123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_09670 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_09670  thioredoxin-like fold protein  100 
 
 		 242 aa  504  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09722  DSBA oxidoreductase  36.73 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.412545  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4507  hypothetical protein  27.81 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3787  DsbA oxidoreductase  24.38 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3958  DSBA oxidoreductase  27 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4060  DSBA oxidoreductase  27 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154818  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4035  DSBA oxidoreductase  27 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0020  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.42 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000268168  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4153  DSBA oxidoreductase  27 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0022  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.42 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00595683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4196  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.42 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.693505  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0122  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  24.47 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.64 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  27.45 
 
 		 203 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  27.45 
 
 		 203 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  22.6 
 
 		 211 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03746  periplasmic protein disulfide isomerase I  25.13 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4126  DSBA oxidoreductase  25.13 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.96 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03695  hypothetical protein  25.13 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459554  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  29.22 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4083  periplasmic protein disulfide isomerase I  25.13 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000727288  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4378  periplasmic protein disulfide isomerase I  25.13 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000586255  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  25.26 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5300  periplasmic protein disulfide isomerase I  25.13 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.038843  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4155  periplasmic protein disulfide isomerase I  25.13 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00383633  hitchhiker  0.0000667168 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4241  periplasmic protein disulfide isomerase I  25.13 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0131889  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4332  periplasmic protein disulfide isomerase I  25.13 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0137  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  23.94 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4385  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.44 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.44 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  24.86 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4207  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.44 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4278  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.44 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.744084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4324  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.44 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2860  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  24.23 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  22.12 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4104  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.51 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00283227  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  26.47 
 
 		 203 aa  62  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0686  DSBA oxidoreductase  22.89 
 
 		 220 aa  62  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.355761 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbA  23.76 
 
 		 216 aa  62  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405724  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  23.4 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3568  DSBA oxidoreductase  27.01 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4889  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.46 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000138937  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  24.74 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  26.29 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  27.98 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  23.59 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  23.59 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1742  DsbA oxidoreductase  23.65 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0147318  hitchhiker  0.0000164323 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2784  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.957137  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  25.41 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0308  protein disulfide-isomerase (thiol:disulfide interchange protein)  24.6 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2842  DSBA oxidoreductase  26.53 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4518  periplasmic protein disulfide isomerase I  25.4 
 
 		 207 aa  57  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0964  DSBA oxidoreductase  24 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0874  DSBA oxidoreductase  24.68 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117334  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.26 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3398  DSBA oxidoreductase  23.5 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1573  DSBA oxidoreductase  24.1 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0551  DSBA oxidoreductase  23.49 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.32 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2373  DSBA oxidoreductase  26.7 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.563434  hitchhiker  0.0000192462 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3063  DSBA oxidoreductase  23.38 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0909  DSBA oxidoreductase  23.38 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.322107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0941  DSBA oxidoreductase  23 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4193  DsbA oxidoreductase  22.35 
 
 		 203 aa  55.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000377702  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0975  DSBA oxidoreductase  23.5 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3718  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  24.77 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3968  periplasmic protein disulfide isomerase I  25.4 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000322053  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0818  DSBA oxidoreductase  27.72 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4165  periplasmic protein disulfide isomerase I  24.6 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0407831  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2360  DSBA oxidoreductase  21.91 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  22.1 
 
 		 203 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1521  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  22.4 
 
 		 185 aa  53.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0606575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  21.43 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0693  DSBA oxidoreductase  21.14 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33027  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2850  DSBA oxidoreductase  24.57 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 202 aa  53.1  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  21.43 
 
 		 210 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1709  DSBA oxidoreductase  20.67 
 
 		 206 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2640  DSBA oxidoreductase  20.67 
 
 		 206 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2116  DSBA oxidoreductase  24.43 
 
 		 213 aa  52.8  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1693  DSBA oxidoreductase  23.76 
 
 		 210 aa  52.4  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04434  thiol:disulfide interchange protein  24.44 
 
 		 271 aa  52.4  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3036  DSBA oxidoreductase  23.83 
 
 		 250 aa  52.4  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2675  DSBA oxidoreductase  20.67 
 
 		 206 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26469  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2754  DSBA oxidoreductase  20.67 
 
 		 206 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3441  DSBA oxidoreductase  21.5 
 
 		 218 aa  52  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0780  thiol:disulfide interchange protein  20.57 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  23.94 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3404  DSBA oxidoreductase  23.7 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.766013  normal  0.487769 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0257  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.76 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.901513  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0983  DSBA oxidoreductase  27.62 
 
 		 213 aa  49.7  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3405  DSBA oxidoreductase  22.53 
 
 		 275 aa  49.7  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2934  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  22.46 
 
 		 248 aa  49.3  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0782284 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0796  DSBA oxidoreductase  22.79 
 
 		 223 aa  49.3  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  24 
 
 		 210 aa  48.9  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  21.43 
 
 		 210 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0158  DSBA oxidoreductase  23.53 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.699641  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>