136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0559 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0559  thiol:disulfide interchange protein, DsbA family  100 
 
 		 216 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbA  54.84 
 
 		 220 aa  239  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.325546  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0951  thiol:disulfide interchange protein DsbA  54.38 
 
 		 220 aa  238  6.999999999999999e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1013  thiol:disulfide interchange protein DsbA  52.53 
 
 		 220 aa  230  1e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000248495  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0954  thiol:disulfide interchange protein DsbA, putative  51.08 
 
 		 223 aa  202  4e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.164815  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0883  thiol:disulfide interchange protein DsbA, putative  47.34 
 
 		 223 aa  202  4e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1021  putative thiol:disulfide interchange protein DsbA  50.54 
 
 		 223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00252175  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1380  DSBA oxidoreductase  34.3 
 
 		 221 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172007  normal  0.0174557 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1438  DSBA oxidoreductase  33.64 
 
 		 220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.44353 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0002  integrase/recombinase  33.8 
 
 		 218 aa  125  5e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000442871  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1665  disulfide isomerase  31.46 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1147  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.65 
 
 		 219 aa  123  3e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0433  disulfide isomerase  30.97 
 
 		 228 aa  112  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.529354  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3546  disulfide isomerase  30.33 
 
 		 223 aa  111  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.504028 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3374  disulfide isomerase  30.33 
 
 		 223 aa  111  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3451  disulfide isomerase  30.33 
 
 		 223 aa  111  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3444  disulfide isomerase  30.33 
 
 		 223 aa  111  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.923354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3379  disulfide isomerase  29.52 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.996727 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3334  DsbA family thioredoxin  28.64 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2110  hypothetical protein  32.7 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0856  disulfide isomerase  32.72 
 
 		 219 aa  108  6e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4023  DSBA oxidoreductase  27.67 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4028  DSBA oxidoreductase  28.71 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3871  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  25.12 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  30.85 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4278  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.57 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.744084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.57 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4385  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.57 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0234  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  25.38 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4324  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.57 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4207  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.57 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0020  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.34 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000268168  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0022  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.34 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00595683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4196  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.34 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.693505  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4889  periplasmic protein disulfide isomerase I  25.55 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000138937  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03746  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.18 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4126  DSBA oxidoreductase  28.18 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5300  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.18 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.038843  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03695  hypothetical protein  28.18 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459554  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4332  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.18 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4083  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.18 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000727288  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4378  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.18 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000586255  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4155  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.18 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00383633  hitchhiker  0.0000667168 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4518  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.08 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4241  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.18 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0131889  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4104  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.41 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00283227  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3968  periplasmic protein disulfide isomerase I  25.89 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000322053  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1573  DSBA oxidoreductase  27.18 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2860  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  26.21 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4165  periplasmic protein disulfide isomerase I  25.67 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0407831  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  26.7 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  26.7 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.73 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  28.84 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  28.37 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.49 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3036  DSBA oxidoreductase  25.11 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0257  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.98 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.901513  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0158  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.699641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0092  DSBA oxidoreductase  23.96 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  27.62 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0898  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  24.75 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2167  DSBA oxidoreductase  25.52 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.07 
 
 		 200 aa  53.5  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3568  DSBA oxidoreductase  27.88 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.17 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2784  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.91 
 
 		 216 aa  51.6  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.957137  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1709  DSBA oxidoreductase  25.24 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2640  DSBA oxidoreductase  25.24 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2454  DSBA oxidoreductase  23.62 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3404  DSBA oxidoreductase  23.88 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.766013  normal  0.487769 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3718  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  23 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  26.05 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2360  DSBA oxidoreductase  25.56 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2675  DSBA oxidoreductase  25.24 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26469  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2754  DSBA oxidoreductase  25.24 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0308  protein disulfide-isomerase (thiol:disulfide interchange protein)  27.51 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3999  putative disulfide isomerase  25.95 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.136528 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0874  DSBA oxidoreductase  22.06 
 
 		 250 aa  48.9  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117334  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  26.05 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  27.4 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.12 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4888  hypothetical protein  24.61 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826795 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1742  DsbA oxidoreductase  27.44 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0147318  hitchhiker  0.0000164323 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  25.13 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  23.53 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3063  DSBA oxidoreductase  25.63 
 
 		 250 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0909  DSBA oxidoreductase  25.63 
 
 		 250 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.322107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  24.76 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0983  DSBA oxidoreductase  26.86 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3787  DsbA oxidoreductase  24.63 
 
 		 249 aa  45.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2373  DSBA oxidoreductase  26.89 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.563434  hitchhiker  0.0000192462 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0796  DSBA oxidoreductase  28.24 
 
 		 223 aa  45.8  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  25.13 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0086  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.56 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2934  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  24.5 
 
 		 248 aa  45.4  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0782284 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3097  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.56 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1999  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.56 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684259  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0408  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.56 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0428  Thiol:disulfide interchange protein dsbA precursor  26.56 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>