153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0686 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0686  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 220 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.355761 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3787  DsbA oxidoreductase  82.73 
 
 		 249 aa  366  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0796  DSBA oxidoreductase  73.87 
 
 		 223 aa  329  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0941  DSBA oxidoreductase  69.27 
 
 		 251 aa  321  4e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0964  DSBA oxidoreductase  69.27 
 
 		 251 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3398  DSBA oxidoreductase  68.81 
 
 		 251 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0975  DSBA oxidoreductase  68.81 
 
 		 251 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0874  DSBA oxidoreductase  68.35 
 
 		 250 aa  317  7e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117334  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3036  DSBA oxidoreductase  67.43 
 
 		 250 aa  317  9e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0909  DSBA oxidoreductase  68.35 
 
 		 250 aa  314  5e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.322107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3063  DSBA oxidoreductase  68.35 
 
 		 250 aa  314  6e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3718  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  68.35 
 
 		 250 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3441  DSBA oxidoreductase  66.96 
 
 		 218 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2934  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  61.95 
 
 		 248 aa  263  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0782284 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0818  DSBA oxidoreductase  54.55 
 
 		 218 aa  256  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  33.83 
 
 		 203 aa  135  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  35.68 
 
 		 205 aa  133  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 		 203 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 		 203 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  32.5 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.68 
 
 		 202 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.34 
 
 		 204 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  32.57 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4193  DsbA oxidoreductase  32.55 
 
 		 203 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000377702  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3958  DSBA oxidoreductase  31.28 
 
 		 202 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4060  DSBA oxidoreductase  31.28 
 
 		 202 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154818  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4035  DSBA oxidoreductase  31.28 
 
 		 202 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4153  DSBA oxidoreductase  31.28 
 
 		 202 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  29.74 
 
 		 202 aa  118  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  31.16 
 
 		 200 aa  118  7.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.95 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  27.55 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.16 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000576  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.67 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0848173  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.91 
 
 		 200 aa  106  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.77 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  29.05 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  30.09 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4104  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.63 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00283227  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4207  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.48 
 
 		 207 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4278  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.48 
 
 		 207 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.744084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4385  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.48 
 
 		 207 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4324  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.48 
 
 		 207 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.48 
 
 		 207 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157644  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03746  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.46 
 
 		 208 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4126  DSBA oxidoreductase  26.46 
 
 		 208 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4241  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.46 
 
 		 208 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0131889  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4155  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.46 
 
 		 208 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00383633  hitchhiker  0.0000667168 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03695  hypothetical protein  26.46 
 
 		 208 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459554  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5300  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.46 
 
 		 208 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.038843  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4332  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.46 
 
 		 208 aa  92.8  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4083  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.46 
 
 		 208 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000727288  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4378  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.46 
 
 		 208 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000586255  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4889  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.64 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000138937  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4165  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.35 
 
 		 207 aa  90.1  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0407831  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4196  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.14 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.693505  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0020  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.14 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000268168  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0022  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.14 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00595683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3968  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.48 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000322053  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4518  periplasmic protein disulfide isomerase I  25.63 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.13 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0308  protein disulfide-isomerase (thiol:disulfide interchange protein)  31.25 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03648  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.78 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3575  DSBA oxidoreductase  27.03 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4348  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.26 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0983  DSBA oxidoreductase  27.22 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0137  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  26.36 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0257  thiol:disulfide interchange protein DsbA  23.5 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.901513  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0122  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  25.91 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1521  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  24.27 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0606575  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2860  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  28.77 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09670  thioredoxin-like fold protein  22.89 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0077  hypothetical protein  23.38 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.453985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3546  disulfide isomerase  22.12 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.504028 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3374  disulfide isomerase  22.12 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3334  DsbA family thioredoxin  23.98 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3444  disulfide isomerase  22.12 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.923354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3451  disulfide isomerase  22.12 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  27.54 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3379  disulfide isomerase  22.22 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.996727 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0234  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  26.64 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  27.6 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  27.09 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1380  DSBA oxidoreductase  21.62 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172007  normal  0.0174557 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2373  DSBA oxidoreductase  25.34 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.563434  hitchhiker  0.0000192462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  23.37 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1742  DsbA oxidoreductase  24.24 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0147318  hitchhiker  0.0000164323 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  22.83 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbA  21.15 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405724  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  21.36 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1438  DSBA oxidoreductase  22.22 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.44353 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2842  DSBA oxidoreductase  22.84 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1573  DSBA oxidoreductase  27.59 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3405  DSBA oxidoreductase  23.6 
 
 		 275 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05391  hypothetical protein  28.49 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1709  DSBA oxidoreductase  24.88 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2640  DSBA oxidoreductase  24.88 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2675  DSBA oxidoreductase  24.88 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26469  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2754  DSBA oxidoreductase  24.88 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>