More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0953 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0953  30S ribosomal protein S18  100 
 
 		 86 aa  177  5.999999999999999e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1215  30S ribosomal protein S18  93.02 
 
 		 86 aa  169  1e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.30025  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0651  30S ribosomal protein S18  93.02 
 
 		 86 aa  169  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1090  30S ribosomal protein S18  93.02 
 
 		 86 aa  169  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1587  30S ribosomal protein S18  88.37 
 
 		 86 aa  161  3e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1133  30S ribosomal protein S18  88.37 
 
 		 86 aa  158  2e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1996  30S ribosomal protein S18  86.05 
 
 		 86 aa  158  3e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.578713  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0243  30S ribosomal protein S18  82.56 
 
 		 87 aa  148  3e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.783981  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0861  ribosomal protein S18  70.93 
 
 		 88 aa  134  4e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1662  30S ribosomal protein S18  65.12 
 
 		 87 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0638  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  85.5  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000348226  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0673  30S ribosomal protein S18  56.52 
 
 		 76 aa  82.8  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00258481  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  59.38 
 
 		 80 aa  82  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  51.43 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  57.81 
 
 		 80 aa  81.3  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3481  30S ribosomal protein S18  50.75 
 
 		 98 aa  81.3  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.26859  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  57.81 
 
 		 80 aa  81.3  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  52.86 
 
 		 94 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 78 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2008  30S ribosomal protein S18  49.32 
 
 		 83 aa  78.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.922346  normal  0.649382 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 74 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  56.25 
 
 		 77 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  56.25 
 
 		 77 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  56.25 
 
 		 77 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  56.25 
 
 		 77 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  56.25 
 
 		 77 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  56.25 
 
 		 77 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  56.25 
 
 		 77 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  56.25 
 
 		 77 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  56.25 
 
 		 77 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  56.25 
 
 		 77 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  56.25 
 
 		 77 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1667  30S ribosomal protein S18  49.25 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.088074  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 78 aa  76.6  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0331  30S ribosomal protein S18  56.9 
 
 		 75 aa  76.6  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000798674  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4934  30S ribosomal protein S18  53.97 
 
 		 76 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000030625  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl082  30S ribosomal protein S18  52.46 
 
 		 76 aa  76.6  0.0000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000103271  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2928  ribosomal protein S18  53.97 
 
 		 76 aa  76.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.296568  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1113  ribosomal protein S18  51.52 
 
 		 83 aa  75.5  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.321408  normal  0.83859 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09983  ribosomal protein S18  49.23 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.596989  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0924  ribosomal protein S18  52.38 
 
 		 74 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.373301  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  52.63 
 
 		 79 aa  75.1  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  47.69 
 
 		 84 aa  75.1  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0313  30S ribosomal protein S18  53.45 
 
 		 75 aa  73.9  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000570063  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0740  ribosomal protein S18  46.27 
 
 		 87 aa  73.9  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0452122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  52.63 
 
 		 79 aa  73.9  0.0000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0398  30S ribosomal protein S18  45.07 
 
 		 83 aa  73.6  0.0000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27900  SSU ribosomal protein S18P  48.65 
 
 		 86 aa  73.2  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000408904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  45.71 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2592  30S ribosomal protein S18  48.48 
 
 		 83 aa  73.2  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1528  30S ribosomal protein S18  48.44 
 
 		 90 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.602669  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 81 aa  73.2  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0075  30S ribosomal protein S18  45.71 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000152962  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  47.69 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1218  SSU ribosomal protein S18P  53.97 
 
 		 91 aa  72  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1641  30S ribosomal protein S18  50.79 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0283547  normal  0.0346788 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1781  30S ribosomal protein S18  53.97 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.708911  normal  0.881884 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1809  30S ribosomal protein S18  53.97 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356271  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5912  ribosomal protein S18  48.48 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2214  ribosomal protein S18  49.21 
 
 		 75 aa  72  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1788  30S ribosomal protein S18  52.38 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685938  normal  0.111131 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2379  ribosomal protein S18  45.71 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.5089799999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3667  30S ribosomal protein S18  47.62 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0312817  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1338  30S ribosomal protein S18  49.21 
 
 		 76 aa  71.2  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0621321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  49.21 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2454  30S ribosomal protein S18  52.38 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0427357  normal  0.323715 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1031  30S ribosomal protein S18  49.21 
 
 		 76 aa  71.2  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4662  30S ribosomal protein S18  50.75 
 
 		 78 aa  71.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2136  ribosomal protein S18  49.18 
 
 		 76 aa  70.9  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146821  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  46.15 
 
 		 86 aa  70.9  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3062  30S ribosomal protein S18  52.38 
 
 		 75 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382795  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6994  ribosomal protein S18  43.48 
 
 		 88 aa  70.5  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1402  30S ribosomal protein S18  52.38 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27665  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2414  30S ribosomal protein S18  52.38 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.398519  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2289  30S ribosomal protein S18  52.38 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.189033  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1893  30S ribosomal protein S18  52.38 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.910904  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2181  30S ribosomal protein S18  52.38 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1402  30S ribosomal protein S18  52.38 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.494221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1166  30S ribosomal protein S18  52.38 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329961  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2250  30S ribosomal protein S18  52.38 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.231321  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6207  30S ribosomal protein S18  52.38 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3772  30S ribosomal protein S18  58.49 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000165464  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1872  30S ribosomal protein S18  52.38 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582114  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0004  30S ribosomal protein S18  52.38 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0418254  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1895  30S ribosomal protein S18  52.38 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00156223  hitchhiker  0.0000000574659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5172  30S ribosomal protein S18  52.38 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3400  30S ribosomal protein S18  46.03 
 
 		 90 aa  70.1  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.612251  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_002620  TC0185  30S ribosomal protein S18  46.38 
 
 		 81 aa  70.1  0.00000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.390146  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1044  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0596  30S ribosomal protein S18  55.17 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9355  30S ribosomal protein S18  48.53 
 
 		 78 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0656  30S ribosomal protein S18  52.38 
 
 		 74 aa  69.7  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0430  30S ribosomal protein S18  50.79 
 
 		 84 aa  69.7  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.69422 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0009  30S ribosomal protein S18  55.36 
 
 		 78 aa  69.7  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000183869  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4536  30S ribosomal protein S18  47.95 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2588  30S ribosomal protein S18  52.38 
 
 		 76 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.752864 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  45.71 
 
 		 80 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0009  ribosomal protein S18  55.36 
 
 		 77 aa  70.1  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000069363  hitchhiker  0.000000000101757 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1968  30S ribosomal protein S18  55.36 
 
 		 94 aa  69.7  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.906239  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0927  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000227736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>