More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4392 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4392  small GTP-binding protein  100 
 
 		 457 aa  901    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2583  GTP-binding protein, HSR1-related  65.84 
 
 		 461 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0894246  normal  0.17165 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1526  GTP-binding proten HflX  61.66 
 
 		 466 aa  511  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1842  GTP-binding protein, HSR1-related  63.76 
 
 		 444 aa  510  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2868  GTP-binding proten HflX  62.42 
 
 		 455 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2877  GTP-binding protein, HSR1-related  62.64 
 
 		 457 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5943  GTP-binding proten HflX  64.14 
 
 		 474 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1450  GTP-binding protein, HSR1-related  62.9 
 
 		 442 aa  502  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.475087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6545  GTP-binding proten HflX  61.85 
 
 		 471 aa  504  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0536  GTP-binding proten HflX  62.03 
 
 		 469 aa  499  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2943  GTP-binding proten HflX  62.93 
 
 		 471 aa  495  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2825  GTP-binding proten HflX  62.59 
 
 		 471 aa  495  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.162481 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3052  GTP-binding proten HflX  62.59 
 
 		 471 aa  495  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2595  GTP-binding protein, HSR1-related  63.97 
 
 		 434 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0324515 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1494  GTP-binding proten HflX  63.86 
 
 		 470 aa  489  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0068  GTP-binding proten HflX  60.89 
 
 		 474 aa  488  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.943914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4074  putative GTP-binding protein (hflX)  64.29 
 
 		 459 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1069  GTP-binding proten HflX  61.79 
 
 		 490 aa  480  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1110  GTP-binding protein, putative  62.03 
 
 		 472 aa  477  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.259751  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1633  GTP-binding proten HflX  60.23 
 
 		 441 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192278  normal  0.293033 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2207  GTP-binding protein HSR1-related  62.26 
 
 		 472 aa  474  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1820  GTP-binding proten HflX  59.77 
 
 		 441 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0332414  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1096  GTP-binding protein HSR1-related  58.73 
 
 		 465 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.774913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1685  small GTP-binding protein domain-containing protein  60.68 
 
 		 418 aa  462  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1612  GTP-binding protein, HSR1-related  60.49 
 
 		 460 aa  456  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3123  GTP-binding protein HSR1-related  59.78 
 
 		 474 aa  455  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406927 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2142  GTP-binding protein HFLX  57.14 
 
 		 444 aa  453  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501341  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0481  GTP-binding proten HflX  62.44 
 
 		 436 aa  442  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.738379  decreased coverage  0.000424503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2611  GTP-binding proten HflX  58.26 
 
 		 446 aa  442  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1761  GTP-binding protein, HSR1-related  58.43 
 
 		 435 aa  422  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1449  small GTP-binding protein  51.37 
 
 		 450 aa  423  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.948671  hitchhiker  0.000728125 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1355  GTP-binding protein, HSR1-related  57.25 
 
 		 423 aa  420  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.427111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0252  GTP-binding protein, HSR1-related  58.98 
 
 		 442 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.240813  normal  0.141615 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0625  GTP-binding proten HflX  53.73 
 
 		 457 aa  413  1e-114  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00182649  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1566  GTP-binding protein  60.58 
 
 		 415 aa  409  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  0.0486132 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2245  GTP-binding protein, HSR1-related  58.21 
 
 		 435 aa  408  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.157865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1450  small GTP-binding protein  56.76 
 
 		 447 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0438949 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2844  putative GTP-binding protein  58.97 
 
 		 416 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1932  small GTP-binding protein domain-containing protein  57.51 
 
 		 426 aa  401  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1494  GTP-binding protein, HSR1-related  55.63 
 
 		 448 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.172375 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4123  small GTP-binding protein  56.43 
 
 		 435 aa  386  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.214153  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1271  GTP-binding protein, HSR1-related  55.77 
 
 		 432 aa  384  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.51955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0278  GTP-binding protein, HSR1-related  52.99 
 
 		 432 aa  345  1e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.134684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  49.6 
 
 		 417 aa  313  4.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  46.13 
 
 		 441 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  46.95 
 
 		 433 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  47.37 
 
 		 433 aa  306  7e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  49.45 
 
 		 441 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  49.11 
 
 		 421 aa  305  2.0000000000000002e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  47.12 
 
 		 433 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  45.21 
 
 		 415 aa  303  6.000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0665  GTP-binding protein, HSR1-related  49.86 
 
 		 445 aa  301  1e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0655164  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1560  GTP-binding proten HflX  51.94 
 
 		 432 aa  300  5e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000698014 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1885  GTP-binding protein HflX  51.94 
 
 		 432 aa  300  5e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0816139  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  47.09 
 
 		 489 aa  299  9e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  47.09 
 
 		 489 aa  298  1e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  46.81 
 
 		 414 aa  295  9e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  46.53 
 
 		 433 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  46.83 
 
 		 439 aa  295  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  46.81 
 
 		 414 aa  294  2e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  48.59 
 
 		 432 aa  294  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  44.28 
 
 		 444 aa  293  4e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  50.73 
 
 		 433 aa  292  9e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0940  GTP-binding proten HflX  49.72 
 
 		 454 aa  292  9e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  50.73 
 
 		 433 aa  292  9e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  44.64 
 
 		 429 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  43.58 
 
 		 442 aa  291  1e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  50.73 
 
 		 433 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1048  GTP-binding protein  49.45 
 
 		 454 aa  291  2e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  43.78 
 
 		 454 aa  291  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  43.35 
 
 		 454 aa  290  5.0000000000000004e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0326  GTP-binding protein HflX  46.56 
 
 		 428 aa  289  8e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  46.04 
 
 		 429 aa  288  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  48.58 
 
 		 440 aa  288  1e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1414  GTP-binding proten HflX  54.6 
 
 		 414 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000434774 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  45.21 
 
 		 481 aa  288  2e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  47.35 
 
 		 435 aa  287  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  46.28 
 
 		 426 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  46.28 
 
 		 426 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  46.28 
 
 		 426 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  46.28 
 
 		 426 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  46.28 
 
 		 426 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  46.28 
 
 		 426 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  46.28 
 
 		 426 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  46.28 
 
 		 426 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  53.97 
 
 		 392 aa  286  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  48.39 
 
 		 404 aa  286  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0493  putative GTPase HflX  47.22 
 
 		 433 aa  286  5.999999999999999e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0353897  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  53.35 
 
 		 404 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  46.67 
 
 		 441 aa  286  5.999999999999999e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  46.28 
 
 		 426 aa  286  7e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  46.28 
 
 		 426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  45.71 
 
 		 426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  53.33 
 
 		 387 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  53.33 
 
 		 392 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  53.33 
 
 		 387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  53.33 
 
 		 396 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  45.45 
 
 		 461 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  53.33 
 
 		 387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  53.33 
 
 		 387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>