More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1271 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1271  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 		 432 aa  857    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.51955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0252  GTP-binding protein, HSR1-related  65.02 
 
 		 442 aa  472  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.240813  normal  0.141615 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1932  small GTP-binding protein domain-containing protein  59.82 
 
 		 426 aa  438  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1450  GTP-binding protein, HSR1-related  56.2 
 
 		 442 aa  387  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.475087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0481  GTP-binding proten HflX  56.31 
 
 		 436 aa  385  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.738379  decreased coverage  0.000424503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2583  GTP-binding protein, HSR1-related  55.18 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0894246  normal  0.17165 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1842  GTP-binding protein, HSR1-related  54.79 
 
 		 444 aa  383  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4392  small GTP-binding protein  55.77 
 
 		 457 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1761  GTP-binding protein, HSR1-related  55.16 
 
 		 435 aa  381  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2868  GTP-binding proten HflX  54.79 
 
 		 455 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2877  GTP-binding protein, HSR1-related  53.61 
 
 		 457 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4074  putative GTP-binding protein (hflX)  55.15 
 
 		 459 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2595  GTP-binding protein, HSR1-related  53.61 
 
 		 434 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0324515 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1096  GTP-binding protein HSR1-related  52.83 
 
 		 465 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.774913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1685  small GTP-binding protein domain-containing protein  54.92 
 
 		 418 aa  374  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2142  GTP-binding protein HFLX  52.77 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501341  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2611  GTP-binding proten HflX  52.42 
 
 		 446 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1633  GTP-binding proten HflX  51.9 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192278  normal  0.293033 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1566  GTP-binding protein  52.66 
 
 		 415 aa  365  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  0.0486132 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1612  GTP-binding protein, HSR1-related  52.17 
 
 		 460 aa  368  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1820  GTP-binding proten HflX  53.04 
 
 		 441 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0332414  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3052  GTP-binding proten HflX  52.48 
 
 		 471 aa  363  3e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2825  GTP-binding proten HflX  52.48 
 
 		 471 aa  363  3e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.162481 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3123  GTP-binding protein HSR1-related  53.25 
 
 		 474 aa  362  5.0000000000000005e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406927 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0536  GTP-binding proten HflX  54.41 
 
 		 469 aa  362  6e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1449  small GTP-binding protein  48.2 
 
 		 450 aa  362  6e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.948671  hitchhiker  0.000728125 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1494  GTP-binding proten HflX  52.28 
 
 		 470 aa  362  6e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6545  GTP-binding proten HflX  53.9 
 
 		 471 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2207  GTP-binding protein HSR1-related  52.87 
 
 		 472 aa  362  8e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2844  putative GTP-binding protein  50 
 
 		 416 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1450  small GTP-binding protein  50 
 
 		 447 aa  362  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0438949 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2943  GTP-binding proten HflX  52.67 
 
 		 471 aa  360  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5943  GTP-binding proten HflX  54.39 
 
 		 474 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0068  GTP-binding proten HflX  52.03 
 
 		 474 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.943914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1526  GTP-binding proten HflX  51.72 
 
 		 466 aa  355  7.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1069  GTP-binding proten HflX  57.34 
 
 		 490 aa  355  1e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1494  GTP-binding protein, HSR1-related  52.04 
 
 		 448 aa  352  8e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.172375 
 
 
-
 
NC_004310  BR1110  GTP-binding protein, putative  56.51 
 
 		 472 aa  352  1e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.259751  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4123  small GTP-binding protein  50.12 
 
 		 435 aa  350  4e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.214153  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0625  GTP-binding proten HflX  46.54 
 
 		 457 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00182649  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1355  GTP-binding protein, HSR1-related  48.81 
 
 		 423 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.427111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2245  GTP-binding protein, HSR1-related  51.58 
 
 		 435 aa  342  7e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.157865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  44.39 
 
 		 433 aa  295  9e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  44.14 
 
 		 433 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0665  GTP-binding protein, HSR1-related  46.15 
 
 		 445 aa  295  2e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0655164  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  43.32 
 
 		 433 aa  288  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  43.77 
 
 		 433 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  43.77 
 
 		 433 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  43.77 
 
 		 433 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  44.27 
 
 		 414 aa  285  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  44.18 
 
 		 414 aa  283  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0278  GTP-binding protein, HSR1-related  46.78 
 
 		 432 aa  281  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.134684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  42.39 
 
 		 432 aa  280  4e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  42.78 
 
 		 441 aa  279  8e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  41.45 
 
 		 441 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0940  GTP-binding proten HflX  40.73 
 
 		 454 aa  275  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  43.12 
 
 		 433 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1048  GTP-binding protein  40.73 
 
 		 454 aa  274  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  42.96 
 
 		 421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  41.65 
 
 		 441 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  43.58 
 
 		 428 aa  273  5.000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  43.16 
 
 		 417 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  41.9 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  41.23 
 
 		 454 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  38.21 
 
 		 421 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  39.9 
 
 		 481 aa  269  7e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0069  GTP-binding protein  40.34 
 
 		 450 aa  267  2e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  41.97 
 
 		 454 aa  268  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0057  GTP-binding proten HflX  40.34 
 
 		 450 aa  268  2e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.583436  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  42.45 
 
 		 429 aa  265  8e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  41.41 
 
 		 440 aa  265  8.999999999999999e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  40.05 
 
 		 444 aa  264  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  40.52 
 
 		 489 aa  264  3e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  40.52 
 
 		 489 aa  263  4.999999999999999e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4684  GTP-binding proten HflX  43.51 
 
 		 433 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2589  GTP-binding protein, HSR1-related  42.12 
 
 		 382 aa  262  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  41.8 
 
 		 439 aa  262  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  39.29 
 
 		 429 aa  261  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  38.1 
 
 		 415 aa  261  2e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  39.86 
 
 		 461 aa  259  9e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0573  GTP-binding protein, HSR1-related  42.26 
 
 		 433 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  46.18 
 
 		 426 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4941  GTP-binding protein HflX  47.78 
 
 		 433 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0326  GTP-binding protein HflX  41.64 
 
 		 428 aa  255  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0493  putative GTPase HflX  44.21 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0353897  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07550  GTP-binding protein HflX  43.51 
 
 		 433 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  42.06 
 
 		 429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  41.73 
 
 		 429 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  40.85 
 
 		 426 aa  253  5.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  40.32 
 
 		 430 aa  253  5.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1560  GTP-binding proten HflX  43.25 
 
 		 432 aa  251  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000698014 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1885  GTP-binding protein HflX  43.25 
 
 		 432 aa  251  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0816139  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  40.85 
 
 		 426 aa  252  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  41.95 
 
 		 429 aa  251  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  43.35 
 
 		 521 aa  251  2e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  40.72 
 
 		 442 aa  251  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  48.38 
 
 		 435 aa  250  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2979  GTP-binding protein, HSR1-related  42.66 
 
 		 384 aa  249  5e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  48.38 
 
 		 432 aa  249  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32115  predicted protein  42.11 
 
 		 519 aa  249  5e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0250041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>