74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3999 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3999  putative disulfide isomerase  100 
 
 		 200 aa  403  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.136528 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0234  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  41.03 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3379  disulfide isomerase  37.14 
 
 		 223 aa  111  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.996727 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3546  disulfide isomerase  37.14 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.504028 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3374  disulfide isomerase  37.14 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3444  disulfide isomerase  37.14 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.923354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3451  disulfide isomerase  37.14 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3334  DsbA family thioredoxin  38.03 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3871  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  36.06 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4028  DSBA oxidoreductase  36.06 
 
 		 203 aa  105  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4023  DSBA oxidoreductase  35.1 
 
 		 203 aa  105  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1380  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 221 aa  102  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172007  normal  0.0174557 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1147  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.33 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1438  DSBA oxidoreductase  32.77 
 
 		 220 aa  101  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.44353 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0002  integrase/recombinase  33.16 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000442871  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2110  hypothetical protein  33.71 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0433  disulfide isomerase  30.84 
 
 		 228 aa  92.4  4e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.529354  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0856  disulfide isomerase  31.86 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3968  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.79 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000322053  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.29 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4889  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.41 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000138937  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4518  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.23 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  27.67 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4207  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.63 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4324  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.63 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4278  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.63 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.744084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.63 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  28.93 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4385  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.63 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0020  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.27 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000268168  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4196  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.27 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.693505  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0022  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.27 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00595683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  28.24 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.42 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  24.4 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  26.42 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4165  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.14 
 
 		 207 aa  62  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0407831  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0883  thiol:disulfide interchange protein DsbA, putative  29.95 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0954  thiol:disulfide interchange protein DsbA, putative  30.32 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.164815  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1021  putative thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.32 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00252175  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4104  periplasmic protein disulfide isomerase I  25.63 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00283227  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  25.79 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  25.79 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4193  DsbA oxidoreductase  26.42 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000377702  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.58 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3958  DSBA oxidoreductase  26.42 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4035  DSBA oxidoreductase  26.42 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4060  DSBA oxidoreductase  26.42 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154818  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4153  DSBA oxidoreductase  26.42 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0951  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.72 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  27.88 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.36 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  24.53 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.72 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.325546  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03695  hypothetical protein  23 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459554  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5300  periplasmic protein disulfide isomerase I  23 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.038843  normal  0.694911 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4126  DSBA oxidoreductase  23 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03746  periplasmic protein disulfide isomerase I  23 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4332  periplasmic protein disulfide isomerase I  23 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4155  periplasmic protein disulfide isomerase I  23 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00383633  hitchhiker  0.0000667168 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4378  periplasmic protein disulfide isomerase I  23 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000586255  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4083  periplasmic protein disulfide isomerase I  23 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000727288  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1013  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.68 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000248495  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4241  periplasmic protein disulfide isomerase I  22.5 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0131889  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0559  thiol:disulfide interchange protein, DsbA family  25.95 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  25.87 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3441  DSBA oxidoreductase  22.12 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3398  DSBA oxidoreductase  24.17 
 
 		 251 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  22.81 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  22.97 
 
 		 207 aa  42.4  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0463  DSBA oxidoreductase  26.25 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0780144  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1665  disulfide isomerase  26.39 
 
 		 223 aa  42  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  24.4 
 
 		 200 aa  41.6  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.63 
 
 		 211 aa  41.6  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>