More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1932 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1932  small GTP-binding protein domain-containing protein  100 
 
 		 426 aa  840    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0252  GTP-binding protein, HSR1-related  64.58 
 
 		 442 aa  489  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.240813  normal  0.141615 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1271  GTP-binding protein, HSR1-related  59.82 
 
 		 432 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.51955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3123  GTP-binding protein HSR1-related  57.79 
 
 		 474 aa  405  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406927 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1633  GTP-binding proten HflX  55.67 
 
 		 441 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192278  normal  0.293033 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0481  GTP-binding proten HflX  58.44 
 
 		 436 aa  403  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.738379  decreased coverage  0.000424503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1449  small GTP-binding protein  52.64 
 
 		 450 aa  402  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.948671  hitchhiker  0.000728125 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4074  putative GTP-binding protein (hflX)  56.12 
 
 		 459 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1820  GTP-binding proten HflX  55.92 
 
 		 441 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0332414  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1685  small GTP-binding protein domain-containing protein  57.53 
 
 		 418 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4392  small GTP-binding protein  56.72 
 
 		 457 aa  401  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1761  GTP-binding protein, HSR1-related  57.98 
 
 		 435 aa  398  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2877  GTP-binding protein, HSR1-related  54.1 
 
 		 457 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2868  GTP-binding proten HflX  55.53 
 
 		 455 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1450  GTP-binding protein, HSR1-related  54.3 
 
 		 442 aa  392  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.475087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1096  GTP-binding protein HSR1-related  55.36 
 
 		 465 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.774913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2595  GTP-binding protein, HSR1-related  56.88 
 
 		 434 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0324515 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6545  GTP-binding proten HflX  55.01 
 
 		 471 aa  392  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2583  GTP-binding protein, HSR1-related  54.77 
 
 		 461 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0894246  normal  0.17165 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1842  GTP-binding protein, HSR1-related  54.84 
 
 		 444 aa  389  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2142  GTP-binding protein HFLX  54.96 
 
 		 444 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501341  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5943  GTP-binding proten HflX  53.76 
 
 		 474 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_004310  BR1110  GTP-binding protein, putative  55.19 
 
 		 472 aa  387  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.259751  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1069  GTP-binding proten HflX  55.16 
 
 		 490 aa  387  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2207  GTP-binding protein HSR1-related  55.67 
 
 		 472 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1612  GTP-binding protein, HSR1-related  53.62 
 
 		 460 aa  384  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2611  GTP-binding proten HflX  52.58 
 
 		 446 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2825  GTP-binding proten HflX  53.94 
 
 		 471 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.162481 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3052  GTP-binding proten HflX  53.94 
 
 		 471 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1526  GTP-binding proten HflX  55 
 
 		 466 aa  378  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1450  small GTP-binding protein  53.27 
 
 		 447 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0438949 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2844  putative GTP-binding protein  53.04 
 
 		 416 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2943  GTP-binding proten HflX  53.45 
 
 		 471 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0536  GTP-binding proten HflX  53.62 
 
 		 469 aa  369  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0068  GTP-binding proten HflX  51.46 
 
 		 474 aa  368  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.943914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1494  GTP-binding proten HflX  52.54 
 
 		 470 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1355  GTP-binding protein, HSR1-related  50.93 
 
 		 423 aa  364  1e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.427111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4123  small GTP-binding protein  54.11 
 
 		 435 aa  361  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.214153  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1494  GTP-binding protein, HSR1-related  53.69 
 
 		 448 aa  359  5e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.172375 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0625  GTP-binding proten HflX  50.49 
 
 		 457 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00182649  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2245  GTP-binding protein, HSR1-related  52.61 
 
 		 435 aa  355  8.999999999999999e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.157865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1566  GTP-binding protein  52.16 
 
 		 415 aa  345  1e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  0.0486132 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  46.88 
 
 		 441 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0278  GTP-binding protein, HSR1-related  48.77 
 
 		 432 aa  303  5.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.134684  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  43.45 
 
 		 414 aa  295  8e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  43.45 
 
 		 414 aa  295  9e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  44.59 
 
 		 432 aa  293  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  44.44 
 
 		 441 aa  291  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  44.42 
 
 		 421 aa  289  7e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  44.37 
 
 		 442 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0665  GTP-binding protein, HSR1-related  46.59 
 
 		 445 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0655164  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  41.23 
 
 		 415 aa  286  4e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  44.69 
 
 		 433 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  45.06 
 
 		 433 aa  286  7e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3797  putative GTPase HflX  46.59 
 
 		 428 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0756965  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0698  putative GTPase HflX  46.59 
 
 		 428 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.82 
 
 		 436 aa  283  5.000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  43.58 
 
 		 433 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3652  putative GTPase HflX  46.32 
 
 		 428 aa  282  7.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  44.67 
 
 		 454 aa  282  9e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  44.39 
 
 		 417 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  46.35 
 
 		 428 aa  281  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  43.81 
 
 		 426 aa  280  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  46.19 
 
 		 436 aa  280  4e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  48.08 
 
 		 429 aa  280  5e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  45.41 
 
 		 429 aa  279  8e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  45.67 
 
 		 433 aa  278  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  45.18 
 
 		 426 aa  278  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  45.71 
 
 		 489 aa  277  2e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  46.37 
 
 		 429 aa  278  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  45.3 
 
 		 426 aa  277  3e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  45.3 
 
 		 426 aa  277  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  45.3 
 
 		 426 aa  277  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  45.3 
 
 		 426 aa  277  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  45.3 
 
 		 426 aa  277  3e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  45.71 
 
 		 489 aa  277  3e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  45.88 
 
 		 461 aa  277  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  45.3 
 
 		 426 aa  277  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  45.3 
 
 		 426 aa  277  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  45.3 
 
 		 426 aa  277  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  45.03 
 
 		 426 aa  276  7e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  44.54 
 
 		 429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  44.09 
 
 		 440 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0057  GTP-binding proten HflX  45.68 
 
 		 450 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.583436  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2589  GTP-binding protein, HSR1-related  46.02 
 
 		 382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  44.15 
 
 		 421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  44.48 
 
 		 426 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  44.48 
 
 		 426 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  44.48 
 
 		 426 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  42.82 
 
 		 441 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  44.48 
 
 		 426 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  44.13 
 
 		 454 aa  273  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  45.05 
 
 		 431 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  44.48 
 
 		 426 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  43.06 
 
 		 429 aa  271  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  44.5 
 
 		 444 aa  271  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  48.84 
 
 		 404 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0069  GTP-binding protein  45.68 
 
 		 450 aa  271  1e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  48.84 
 
 		 404 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0493  putative GTPase HflX  45.36 
 
 		 433 aa  271  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0353897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>