146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1380 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1380  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 221 aa  443  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172007  normal  0.0174557 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1438  DSBA oxidoreductase  94.52 
 
 		 220 aa  418  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.44353 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3451  disulfide isomerase  59.47 
 
 		 223 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3374  disulfide isomerase  59.47 
 
 		 223 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3546  disulfide isomerase  59.47 
 
 		 223 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.504028 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3379  disulfide isomerase  59.47 
 
 		 223 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.996727 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3444  disulfide isomerase  59.47 
 
 		 223 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.923354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0002  integrase/recombinase  61.26 
 
 		 218 aa  255  3e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000442871  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1147  thiol:disulfide interchange protein DsbA  61.75 
 
 		 219 aa  255  4e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3334  DsbA family thioredoxin  60.37 
 
 		 222 aa  251  5.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0433  disulfide isomerase  53.57 
 
 		 228 aa  217  1e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.529354  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2110  hypothetical protein  46.7 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0856  disulfide isomerase  43.95 
 
 		 219 aa  175  4e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3871  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  40.47 
 
 		 203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0951  thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.7 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0234  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  39.51 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.7 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.325546  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4023  DSBA oxidoreductase  39.15 
 
 		 203 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4028  DSBA oxidoreductase  39.15 
 
 		 203 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1013  thiol:disulfide interchange protein DsbA  34.4 
 
 		 220 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000248495  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0559  thiol:disulfide interchange protein, DsbA family  34.3 
 
 		 216 aa  128  7.000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1665  disulfide isomerase  32.02 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3999  putative disulfide isomerase  33.33 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.136528 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1021  putative thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.43 
 
 		 223 aa  101  8e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00252175  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0883  thiol:disulfide interchange protein DsbA, putative  29.95 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0954  thiol:disulfide interchange protein DsbA, putative  29.47 
 
 		 223 aa  95.1  7e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.164815  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  28.42 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.87 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  28.95 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.81 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  28.87 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4060  DSBA oxidoreductase  28.95 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154818  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4035  DSBA oxidoreductase  28.95 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4153  DSBA oxidoreductase  28.95 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3958  DSBA oxidoreductase  28.95 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  29.02 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  27.84 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  27.84 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4193  DsbA oxidoreductase  27.89 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000377702  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  27.41 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3063  DSBA oxidoreductase  24.31 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0909  DSBA oxidoreductase  24.31 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.322107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  27.37 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4889  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.19 
 
 		 207 aa  72  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000138937  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  26.32 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3036  DSBA oxidoreductase  26.54 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2373  DSBA oxidoreductase  28.12 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.563434  hitchhiker  0.0000192462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0874  DSBA oxidoreductase  23.29 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117334  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3718  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  25.68 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000576  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.71 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0848173  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.88 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.1 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0257  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.17 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.901513  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3398  DSBA oxidoreductase  23.15 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0964  DSBA oxidoreductase  23.15 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2675  DSBA oxidoreductase  27.86 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26469  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.68 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  26.7 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2754  DSBA oxidoreductase  27.86 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.27 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.52 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0941  DSBA oxidoreductase  22.69 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2640  DSBA oxidoreductase  27.86 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1709  DSBA oxidoreductase  27.86 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128483 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1693  DSBA oxidoreductase  28.23 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1573  DSBA oxidoreductase  27.78 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  27.44 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  28.28 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  28.28 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4518  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.83 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4165  periplasmic protein disulfide isomerase I  24.63 
 
 		 207 aa  62  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0407831  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.57 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  25.94 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2860  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  26.64 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  27.8 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4278  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.06 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.744084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4324  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.06 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4385  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.06 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4207  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.06 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.06 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0975  DSBA oxidoreductase  23 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4104  periplasmic protein disulfide isomerase I  25.53 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00283227  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0020  periplasmic protein disulfide isomerase I  24.88 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000268168  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0022  periplasmic protein disulfide isomerase I  24.88 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00595683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4196  periplasmic protein disulfide isomerase I  24.88 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.693505  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3968  periplasmic protein disulfide isomerase I  24.04 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000322053  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0092  DSBA oxidoreductase  24.38 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  26.94 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.15 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  25.38 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2934  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  22.93 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0782284 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  23.96 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4228  DSBA oxidoreductase  25.5 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4126  DSBA oxidoreductase  26.13 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03695  hypothetical protein  26.13 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459554  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4241  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.13 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0131889  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4332  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.13 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4155  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.13 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00383633  hitchhiker  0.0000667168 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4083  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.13 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000727288  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4378  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.13 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000586255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>