148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3398 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3398  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
251 aa  521  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0941  DSBA oxidoreductase  97.61 
 
 
251 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0964  DSBA oxidoreductase  97.61 
 
 
251 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0975  DSBA oxidoreductase  96.41 
 
 
251 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3036  DSBA oxidoreductase  81.6 
 
 
250 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3063  DSBA oxidoreductase  81.27 
 
 
250 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0909  DSBA oxidoreductase  81.27 
 
 
250 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.322107  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3718  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  82.07 
 
 
250 aa  432  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0874  DSBA oxidoreductase  84.86 
 
 
250 aa  427  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117334  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3441  DSBA oxidoreductase  71.89 
 
 
218 aa  333  1e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2934  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  67.95 
 
 
248 aa  324  1e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0782284 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3787  DsbA oxidoreductase  71.1 
 
 
249 aa  322  3e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0818  DSBA oxidoreductase  65.14 
 
 
218 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0796  DSBA oxidoreductase  66.82 
 
 
223 aa  308  8e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0686  DSBA oxidoreductase  68.81 
 
 
220 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.355761 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  35 
 
 
203 aa  142  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  34 
 
 
203 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  34.33 
 
 
203 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  34.33 
 
 
203 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  36.27 
 
 
205 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4193  DsbA oxidoreductase  35.05 
 
 
203 aa  135  8e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000377702  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.83 
 
 
202 aa  133  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  34.18 
 
 
203 aa  133  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.18 
 
 
204 aa  129  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3958  DSBA oxidoreductase  33.68 
 
 
202 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4060  DSBA oxidoreductase  33.68 
 
 
202 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154818  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4035  DSBA oxidoreductase  33.68 
 
 
202 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4153  DSBA oxidoreductase  33.68 
 
 
202 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  33.03 
 
 
203 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  32.64 
 
 
202 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  29.23 
 
 
203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.14 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  32.09 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.24 
 
 
211 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.52 
 
 
200 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000576  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.49 
 
 
199 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0848173  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  29.3 
 
 
200 aa  96.3  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30 
 
 
200 aa  94  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4518  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.43 
 
 
207 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.92 
 
 
207 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03648  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.55 
 
 
210 aa  89.7  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4165  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.41 
 
 
207 aa  89  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0407831  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4889  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.16 
 
 
207 aa  88.2  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000138937  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03746  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.47 
 
 
208 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4126  DSBA oxidoreductase  26.47 
 
 
208 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4155  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.47 
 
 
208 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00383633  hitchhiker  0.0000667168 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03695  hypothetical protein  26.47 
 
 
208 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459554  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4332  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.47 
 
 
208 aa  86.7  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5300  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.47 
 
 
208 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.038843  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  27.57 
 
 
207 aa  86.7  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4083  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.47 
 
 
208 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000727288  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4378  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.47 
 
 
208 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000586255  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4241  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.47 
 
 
208 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0131889  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3575  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
207 aa  85.9  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4104  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.94 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00283227  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4278  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.45 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.744084  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4324  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.45 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.45 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4207  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.45 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195163  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4385  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.45 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25464  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4196  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.96 
 
 
207 aa  82  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.693505  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0020  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.96 
 
 
207 aa  82  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000268168  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0022  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.96 
 
 
207 aa  82  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00595683  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0308  protein disulfide-isomerase (thiol:disulfide interchange protein)  31.16 
 
 
202 aa  77.4  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3968  periplasmic protein disulfide isomerase I  25.33 
 
 
207 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000322053  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4348  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.49 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0257  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.11 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.901513  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3546  disulfide isomerase  24.22 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.504028 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3374  disulfide isomerase  24.22 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3451  disulfide isomerase  24.22 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3444  disulfide isomerase  24.22 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.923354  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3379  disulfide isomerase  24.22 
 
 
223 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.996727 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0234  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  29.3 
 
 
202 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1521  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  28.37 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0606575  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3334  DsbA family thioredoxin  25.79 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1380  DSBA oxidoreductase  23.15 
 
 
221 aa  64.7  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172007  normal  0.0174557 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0983  DSBA oxidoreductase  24.86 
 
 
213 aa  63.9  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1438  DSBA oxidoreductase  23.18 
 
 
220 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.44353 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1693  DSBA oxidoreductase  28.17 
 
 
210 aa  62.4  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2860  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  26.61 
 
 
207 aa  60.5  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4228  DSBA oxidoreductase  25.75 
 
 
221 aa  61.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  22.71 
 
 
211 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2360  DSBA oxidoreductase  25.25 
 
 
207 aa  59.3  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0137  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  24.43 
 
 
204 aa  58.5  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2373  DSBA oxidoreductase  25.98 
 
 
210 aa  58.9  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.563434  hitchhiker  0.0000192462 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0122  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  24.43 
 
 
204 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  22.27 
 
 
211 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  25.81 
 
 
207 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  25.93 
 
 
207 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  22.22 
 
 
206 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1742  DsbA oxidoreductase  25.48 
 
 
210 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0147318  hitchhiker  0.0000164323 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2675  DSBA oxidoreductase  26.61 
 
 
206 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26469  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2754  DSBA oxidoreductase  26.61 
 
 
206 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1709  DSBA oxidoreductase  27.4 
 
 
206 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000128483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2640  DSBA oxidoreductase  27.4 
 
 
206 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1147  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.29 
 
 
219 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09670  thioredoxin-like fold protein  23.5 
 
 
242 aa  56.6  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1573  DSBA oxidoreductase  26.51 
 
 
217 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0077  hypothetical protein  22.33 
 
 
293 aa  55.5  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.453985  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0463  DSBA oxidoreductase  22.61 
 
 
215 aa  55.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0780144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>