167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0983 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0983  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
213 aa  439  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  46.77 
 
 
207 aa  210  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3968  periplasmic protein disulfide isomerase I  45.77 
 
 
207 aa  209  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000322053  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4518  periplasmic protein disulfide isomerase I  46.27 
 
 
207 aa  207  8e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4889  periplasmic protein disulfide isomerase I  46.19 
 
 
207 aa  206  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000138937  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4165  periplasmic protein disulfide isomerase I  43.28 
 
 
207 aa  201  5e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0407831  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0022  periplasmic protein disulfide isomerase I  45.73 
 
 
207 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00595683  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4196  periplasmic protein disulfide isomerase I  45.73 
 
 
207 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.693505  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0020  periplasmic protein disulfide isomerase I  45.73 
 
 
207 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000268168  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  46.77 
 
 
207 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4385  periplasmic protein disulfide isomerase I  46.77 
 
 
207 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25464  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4278  periplasmic protein disulfide isomerase I  46.77 
 
 
207 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.744084  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4324  periplasmic protein disulfide isomerase I  46.77 
 
 
207 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4207  periplasmic protein disulfide isomerase I  46.77 
 
 
207 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195163  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03746  periplasmic protein disulfide isomerase I  44.95 
 
 
208 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4126  DSBA oxidoreductase  44.95 
 
 
208 aa  189  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4155  periplasmic protein disulfide isomerase I  44.95 
 
 
208 aa  189  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00383633  hitchhiker  0.0000667168 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4332  periplasmic protein disulfide isomerase I  44.95 
 
 
208 aa  189  4e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03695  hypothetical protein  44.95 
 
 
208 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459554  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5300  periplasmic protein disulfide isomerase I  44.95 
 
 
208 aa  189  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.038843  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4104  periplasmic protein disulfide isomerase I  41.35 
 
 
207 aa  188  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00283227  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4083  periplasmic protein disulfide isomerase I  44.95 
 
 
208 aa  189  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000727288  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4378  periplasmic protein disulfide isomerase I  44.95 
 
 
208 aa  189  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000586255  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4241  periplasmic protein disulfide isomerase I  44.44 
 
 
208 aa  187  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0131889  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0257  thiol:disulfide interchange protein DsbA  40.91 
 
 
223 aa  174  8e-43  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.901513  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4675  thiol:disulfide interchange protein DsbA  38.61 
 
 
219 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4888  hypothetical protein  40.1 
 
 
217 aa  148  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826795 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0308  protein disulfide-isomerase (thiol:disulfide interchange protein)  37.91 
 
 
202 aa  138  4.999999999999999e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.1 
 
 
202 aa  121  8e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  32.39 
 
 
203 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  34.09 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  32.54 
 
 
203 aa  109  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.39 
 
 
202 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  30.46 
 
 
200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  31 
 
 
200 aa  108  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4193  DsbA oxidoreductase  32.79 
 
 
203 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000377702  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 
203 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  30.11 
 
 
203 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  30.11 
 
 
203 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  31.95 
 
 
205 aa  105  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  29.5 
 
 
200 aa  104  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3958  DSBA oxidoreductase  32.54 
 
 
202 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4153  DSBA oxidoreductase  32.54 
 
 
202 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4060  DSBA oxidoreductase  32.54 
 
 
202 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154818  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4035  DSBA oxidoreductase  32.54 
 
 
202 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  32.14 
 
 
202 aa  101  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.37 
 
 
204 aa  100  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 
203 aa  99  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.35 
 
 
200 aa  98.2  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4348  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.96 
 
 
214 aa  96.7  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  26.02 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.95 
 
 
211 aa  92  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000576  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.37 
 
 
199 aa  92  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0848173  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03648  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.67 
 
 
210 aa  91.7  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3575  DSBA oxidoreductase  27.03 
 
 
207 aa  89  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0686  DSBA oxidoreductase  27.04 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.355761 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.57 
 
 
211 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  27.01 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0874  DSBA oxidoreductase  27.69 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117334  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0909  DSBA oxidoreductase  27.41 
 
 
250 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.322107  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0796  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3063  DSBA oxidoreductase  27.41 
 
 
250 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0158  DSBA oxidoreductase  28.93 
 
 
216 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.699641  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3718  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  24.55 
 
 
250 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.03 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2934  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  26.51 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0782284 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3036  DSBA oxidoreductase  25.23 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3787  DsbA oxidoreductase  26.02 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  28.49 
 
 
211 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0818  DSBA oxidoreductase  27.94 
 
 
218 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0941  DSBA oxidoreductase  24.62 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  27.96 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3398  DSBA oxidoreductase  24.62 
 
 
251 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  27.81 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0975  DSBA oxidoreductase  24.62 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  27.42 
 
 
210 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0077  hypothetical protein  25.29 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.453985  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1147  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.04 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0964  DSBA oxidoreductase  25.12 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  27.96 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.74 
 
 
214 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0052  DSBA oxidoreductase  27.04 
 
 
213 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0524  DSBA oxidoreductase  28.66 
 
 
201 aa  64.3  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.716965 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0234  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  26.94 
 
 
202 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0002  integrase/recombinase  26.54 
 
 
218 aa  62.4  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000442871  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1693  DSBA oxidoreductase  25.12 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01990  Thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.46 
 
 
214 aa  60.8  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3441  DSBA oxidoreductase  22.96 
 
 
218 aa  60.5  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2110  hypothetical protein  28.57 
 
 
213 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3568  DSBA oxidoreductase  27.37 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1364  DSBA oxidoreductase  24.5 
 
 
214 aa  56.2  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1521  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  23.96 
 
 
185 aa  55.1  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0606575  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2850  DSBA oxidoreductase  23.7 
 
 
211 aa  54.7  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302061  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2373  DSBA oxidoreductase  27.67 
 
 
210 aa  53.1  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.563434  hitchhiker  0.0000192462 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0693  DSBA oxidoreductase  23.7 
 
 
260 aa  52.4  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33027  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0463  DSBA oxidoreductase  26.74 
 
 
215 aa  52  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0780144  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0050  DSBA oxidoreductase  24 
 
 
207 aa  52  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0556342  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0780  thiol:disulfide interchange protein  24.16 
 
 
260 aa  52  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0345  DSBA oxidoreductase  24.72 
 
 
216 aa  52  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0334  DSBA oxidoreductase  24.72 
 
 
216 aa  52  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.227367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>