155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_09722 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_09722  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
201 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.412545  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09670  thioredoxin-like fold protein  36.73 
 
 
242 aa  160  9e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.96 
 
 
216 aa  79  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405724  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  26.59 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  27.59 
 
 
210 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4507  hypothetical protein  32.56 
 
 
210 aa  74.7  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  28.16 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  28.25 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3568  DSBA oxidoreductase  27.84 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0557  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.65 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.12 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0129  DSBA oxidoreductase  24.62 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  25.14 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  24.86 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0120  hypothetical protein  24.62 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.04 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.38 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.98 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  24.86 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0052  DSBA oxidoreductase  27.45 
 
 
213 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2454  DSBA oxidoreductase  26.55 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2116  DSBA oxidoreductase  26.44 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2784  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.16 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.957137  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0353  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.44 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0086  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.01 
 
 
212 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0590  thiol:disulfide interchange protein  27.01 
 
 
212 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3097  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.01 
 
 
212 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1999  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.01 
 
 
212 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684259  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0408  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.01 
 
 
212 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0428  Thiol:disulfide interchange protein dsbA precursor  27.01 
 
 
212 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2289  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.01 
 
 
212 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1521  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  25.86 
 
 
185 aa  63.5  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0606575  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1742  DsbA oxidoreductase  27.33 
 
 
210 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0147318  hitchhiker  0.0000164323 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01990  Thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.48 
 
 
214 aa  62.4  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0383  DSBA oxidoreductase  25.86 
 
 
212 aa  62  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.290436 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2373  DSBA oxidoreductase  26.92 
 
 
210 aa  62  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.563434  hitchhiker  0.0000192462 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2970  DSBA oxidoreductase  25.29 
 
 
213 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2833  DSBA oxidoreductase  25.9 
 
 
213 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.483213 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0551  DSBA oxidoreductase  25.64 
 
 
220 aa  61.6  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6264  DSBA oxidoreductase  25.9 
 
 
212 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2860  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  25.14 
 
 
207 aa  60.1  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0050  DSBA oxidoreductase  26.35 
 
 
207 aa  60.1  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0556342  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2360  DSBA oxidoreductase  24.32 
 
 
207 aa  60.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000576  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.32 
 
 
199 aa  60.5  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0848173  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0137  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  25.37 
 
 
204 aa  59.7  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2675  DSBA oxidoreductase  24.36 
 
 
211 aa  59.3  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3404  DSBA oxidoreductase  23.39 
 
 
216 aa  59.3  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.766013  normal  0.487769 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0122  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  25.37 
 
 
204 aa  59.3  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0158  DSBA oxidoreductase  25.7 
 
 
216 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.699641  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2936  DSBA oxidoreductase  26.22 
 
 
212 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2921  DSBA oxidoreductase  26.22 
 
 
212 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0780  thiol:disulfide interchange protein  24.02 
 
 
260 aa  58.2  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2307  DSBA oxidoreductase  26.22 
 
 
212 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0693  DSBA oxidoreductase  24.57 
 
 
260 aa  56.6  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33027  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  28.25 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  24.18 
 
 
207 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4228  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
221 aa  56.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  24.18 
 
 
207 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2640  DSBA oxidoreductase  23.43 
 
 
206 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1709  DSBA oxidoreductase  23.43 
 
 
206 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000128483 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2167  DSBA oxidoreductase  25.77 
 
 
233 aa  55.8  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1364  DSBA oxidoreductase  24.62 
 
 
214 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2675  DSBA oxidoreductase  23.43 
 
 
206 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26469  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2754  DSBA oxidoreductase  23.43 
 
 
206 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1573  DSBA oxidoreductase  24.18 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0779  thiol:disulfide interchange protein  22.35 
 
 
215 aa  53.5  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0098  DSBA oxidoreductase  24.86 
 
 
212 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1975  DSBA oxidoreductase  24.29 
 
 
215 aa  53.1  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2850  DSBA oxidoreductase  21.97 
 
 
211 aa  52.4  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302061  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3703  DSBA oxidoreductase  22.78 
 
 
220 aa  51.6  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal  0.783834 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1693  DSBA oxidoreductase  25.5 
 
 
210 aa  51.6  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4488  DSBA oxidoreductase  21.91 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4518  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.63 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0692  DSBA oxidoreductase  21.76 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.487009  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0435  DSBA oxidoreductase  24.56 
 
 
218 aa  50.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0898  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  26.7 
 
 
225 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1088  thiol:disulfide interchange protein, DsbA family  25.33 
 
 
254 aa  50.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.456825  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0151  thiol:disulfide interchange protein  23.86 
 
 
214 aa  50.1  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.517517  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0143  DSBA oxidoreductase  26.29 
 
 
218 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04434  thiol:disulfide interchange protein  23.43 
 
 
271 aa  50.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  23.76 
 
 
202 aa  49.3  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0471  DSBA oxidoreductase  22.39 
 
 
212 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2842  DSBA oxidoreductase  24.26 
 
 
208 aa  49.3  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04433  disulfide oxidoreductase  22.94 
 
 
216 aa  48.9  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0285  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  26.44 
 
 
218 aa  48.5  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  26.13 
 
 
200 aa  48.5  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.63 
 
 
200 aa  48.5  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  24.36 
 
 
260 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0135  DSBA oxidoreductase  25.86 
 
 
218 aa  48.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3864  twin-arginine translocation pathway signal  23.08 
 
 
218 aa  48.1  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.387076  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0129  DSBA oxidoreductase  23.08 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266261  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  23.33 
 
 
339 aa  47.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  23.68 
 
 
269 aa  47.4  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3405  DSBA oxidoreductase  22.22 
 
 
275 aa  47.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0092  DSBA oxidoreductase  20 
 
 
216 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0575  DSBA oxidoreductase  21.91 
 
 
223 aa  47  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484961  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4104  periplasmic protein disulfide isomerase I  23.91 
 
 
207 aa  47.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00283227  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  26.71 
 
 
252 aa  46.6  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  25.68 
 
 
207 aa  47  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  26.71 
 
 
252 aa  46.6  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>