More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1713 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1713  ABC transporter related protein  100 
 
 
219 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  43.05 
 
 
356 aa  202  3e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4573  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  41.89 
 
 
369 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.01143 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4624  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  41.89 
 
 
369 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.102994 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4572  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  41.89 
 
 
369 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4422  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  41.89 
 
 
369 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00031053 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4487  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  41.89 
 
 
369 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03907  fused maltose transport subunit, ATP-binding component of ABC superfamily/regulatory protein  41.89 
 
 
371 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3960  ABC transporter related protein  41.89 
 
 
371 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5516  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  41.89 
 
 
371 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.301255  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03867  hypothetical protein  41.89 
 
 
371 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3994  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  41.89 
 
 
371 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.153747  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4275  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  41.89 
 
 
371 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4497  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  41.89 
 
 
371 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4587  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  41.89 
 
 
371 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  42.79 
 
 
371 aa  196  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  40.99 
 
 
365 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0240  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  40.99 
 
 
369 aa  193  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  40.99 
 
 
369 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  42.79 
 
 
363 aa  191  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0292  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  40.54 
 
 
373 aa  191  6e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.237925  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.7 
 
 
367 aa  191  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1111  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.54 
 
 
384 aa  191  8e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2765  ABC transporter related  41.26 
 
 
373 aa  191  8e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4470  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  40.54 
 
 
369 aa  191  9e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258149  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0519  ABC transporter related  44.23 
 
 
368 aa  191  9e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  42.41 
 
 
359 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3959  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.07 
 
 
357 aa  190  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0994665  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0259  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.07 
 
 
357 aa  190  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.18 
 
 
352 aa  190  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4123  ABC transporter related  41.52 
 
 
367 aa  190  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.89 
 
 
369 aa  190  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3858  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.52 
 
 
358 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3652  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.07 
 
 
357 aa  189  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  41.44 
 
 
369 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.07 
 
 
357 aa  189  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6964  ABC transporter related  40.54 
 
 
363 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06937  sugar ABC transportor ATP-binding protein  42.6 
 
 
364 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6306  ABC transporter related  40.54 
 
 
363 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0128  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.62 
 
 
357 aa  189  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.81 
 
 
369 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4829  ABC transporter-like  41.44 
 
 
366 aa  188  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0222578 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3818  ABC transporter related  40.89 
 
 
370 aa  189  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  39.64 
 
 
379 aa  188  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.89 
 
 
356 aa  188  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  41.44 
 
 
369 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.89 
 
 
356 aa  188  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.89 
 
 
356 aa  188  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  40.54 
 
 
369 aa  188  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  40.54 
 
 
368 aa  188  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  40.54 
 
 
368 aa  188  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  40.54 
 
 
355 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.89 
 
 
356 aa  188  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  40.44 
 
 
369 aa  187  7e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0120  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.18 
 
 
357 aa  187  7e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001327  maltose/maltodextrin transport ATP-binding protein MalK  39.19 
 
 
372 aa  187  8e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.704873  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  40.44 
 
 
369 aa  187  8e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  39.38 
 
 
384 aa  187  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3000  ABC transporter related  40.99 
 
 
356 aa  187  9e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.44 
 
 
358 aa  187  9e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  42.67 
 
 
343 aa  187  9e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  40.54 
 
 
369 aa  187  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6938  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.96 
 
 
359 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0063026  normal  0.624171 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  40.09 
 
 
353 aa  187  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  40.54 
 
 
375 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  40.99 
 
 
360 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03320  ABC transporter related  41.59 
 
 
368 aa  186  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  38.94 
 
 
389 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  42.6 
 
 
365 aa  186  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.09 
 
 
365 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  42.6 
 
 
365 aa  186  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3853  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.62 
 
 
356 aa  186  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.609605 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.44 
 
 
356 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  40.09 
 
 
369 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  40.09 
 
 
369 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.09 
 
 
365 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  40.09 
 
 
369 aa  186  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  39.38 
 
 
384 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  40.09 
 
 
342 aa  186  2e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  39.38 
 
 
384 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3672  ABC transporter related protein  42.34 
 
 
363 aa  186  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1693  hypothetical protein  40.62 
 
 
363 aa  186  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0699  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.54 
 
 
370 aa  186  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0714  ABC transporter related  41.89 
 
 
363 aa  186  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5254  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  43.5 
 
 
370 aa  186  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  41.52 
 
 
370 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  39.38 
 
 
384 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4439  ABC transporter related  41.07 
 
 
333 aa  185  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195171  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1531  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.1 
 
 
353 aa  185  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  41.63 
 
 
364 aa  185  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0745  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.44 
 
 
350 aa  184  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.407234  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  42.34 
 
 
366 aa  184  6e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.89 
 
 
360 aa  184  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5494  ABC transporter related  42.22 
 
 
341 aa  185  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0266048 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  41.89 
 
 
360 aa  185  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  42.34 
 
 
359 aa  184  6e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  41.33 
 
 
385 aa  185  6e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  39.38 
 
 
386 aa  184  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0696  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.44 
 
 
350 aa  184  7e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.766735  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  40.81 
 
 
368 aa  184  7e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>