123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4888 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A4888  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826795 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4675  thiol:disulfide interchange protein DsbA  50.86 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0983  DSBA oxidoreductase  42.29 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4889  periplasmic protein disulfide isomerase I  38.32 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000138937  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0020  periplasmic protein disulfide isomerase I  34 
 
 		 207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000268168  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0022  periplasmic protein disulfide isomerase I  34 
 
 		 207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00595683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4196  periplasmic protein disulfide isomerase I  34 
 
 		 207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.693505  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  38.65 
 
 		 207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3968  periplasmic protein disulfide isomerase I  38.69 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000322053  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4385  periplasmic protein disulfide isomerase I  38.32 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4207  periplasmic protein disulfide isomerase I  38.32 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4324  periplasmic protein disulfide isomerase I  38.32 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  38.32 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4278  periplasmic protein disulfide isomerase I  38.32 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.744084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4518  periplasmic protein disulfide isomerase I  37.35 
 
 		 207 aa  125  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4165  periplasmic protein disulfide isomerase I  36.59 
 
 		 207 aa  122  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0407831  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4104  periplasmic protein disulfide isomerase I  35.93 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00283227  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4241  periplasmic protein disulfide isomerase I  33.67 
 
 		 208 aa  117  9e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0131889  normal  0.281037 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03746  periplasmic protein disulfide isomerase I  33.16 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4126  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4083  periplasmic protein disulfide isomerase I  33.16 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000727288  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4378  periplasmic protein disulfide isomerase I  33.16 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000586255  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4155  periplasmic protein disulfide isomerase I  33.16 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00383633  hitchhiker  0.0000667168 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03695  hypothetical protein  33.16 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459554  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5300  periplasmic protein disulfide isomerase I  33.16 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.038843  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4332  periplasmic protein disulfide isomerase I  33.16 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0257  thiol:disulfide interchange protein DsbA  34.55 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.901513  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0308  protein disulfide-isomerase (thiol:disulfide interchange protein)  30.54 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  32.1 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  33.77 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  32.52 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  33.99 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3575  DSBA oxidoreductase  27.13 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  34.39 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  31.37 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  29.71 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.3 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  31.9 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.82 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.67 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4193  DsbA oxidoreductase  30.07 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000377702  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  30.67 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  30.67 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  25.51 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3958  DSBA oxidoreductase  30.67 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4060  DSBA oxidoreductase  30.67 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154818  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4035  DSBA oxidoreductase  30.67 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4153  DSBA oxidoreductase  30.67 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  24.4 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03648  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.61 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  25.93 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3871  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  25.79 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.05 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  27.22 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4028  DSBA oxidoreductase  25.31 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4023  DSBA oxidoreductase  25.31 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0524  DSBA oxidoreductase  30.69 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716965 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000576  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.28 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0848173  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.37 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  27.4 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1147  thiol:disulfide interchange protein DsbA  20.31 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.71 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0158  DSBA oxidoreductase  25.84 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.699641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2110  hypothetical protein  25.85 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  26.01 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  25.43 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.61 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405724  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4348  thiol:disulfide interchange protein DsbA  22.75 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0143  DSBA oxidoreductase  23.86 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0874  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117334  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3787  DsbA oxidoreductase  25.93 
 
 		 249 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3718  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  23.78 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0909  DSBA oxidoreductase  24.38 
 
 		 250 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.322107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3063  DSBA oxidoreductase  24.38 
 
 		 250 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  25.43 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0796  DSBA oxidoreductase  26.83 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0052  DSBA oxidoreductase  24.07 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3398  DSBA oxidoreductase  23.12 
 
 		 251 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3405  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 		 275 aa  48.9  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0951  thiol:disulfide interchange protein DsbA  22.68 
 
 		 220 aa  48.5  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3036  DSBA oxidoreductase  23.75 
 
 		 250 aa  48.5  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0941  DSBA oxidoreductase  22.81 
 
 		 251 aa  48.5  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0002  integrase/recombinase  21.95 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000442871  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0856  disulfide isomerase  27.38 
 
 		 219 aa  48.5  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.69 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0559  thiol:disulfide interchange protein, DsbA family  24.61 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0964  DSBA oxidoreductase  22.81 
 
 		 251 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.07 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbA  22.68 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.325546  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0285  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  25.88 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0353  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.81 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0818  DSBA oxidoreductase  23.37 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0234  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  23.03 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0975  DSBA oxidoreductase  22.81 
 
 		 251 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  26.19 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0086  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0590  thiol:disulfide interchange protein  25 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1999  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684259  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0408  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0428  Thiol:disulfide interchange protein dsbA precursor  25 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>