More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0861 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0861  ribosomal protein S18  100 
 
 		 88 aa  180  6e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0953  30S ribosomal protein S18  70.93 
 
 		 86 aa  134  4e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1215  30S ribosomal protein S18  69.77 
 
 		 86 aa  131  3e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.30025  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0651  30S ribosomal protein S18  69.77 
 
 		 86 aa  131  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1090  30S ribosomal protein S18  69.77 
 
 		 86 aa  131  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1662  30S ribosomal protein S18  65.52 
 
 		 87 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1996  30S ribosomal protein S18  67.44 
 
 		 86 aa  127  7.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.578713  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1133  30S ribosomal protein S18  67.44 
 
 		 86 aa  124  3e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1587  30S ribosomal protein S18  66.28 
 
 		 86 aa  124  4.0000000000000003e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0243  30S ribosomal protein S18  66.28 
 
 		 87 aa  122  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.783981  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0638  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 75 aa  90.5  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000348226  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0673  30S ribosomal protein S18  63.49 
 
 		 76 aa  89.7  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00258481  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  50 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  49.23 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  51.43 
 
 		 94 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2928  ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 76 aa  78.6  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.296568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4934  30S ribosomal protein S18  53.97 
 
 		 76 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000030625  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2136  ribosomal protein S18  50.82 
 
 		 76 aa  77.4  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146821  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0313  30S ribosomal protein S18  51.72 
 
 		 75 aa  77.4  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000570063  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  49.25 
 
 		 87 aa  77  0.00000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0331  30S ribosomal protein S18  51.72 
 
 		 75 aa  76.3  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000798674  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2095  30S ribosomal protein S18  45.95 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0335  ribosomal protein S18  46.67 
 
 		 78 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.793411 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  47.69 
 
 		 86 aa  75.1  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5912  ribosomal protein S18  50.75 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  50.79 
 
 		 88 aa  74.7  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0560  30S ribosomal protein S18  49.21 
 
 		 76 aa  74.7  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.152801  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0130  30S ribosomal protein S18  55 
 
 		 75 aa  74.7  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00643171  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2843  30S ribosomal protein S18  51.39 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270954  hitchhiker  0.0000000000000931425 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1528  30S ribosomal protein S18  51.56 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.602669  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27900  SSU ribosomal protein S18P  49.23 
 
 		 86 aa  74.3  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000408904  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0666  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1477  30S ribosomal protein S18  52.17 
 
 		 92 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00897037 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7310  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 78 aa  73.9  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.879868  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2763  30S ribosomal protein S18  52.17 
 
 		 92 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9355  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 78 aa  73.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2608  30S ribosomal protein S18  50.72 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0113564  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3677  30S ribosomal protein S18  52.17 
 
 		 91 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0799478  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4505  ribosomal protein S18  43.08 
 
 		 105 aa  73.6  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0043  ribosomal protein S18  47.89 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3559  30S ribosomal protein S18  50.75 
 
 		 78 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.842484 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4520  30S ribosomal protein S18  47.14 
 
 		 78 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 		 97 aa  72  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4947  ribosomal protein S18  51.67 
 
 		 78 aa  72  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2538  ribosomal protein S18  51.67 
 
 		 74 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000029732  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3481  30S ribosomal protein S18  45.71 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.26859  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2214  ribosomal protein S18  47.62 
 
 		 75 aa  72  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4842  ribosomal protein S18  55 
 
 		 78 aa  72  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0075  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000152962  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0124  30S ribosomal protein S18  46.88 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0121  30S ribosomal protein S18  44.62 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.184225  normal  0.109156 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0135  30S ribosomal protein S18  46.88 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3400  30S ribosomal protein S18  49.21 
 
 		 90 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.612251  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0117  30S ribosomal protein S18  46.88 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3187  ribosomal protein S18  50 
 
 		 81 aa  71.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6994  ribosomal protein S18  43.42 
 
 		 88 aa  71.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1676  30S ribosomal protein S18  45.59 
 
 		 89 aa  70.9  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000141185  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2379  ribosomal protein S18  42.86 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.5089799999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4662  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 		 78 aa  71.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0850  SSU ribosomal protein S18P  49.3 
 
 		 81 aa  70.5  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4353  30S ribosomal protein S18  48.33 
 
 		 76 aa  70.5  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1113  ribosomal protein S18  46.38 
 
 		 83 aa  70.5  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.321408  normal  0.83859 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0009  30S ribosomal protein S18  45.83 
 
 		 83 aa  70.1  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.99289  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1044  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  47.37 
 
 		 79 aa  69.7  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1667  30S ribosomal protein S18  44.93 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.088074  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5066  ribosomal protein S18  48.33 
 
 		 78 aa  69.3  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.185041  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4536  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4167  ribosomal protein S18  47.76 
 
 		 85 aa  69.3  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl082  30S ribosomal protein S18  45.9 
 
 		 76 aa  69.3  0.00000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000103271  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_915  ribosomal protein S18  51.56 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043534  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3093  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 78 aa  69.3  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0103903  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3772  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 91 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000165464  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2029  30S ribosomal protein S18  50.68 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0398  30S ribosomal protein S18  41.89 
 
 		 83 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0927  30S ribosomal protein S18  51.56 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000227736  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3306  30S ribosomal protein S18  48.33 
 
 		 77 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014501  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  47.37 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0759  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000168995  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2914  SSU ribosomal protein S18P  41.33 
 
 		 74 aa  68.2  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000742104  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  44.12 
 
 		 80 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2592  30S ribosomal protein S18  43.48 
 
 		 83 aa  68.6  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  45.45 
 
 		 78 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2460  SSU ribosomal protein S18P  47.69 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168294 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2131  30S ribosomal protein S18  48.33 
 
 		 78 aa  68.6  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4738  ribosomal protein S18  48.39 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23340  ribosomal protein S18  49.21 
 
 		 70 aa  67.8  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000096386  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0652  ribosomal protein S18  49.21 
 
 		 81 aa  68.2  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2008  30S ribosomal protein S18  44 
 
 		 83 aa  68.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.922346  normal  0.649382 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1218  SSU ribosomal protein S18P  47.06 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  42.65 
 
 		 80 aa  67.4  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  42.65 
 
 		 80 aa  67.4  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  42.86 
 
 		 80 aa  67  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2654  30S ribosomal protein S18  42.86 
 
 		 80 aa  67  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000144955  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  42.5 
 
 		 81 aa  67  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1351  30S ribosomal protein S18  47.95 
 
 		 87 aa  66.6  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0740  ribosomal protein S18  42.03 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0452122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5744  30S ribosomal protein S18  46.15 
 
 		 84 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.241708 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10054  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 84 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000781394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5457  30S ribosomal protein S18  46.15 
 
 		 84 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18106  normal  0.0124957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>