151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1426 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1426  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  100 
 
 
273 aa  548  1e-155  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0371925  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1898  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  58.67 
 
 
275 aa  296  2e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.186382 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1963  hypothetical protein  33.06 
 
 
298 aa  99  7e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1838  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  29.21 
 
 
311 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.396505 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2712  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.06 
 
 
310 aa  89  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3395  peptidase S66, LD-carboxypeptidase A  31.12 
 
 
321 aa  86.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3393  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.68 
 
 
344 aa  86.3  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04130  putative carboxypeptidase  27.66 
 
 
300 aa  85.9  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1854  hypothetical protein  30.17 
 
 
317 aa  84  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4434  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.8 
 
 
297 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7067  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.51 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4498  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.8 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3582  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.79 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149694 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2668  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.04 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0799  hypothetical protein  27.64 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0083  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.82 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3478  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.66 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3542  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.66 
 
 
321 aa  79  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5153  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.06 
 
 
304 aa  78.6  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04801  putative carboxypeptidase  26.35 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.957577  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0082  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  26.91 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.176259  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5012  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  28.87 
 
 
299 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.915313  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05181  putative carboxypeptidase  25.36 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.171155  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4910  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27.27 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128851  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5967  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.48 
 
 
301 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0792878  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0455  hypothetical protein  26.16 
 
 
289 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.517276  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0590  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.27 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00406541  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4926  twin-arginine translocation pathway signal  26.52 
 
 
361 aa  75.9  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3337  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  28.93 
 
 
309 aa  75.9  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05111  putative carboxypeptidase  25.63 
 
 
289 aa  75.5  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0583288  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2030  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  29.15 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.630907  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1218  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  26.61 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.190854  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0209  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.33 
 
 
303 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4176  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  24.66 
 
 
357 aa  70.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3416  carboxypeptidase  27.49 
 
 
292 aa  70.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1985  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  26.79 
 
 
339 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06571  putative carboxypeptidase  29.1 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0601  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  25.3 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.62332  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5403  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.27 
 
 
285 aa  69.3  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.381396 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3460  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.07 
 
 
311 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0181696 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0123  hypothetical protein  21.77 
 
 
297 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0745  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  25.26 
 
 
316 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0584  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  24.9 
 
 
348 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4459  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  23.65 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2360  L,D-carboxypeptidase A  26.36 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.970638  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17261  hypothetical protein  26.29 
 
 
299 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1787  hypothetical protein  22.79 
 
 
291 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05101  putative carboxypeptidase  22.79 
 
 
291 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.252478 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4290  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  26.07 
 
 
299 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2396  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  26.62 
 
 
296 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.309773  normal  0.445345 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1871  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  27.72 
 
 
313 aa  63.9  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7443  putative muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  27.53 
 
 
310 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4962  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  27.8 
 
 
315 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04561  putative carboxypeptidase  28.21 
 
 
300 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2258  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  25.91 
 
 
363 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000465368 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4799  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  29 
 
 
312 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.26616 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0622  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.81 
 
 
312 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4674  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  29 
 
 
312 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4852  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29 
 
 
312 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1087  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  23.44 
 
 
305 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1956  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.87 
 
 
319 aa  61.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131813 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0362  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  24.45 
 
 
298 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01167  L,D-carboxypeptidase A  27.62 
 
 
304 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.187691  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2456  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  27.62 
 
 
304 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000123974  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0687  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27.72 
 
 
305 aa  59.7  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000215417  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0548  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  29.25 
 
 
297 aa  59.7  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01177  hypothetical protein  27.62 
 
 
304 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1296  L,D-carboxypeptidase A  27.62 
 
 
304 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0534846  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1337  L,D-carboxypeptidase A  27.62 
 
 
304 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0411006  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2433  L,D-carboxypeptidase A  27.62 
 
 
304 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.110554  normal  0.383689 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1418  hypothetical protein  24.52 
 
 
306 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2034  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  26.67 
 
 
308 aa  58.9  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.146137 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68670  putative carboxypeptidase  23.45 
 
 
307 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4808  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  29.15 
 
 
359 aa  58.9  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1998  L,D-carboxypeptidase A  27.2 
 
 
304 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1482  hypothetical protein  24.52 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1282  hypothetical protein  25 
 
 
306 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1384  hypothetical protein  25 
 
 
306 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.202295  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1525  hypothetical protein  25 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6860  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  24.29 
 
 
348 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143342 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1289  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  23.3 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0048  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  26.41 
 
 
314 aa  58.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.616431  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1456  hypothetical protein  25 
 
 
306 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.946186 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1518  L,D-carboxypeptidase A  26.78 
 
 
304 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.131299  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3925  hypothetical protein  24.04 
 
 
306 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5942  hypothetical protein  23.79 
 
 
307 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1333  L,D-carboxypeptidase A  26.78 
 
 
304 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000186557  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1956  L,D-carboxypeptidase A  26.78 
 
 
304 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0449281  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1254  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  24.52 
 
 
306 aa  56.6  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203057  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0621  hypothetical protein  26.6 
 
 
294 aa  56.6  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.859516  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0854  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  27.02 
 
 
312 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19840  uncharacterized MccF-like protein (microcin C7 resistance)  29.11 
 
 
306 aa  57  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.261069  decreased coverage  0.0000458463 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1679  L,D-carboxypeptidase A  26.56 
 
 
304 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000833472  normal  0.396498 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2797  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  28.02 
 
 
321 aa  56.6  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154146  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1415  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  27.09 
 
 
314 aa  56.2  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3212  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  26.57 
 
 
325 aa  55.8  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1593  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  27.12 
 
 
328 aa  55.8  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1938  L,D-carboxypeptidase A  26.36 
 
 
304 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2281  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  27.12 
 
 
328 aa  55.8  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0516375  normal  0.142615 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1256  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  24.04 
 
 
306 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>