144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3063 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3063  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 250 aa  518  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0909  DSBA oxidoreductase  99.6 
 
 		 250 aa  518  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.322107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0874  DSBA oxidoreductase  95.2 
 
 		 250 aa  477  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117334  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3718  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  90 
 
 		 250 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3036  DSBA oxidoreductase  86.35 
 
 		 250 aa  462  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0964  DSBA oxidoreductase  81.27 
 
 		 251 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3398  DSBA oxidoreductase  81.27 
 
 		 251 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0941  DSBA oxidoreductase  80.88 
 
 		 251 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0975  DSBA oxidoreductase  79.68 
 
 		 251 aa  430  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2934  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  69.23 
 
 		 248 aa  332  2e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0782284 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3441  DSBA oxidoreductase  69.59 
 
 		 218 aa  321  8e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0818  DSBA oxidoreductase  66.51 
 
 		 218 aa  318  5e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3787  DsbA oxidoreductase  68.35 
 
 		 249 aa  311  3.9999999999999997e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0686  DSBA oxidoreductase  68.35 
 
 		 220 aa  298  5e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.355761 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0796  DSBA oxidoreductase  63.18 
 
 		 223 aa  292  4e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  36 
 
 		 203 aa  149  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  34.5 
 
 		 203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  34.33 
 
 		 203 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  34.33 
 
 		 203 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  34.69 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4193  DsbA oxidoreductase  33.94 
 
 		 203 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000377702  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  35.75 
 
 		 205 aa  138  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.83 
 
 		 202 aa  137  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.18 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3958  DSBA oxidoreductase  34.72 
 
 		 202 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4060  DSBA oxidoreductase  34.72 
 
 		 202 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154818  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  33.68 
 
 		 202 aa  133  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4035  DSBA oxidoreductase  34.72 
 
 		 202 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4153  DSBA oxidoreductase  34.72 
 
 		 202 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  30.26 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  31.47 
 
 		 203 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.68 
 
 		 202 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.24 
 
 		 211 aa  105  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  29.95 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000576  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.84 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0848173  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.55 
 
 		 200 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03648  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.94 
 
 		 210 aa  95.5  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.82 
 
 		 200 aa  94.7  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4165  periplasmic protein disulfide isomerase I  31.86 
 
 		 207 aa  94.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0407831  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4889  periplasmic protein disulfide isomerase I  30.1 
 
 		 207 aa  92  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000138937  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  28.38 
 
 		 200 aa  92  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03746  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.92 
 
 		 208 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4126  DSBA oxidoreductase  28.92 
 
 		 208 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5300  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.92 
 
 		 208 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.038843  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4332  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.92 
 
 		 208 aa  90.9  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03695  hypothetical protein  28.92 
 
 		 208 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459554  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4083  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.92 
 
 		 208 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000727288  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4378  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.92 
 
 		 208 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000586255  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4155  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.92 
 
 		 208 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00383633  hitchhiker  0.0000667168 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4241  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.92 
 
 		 208 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0131889  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  28.04 
 
 		 207 aa  90.5  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3575  DSBA oxidoreductase  27.85 
 
 		 207 aa  88.2  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.92 
 
 		 207 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0308  protein disulfide-isomerase (thiol:disulfide interchange protein)  33.17 
 
 		 202 aa  86.7  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0020  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.8 
 
 		 207 aa  86.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000268168  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0022  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.8 
 
 		 207 aa  86.7  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00595683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4196  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.8 
 
 		 207 aa  86.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.693505  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4518  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.94 
 
 		 207 aa  85.5  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4278  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.13 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.744084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4207  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.13 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4324  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.13 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.13 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4385  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.13 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4104  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.67 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00283227  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3968  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.22 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000322053  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4348  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.95 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1380  DSBA oxidoreductase  24.31 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172007  normal  0.0174557 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0983  DSBA oxidoreductase  28.18 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3374  disulfide isomerase  24.66 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3451  disulfide isomerase  24.66 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0257  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.11 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.901513  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3546  disulfide isomerase  24.66 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.504028 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3444  disulfide isomerase  24.66 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.923354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3379  disulfide isomerase  24.66 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.996727 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1438  DSBA oxidoreductase  24.17 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.44353 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3334  DsbA family thioredoxin  27.15 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1521  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  28.23 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0606575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  24.23 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0234  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  27.91 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2860  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  25.79 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  25.57 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  25.57 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2842  DSBA oxidoreductase  26.9 
 
 		 208 aa  62  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2360  DSBA oxidoreductase  26.13 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1573  DSBA oxidoreductase  25.69 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2675  DSBA oxidoreductase  25.11 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26469  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1147  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.3 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1693  DSBA oxidoreductase  26.29 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2754  DSBA oxidoreductase  25.11 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0143  DSBA oxidoreductase  27.15 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0002  integrase/recombinase  25.57 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000442871  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0898  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  28.5 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1709  DSBA oxidoreductase  26.58 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2640  DSBA oxidoreductase  26.58 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2373  DSBA oxidoreductase  25.62 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.563434  hitchhiker  0.0000192462 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0135  DSBA oxidoreductase  26.32 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3405  DSBA oxidoreductase  26.42 
 
 		 275 aa  57  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05391  hypothetical protein  30.64 
 
 		 210 aa  57  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09670  thioredoxin-like fold protein  23.38 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0137  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  23.18 
 
 		 204 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>