More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1472 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
328 aa  649    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.242688  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1472  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
328 aa  649    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000559145  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0953  peptide ABC transporter, permease protein, putative  67.54 
 
 
333 aa  422  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.353357  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
312 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
316 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.54 
 
 
321 aa  195  7e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
316 aa  192  9e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  35.02 
 
 
313 aa  189  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.45 
 
 
307 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.73 
 
 
313 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
313 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1978  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.08 
 
 
314 aa  186  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.68 
 
 
319 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
306 aa  187  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.38 
 
 
313 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0350  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  34.19 
 
 
310 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
313 aa  186  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.44 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0910692  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5088  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  33.65 
 
 
313 aa  184  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.31 
 
 
313 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0469  nickel ABC transporter, permease protein  33.55 
 
 
309 aa  182  7e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4538  peptide ABC transporter, permease protein  34.09 
 
 
315 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 
306 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022065  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
303 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.38 
 
 
313 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000799384  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
313 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0538  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.79 
 
 
311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.396259 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0388  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 
315 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0803  nickel transporter permease NikB  33.01 
 
 
314 aa  179  8e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.226349  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0644  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.79 
 
 
314 aa  179  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.26 
 
 
319 aa  179  8e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4215  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.23 
 
 
315 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0753  nickel transporter permease NikB  33.01 
 
 
314 aa  177  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0408  peptide ABC transporter, permease protein  31.45 
 
 
319 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.599742  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0351  peptide ABC transporter, permease protein  31.45 
 
 
319 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5121  putative ABC transporter permease protein  35.64 
 
 
298 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.407731 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.67 
 
 
314 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.15 
 
 
317 aa  177  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2276  nickel transporter permease NikB  31.82 
 
 
314 aa  176  7e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293593  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1251  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 
313 aa  175  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0714175 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0021  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  32.69 
 
 
311 aa  175  8e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00143513  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.07 
 
 
306 aa  175  8e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3251  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  31.19 
 
 
312 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.177339  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
311 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000854239  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.76 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
315 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03326  nickel transporter subunit  32.48 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0238  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  32.48 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0239  nickel transporter permease NikB  32.48 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3654  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276261  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.14 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3676  nickel transporter permease NikB  32.48 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03279  hypothetical protein  32.48 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  29.13 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3959  nickel transporter permease NikB  32.48 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.19 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.794004  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3844  nickel transporter permease NikB  32.48 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.83 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.18227  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.380096  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.78 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.583843  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16220  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  33.65 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.270371  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  29.13 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4291  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.47 
 
 
338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1092  peptide ABC transporter, permease protein, putative  33.33 
 
 
314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4817  nickel transporter permease NikB  32.15 
 
 
314 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  28.8 
 
 
306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 
313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4385  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.01 
 
 
316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02052e-22 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2003  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.19 
 
 
315 aa  173  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
316 aa  172  6.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0880861  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0946  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.01 
 
 
316 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.38 
 
 
358 aa  172  6.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0891876 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
341 aa  172  6.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.714161  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4455  opine ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  30.38 
 
 
313 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000539356 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2322  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  31.45 
 
 
348 aa  171  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.45 
 
 
306 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0219662  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1498  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.17 
 
 
308 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.241637  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.48 
 
 
313 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422815  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3761  nickel transporter permease NikB  32.15 
 
 
314 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0183  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.71 
 
 
329 aa  171  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5290  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  33.78 
 
 
307 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728282  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 
313 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.932563 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 
312 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.856468 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.01 
 
 
333 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0719  hypothetical protein  32.34 
 
 
316 aa  171  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.870853 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  29.37 
 
 
306 aa  170  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.37 
 
 
306 aa  170  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  30 
 
 
326 aa  170  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  29.37 
 
 
306 aa  170  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7327  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  30.39 
 
 
306 aa  170  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
311 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.224896  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  29.37 
 
 
306 aa  170  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  28.48 
 
 
306 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  29.37 
 
 
306 aa  170  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  29.37 
 
 
306 aa  170  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  28.48 
 
 
306 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.37 
 
 
306 aa  170  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>