More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2868 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1450  GTP-binding protein, HSR1-related  79.59 
 
 		 442 aa  681    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.475087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2868  GTP-binding proten HflX  100 
 
 		 455 aa  910    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2877  GTP-binding protein, HSR1-related  86.87 
 
 		 457 aa  769    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2583  GTP-binding protein, HSR1-related  80.48 
 
 		 461 aa  704    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0894246  normal  0.17165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4074  putative GTP-binding protein (hflX)  78.82 
 
 		 459 aa  681    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2595  GTP-binding protein, HSR1-related  86.87 
 
 		 434 aa  736    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0324515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1842  GTP-binding protein, HSR1-related  80.37 
 
 		 444 aa  690    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4392  small GTP-binding protein  62.42 
 
 		 457 aa  504  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5943  GTP-binding proten HflX  63.51 
 
 		 474 aa  502  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6545  GTP-binding proten HflX  62.36 
 
 		 471 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3052  GTP-binding proten HflX  61.01 
 
 		 471 aa  486  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2825  GTP-binding proten HflX  61.01 
 
 		 471 aa  486  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.162481 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1526  GTP-binding proten HflX  61.36 
 
 		 466 aa  483  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2943  GTP-binding proten HflX  60.32 
 
 		 471 aa  480  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1494  GTP-binding proten HflX  59.36 
 
 		 470 aa  471  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0068  GTP-binding proten HflX  59.68 
 
 		 474 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.943914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0536  GTP-binding proten HflX  58.59 
 
 		 469 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1096  GTP-binding protein HSR1-related  58.22 
 
 		 465 aa  443  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.774913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1633  GTP-binding proten HflX  57.67 
 
 		 441 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192278  normal  0.293033 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2142  GTP-binding protein HFLX  56.29 
 
 		 444 aa  438  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501341  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1820  GTP-binding proten HflX  60 
 
 		 441 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0332414  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3123  GTP-binding protein HSR1-related  58.43 
 
 		 474 aa  422  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406927 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1685  small GTP-binding protein domain-containing protein  58.74 
 
 		 418 aa  419  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1069  GTP-binding proten HflX  55.1 
 
 		 490 aa  418  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1110  GTP-binding protein, putative  55.33 
 
 		 472 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.259751  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2207  GTP-binding protein HSR1-related  56.34 
 
 		 472 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1612  GTP-binding protein, HSR1-related  55.06 
 
 		 460 aa  402  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1932  small GTP-binding protein domain-containing protein  55.53 
 
 		 426 aa  395  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0252  GTP-binding protein, HSR1-related  59.9 
 
 		 442 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.240813  normal  0.141615 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1449  small GTP-binding protein  53.28 
 
 		 450 aa  394  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.948671  hitchhiker  0.000728125 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1355  GTP-binding protein, HSR1-related  54.02 
 
 		 423 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.427111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2611  GTP-binding proten HflX  58.79 
 
 		 446 aa  388  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0625  GTP-binding proten HflX  50.84 
 
 		 457 aa  386  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00182649  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1761  GTP-binding protein, HSR1-related  58.44 
 
 		 435 aa  384  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0481  GTP-binding proten HflX  55.36 
 
 		 436 aa  379  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.738379  decreased coverage  0.000424503 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1271  GTP-binding protein, HSR1-related  54.79 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.51955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2844  putative GTP-binding protein  54.43 
 
 		 416 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1450  small GTP-binding protein  54.43 
 
 		 447 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0438949 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1566  GTP-binding protein  56.53 
 
 		 415 aa  368  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  0.0486132 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2245  GTP-binding protein, HSR1-related  55.8 
 
 		 435 aa  362  7.0000000000000005e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.157865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1494  GTP-binding protein, HSR1-related  55.08 
 
 		 448 aa  358  9e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.172375 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4123  small GTP-binding protein  53.68 
 
 		 435 aa  358  9.999999999999999e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.214153  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0278  GTP-binding protein, HSR1-related  54.16 
 
 		 432 aa  320  3.9999999999999996e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.134684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  45.93 
 
 		 441 aa  311  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  46.28 
 
 		 442 aa  298  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  46.99 
 
 		 440 aa  294  2e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  44.5 
 
 		 417 aa  294  3e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  44.17 
 
 		 432 aa  294  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1560  GTP-binding proten HflX  48.8 
 
 		 432 aa  293  4e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000698014 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1885  GTP-binding protein HflX  48.8 
 
 		 432 aa  293  4e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0816139  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  45.41 
 
 		 489 aa  289  6e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  48.59 
 
 		 444 aa  289  7e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  48.45 
 
 		 441 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  45.41 
 
 		 489 aa  288  1e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2979  GTP-binding protein, HSR1-related  52.53 
 
 		 384 aa  288  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  50.78 
 
 		 439 aa  287  2.9999999999999996e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  44.28 
 
 		 414 aa  286  5.999999999999999e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  48 
 
 		 433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  44.03 
 
 		 414 aa  285  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  50.87 
 
 		 421 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  46.5 
 
 		 429 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  43.04 
 
 		 415 aa  284  3.0000000000000004e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  47.66 
 
 		 461 aa  281  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  50.31 
 
 		 429 aa  281  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  49.43 
 
 		 454 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  50.94 
 
 		 429 aa  280  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  50.94 
 
 		 429 aa  280  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  51.1 
 
 		 439 aa  280  3e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0665  GTP-binding protein, HSR1-related  50.77 
 
 		 445 aa  280  3e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0655164  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  45.68 
 
 		 428 aa  280  4e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  44.03 
 
 		 433 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  44.03 
 
 		 433 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  44.03 
 
 		 433 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  49.43 
 
 		 454 aa  279  6e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  47.59 
 
 		 396 aa  279  7e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  43.48 
 
 		 434 aa  279  7e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  46.67 
 
 		 435 aa  279  9e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  50.46 
 
 		 433 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  50.65 
 
 		 433 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1414  GTP-binding proten HflX  48.16 
 
 		 414 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000434774 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  50 
 
 		 433 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  47.46 
 
 		 392 aa  276  5e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  47.31 
 
 		 404 aa  276  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  47.31 
 
 		 404 aa  276  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  50.64 
 
 		 396 aa  276  7e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  50.64 
 
 		 395 aa  276  7e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1048  GTP-binding protein  44.16 
 
 		 454 aa  276  7e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  50.64 
 
 		 395 aa  276  7e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  47.18 
 
 		 392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  50.64 
 
 		 396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  47.18 
 
 		 387 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  50.32 
 
 		 396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  44.83 
 
 		 481 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0446  small GTP-binding protein domain-containing protein  47.57 
 
 		 394 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  45.66 
 
 		 426 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0940  GTP-binding proten HflX  44.1 
 
 		 454 aa  275  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  47.18 
 
 		 387 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  47.18 
 
 		 387 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  47.18 
 
 		 387 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  44.85 
 
 		 435 aa  274  3e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>