72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1088 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1088  thiol:disulfide interchange protein, DsbA family  100 
 
 		 254 aa  518  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.456825  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  28.05 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3404  DSBA oxidoreductase  30.18 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.766013  normal  0.487769 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04433  disulfide oxidoreductase  31.1 
 
 		 216 aa  72  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0050  DSBA oxidoreductase  27.97 
 
 		 207 aa  71.6  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0556342  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0779  thiol:disulfide interchange protein  28.05 
 
 		 215 aa  68.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0692  DSBA oxidoreductase  26.22 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.487009  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01990  Thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.39 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  23.97 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2116  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0377  Thiol:disulfide interchange protein  33.54 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0092  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2167  DSBA oxidoreductase  23.21 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3568  DSBA oxidoreductase  26.43 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  22.98 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.69 
 
 		 214 aa  62  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2784  thiol:disulfide interchange protein DsbA  21.14 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.957137  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  22.36 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0158  DSBA oxidoreductase  20.5 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.699641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0052  DSBA oxidoreductase  23.35 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  23.46 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  22.36 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.61 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405724  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0780  thiol:disulfide interchange protein  25.15 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  21.19 
 
 		 206 aa  58.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0693  DSBA oxidoreductase  25.15 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33027  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3405  DSBA oxidoreductase  25.61 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  21.74 
 
 		 211 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0037  DSBA oxidoreductase  20.99 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.763782 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  21.74 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04434  thiol:disulfide interchange protein  23.63 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0120  hypothetical protein  23.91 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0551  DSBA oxidoreductase  24.39 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6264  DSBA oxidoreductase  25.69 
 
 		 212 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2921  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 212 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0463  DSBA oxidoreductase  22.56 
 
 		 215 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0780144  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2833  DSBA oxidoreductase  24.32 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.483213 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0353  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.68 
 
 		 212 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2936  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 212 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0129  DSBA oxidoreductase  23.19 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0086  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.32 
 
 		 212 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2289  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.32 
 
 		 212 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0428  Thiol:disulfide interchange protein dsbA precursor  24.32 
 
 		 212 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0408  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.32 
 
 		 212 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358147  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0590  thiol:disulfide interchange protein  24.32 
 
 		 212 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1999  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.32 
 
 		 212 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684259  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2970  DSBA oxidoreductase  24.32 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3097  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.32 
 
 		 212 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2307  DSBA oxidoreductase  24.32 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0334  DSBA oxidoreductase  22.01 
 
 		 216 aa  52.8  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.227367  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0345  DSBA oxidoreductase  22.01 
 
 		 216 aa  52.8  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0383  DSBA oxidoreductase  24.32 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.290436 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3864  twin-arginine translocation pathway signal  20.1 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.387076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0575  DSBA oxidoreductase  19.38 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09722  DSBA oxidoreductase  25.33 
 
 		 201 aa  50.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.412545  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2675  DSBA oxidoreductase  23.03 
 
 		 211 aa  49.3  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0722  DSBA oxidoreductase  23.63 
 
 		 208 aa  48.9  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  23.6 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0186  DSBA oxidoreductase  20.55 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0077  hypothetical protein  24.46 
 
 		 293 aa  46.6  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.453985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0671  DSBA oxidoreductase  19.88 
 
 		 216 aa  46.6  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0129  DSBA oxidoreductase  21.83 
 
 		 211 aa  46.2  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266261  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2454  DSBA oxidoreductase  21.33 
 
 		 215 aa  45.4  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3703  DSBA oxidoreductase  23.86 
 
 		 220 aa  45.4  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal  0.783834 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0137  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  19.67 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0143  DSBA oxidoreductase  20.73 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0471  DSBA oxidoreductase  20.39 
 
 		 212 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4247  putative thiol-disulfide interchange protein  19.74 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0285  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  19.08 
 
 		 218 aa  42.7  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0122  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  19.13 
 
 		 204 aa  42.4  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0135  DSBA oxidoreductase  19.74 
 
 		 218 aa  42  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0098  DSBA oxidoreductase  21.13 
 
 		 212 aa  42  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>