
 
 
322 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0398  PTS system fructose subfamily IIA component  33.03 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0287233  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3447  PTS system fructose subfamily IIA component  27.74 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1068  PTS system fructose subfamily IIA component  27.19 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2386  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIA subunit  29.13 
 
 
320 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2219  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  29.7 
 
 
322 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.854974  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01787  fused mannose-specific PTS enzymes: IIA component/IIB component  29.84 
 
 
323 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0965607  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1826  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  29.84 
 
 
323 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000156617  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0804  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIAB subunit  25 
 
 
326 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1983  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  29.69 
 
 
318 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1907  PTS system, mannose-specific IIAB component  29.84 
 
 
323 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000431359  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2045  PTS system, mannose-specific IIAB component  29.84 
 
 
323 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000183907  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1371  PTS system, mannose-specific IIAB component  29.84 
 
 
323 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000647863  normal  0.0229749 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1926  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  30 
 
 
322 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2083  PTS system, mannose-specific IIAB component  29.84 
 
 
323 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000444348  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01775  hypothetical protein  29.84 
 
 
323 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0856085  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2546  PTS system, mannose-specific IIAB component  29.84 
 
 
323 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000579402  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0423  PTS system fructose subfamily IIA component  26.92 
 
 
172 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00751527 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0076  PTS system fructose subfamily IIA component  35.51 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1775  PTS system, IIA component  27.88 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.714918  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0818  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  25 
 
 
326 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4293  PTS system fructose subfamily IIA component  31.43 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3249  PTS system fructose subfamily IIA component  30.77 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2813  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  26.61 
 
 
323 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.047129 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3966  PTS system fructose subfamily IIA component  31.43 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.997411  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0047  PTS system IIA component  33.96 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1176  PTS system fructose subfamily IIA component  30.84 
 
 
133 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459375  normal  0.718803 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1501  PTS system fructose subfamily IIA component  29.81 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.021335  hitchhiker  0.00841376 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1235  PTS system fructose subfamily IIA component  30.84 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1397  PTS system fructose subfamily IIA component  30.84 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.136359 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0208  PTS system IIA component  27.43 
 
 
129 aa  47  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.787809 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1992  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  32.47 
 
 
135 aa  47  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340579  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2848  PTS system fructose subfamily IIA component  29.36 
 
 
133 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707563  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1287  PTS system fructose subfamily IIA component  25.83 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178169  hitchhiker  0.00000226517 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0978  PTS system fructose subfamily IIA component  29.51 
 
 
130 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2162  PTS system fructose subfamily IIA component  29.46 
 
 
130 aa  45.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>