More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2829 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2829  phosphoglyceromutase  100 
 
 		 228 aa  466  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0215122 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3265  phosphoglyceromutase  81.58 
 
 		 228 aa  388  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.602214  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3133  phosphoglyceromutase  79.39 
 
 		 228 aa  374  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.121125  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1210  phosphoglycerate mutase 1 family protein  64.89 
 
 		 237 aa  305  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.727202  normal  0.54379 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  60.43 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  61.3 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  59.31 
 
 		 247 aa  279  2e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  57.58 
 
 		 247 aa  278  7e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1264  phosphoglyceromutase  58.26 
 
 		 230 aa  276  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.500435  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4043  phosphoglyceromutase  61.57 
 
 		 247 aa  274  9e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04761  phosphoglyceromutase  58.77 
 
 		 249 aa  273  1.0000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.151884  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0209  phosphoglyceromutase  55.84 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0228  phosphoglyceromutase  55.84 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314651 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  58.01 
 
 		 249 aa  272  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  58.01 
 
 		 249 aa  272  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  58.01 
 
 		 249 aa  272  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  58.01 
 
 		 249 aa  272  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  58.01 
 
 		 249 aa  272  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  58.01 
 
 		 249 aa  272  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  58.01 
 
 		 249 aa  272  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2498  phosphoglycerate mutase  57.64 
 
 		 243 aa  272  3e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.956409  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0353  phosphoglyceromutase  55.84 
 
 		 267 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.136198 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  57.14 
 
 		 247 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1198  phosphoglyceromutase  58.77 
 
 		 249 aa  272  4.0000000000000004e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0829  phosphoglycerate mutase 1 family protein  59.91 
 
 		 250 aa  271  6e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0713  phosphoglycerate mutase  58.33 
 
 		 247 aa  271  7e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  57.83 
 
 		 270 aa  270  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  57.83 
 
 		 270 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0651  phosphoglycerate mutase 1 family  59.35 
 
 		 248 aa  270  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  57.14 
 
 		 248 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  57.83 
 
 		 248 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08870  phosphoglycerate mutase  57.01 
 
 		 248 aa  269  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0709745  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  57.83 
 
 		 270 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  54.98 
 
 		 249 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  55.65 
 
 		 248 aa  269  2.9999999999999997e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  57.14 
 
 		 270 aa  268  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  56.71 
 
 		 248 aa  268  5e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  56.52 
 
 		 247 aa  267  8e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1323  phosphoglyceromutase  56.71 
 
 		 232 aa  267  8.999999999999999e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  56.52 
 
 		 293 aa  267  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  57.39 
 
 		 247 aa  267  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  54.98 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  57.39 
 
 		 250 aa  266  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  56.71 
 
 		 436 aa  266  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  57.14 
 
 		 248 aa  265  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  55.41 
 
 		 247 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  56.09 
 
 		 247 aa  264  7e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0382  phosphoglyceromutase  53.25 
 
 		 233 aa  264  8e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000158112  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  56.71 
 
 		 248 aa  263  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0847  phosphoglyceromutase  56.88 
 
 		 248 aa  263  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0659  phosphoglycerate mutase  58.8 
 
 		 248 aa  263  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0266  phosphoglyceromutase  55.84 
 
 		 248 aa  263  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0672  phosphoglycerate mutase  58.8 
 
 		 248 aa  263  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  55.22 
 
 		 250 aa  263  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0496  phosphoglycerate mutase 1 family  57.4 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0652  phosphoglycerate mutase  58.33 
 
 		 248 aa  262  4e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4181  phosphoglyceromutase  56.28 
 
 		 248 aa  262  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03720  phosphoglycerate mutase  57.78 
 
 		 252 aa  261  4.999999999999999e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00729363  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0084  phosphoglycerate mutase 1 family protein  58.06 
 
 		 250 aa  261  4.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0468  phosphoglyceromutase  58.77 
 
 		 333 aa  261  4.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.835759  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  55.22 
 
 		 251 aa  261  6.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  56.96 
 
 		 247 aa  261  8.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0994  phosphoglycerate mutase 1 family  55.35 
 
 		 249 aa  260  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3004  phosphoglycerate mutase  55.65 
 
 		 253 aa  260  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0298836  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02670  phosphoglycerate mutase  57.6 
 
 		 249 aa  259  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0891  phosphoglyceromutase  57.87 
 
 		 250 aa  259  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00049207 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  56.09 
 
 		 247 aa  259  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  53.28 
 
 		 247 aa  259  3e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2911  phosphoglyceromutase  56.25 
 
 		 247 aa  259  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8222  phosphoglyceromutase  57.34 
 
 		 251 aa  259  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0179  phosphoglycerate mutase 1 family  59.29 
 
 		 229 aa  259  3e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00124281  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0732  phosphoglycerate mutase 1 family  56.54 
 
 		 248 aa  259  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2972  phosphoglycerate mutase 1 family  55.81 
 
 		 247 aa  258  7e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  53.3 
 
 		 253 aa  257  1e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  54.11 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1653  phosphoglyceromutase  55.26 
 
 		 229 aa  256  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  52.86 
 
 		 229 aa  256  3e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31910  phosphoglycerate mutase  54.67 
 
 		 251 aa  256  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  54.78 
 
 		 247 aa  255  4e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  55.65 
 
 		 247 aa  255  5e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03670  phosphoglycerate mutase  57.87 
 
 		 251 aa  254  6e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.906966  normal  0.209214 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1948  phosphoglyceromutase  55.26 
 
 		 229 aa  254  8e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3501  phosphoglycerate mutase 1 family  53.28 
 
 		 234 aa  254  9e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0405653  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  54.59 
 
 		 248 aa  254  9e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3570  phosphoglycerate mutase 1 family  53.51 
 
 		 234 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  53.98 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  53.98 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  53.98 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2086  phosphoglycerate mutase 1 family  56.02 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.574937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  53.98 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  53.98 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  53.98 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  53.98 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1072  phosphoglyceromutase  55.7 
 
 		 249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.095004  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6148  phosphoglyceromutase  59.21 
 
 		 245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.334482  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  53.98 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  53.48 
 
 		 249 aa  252  3e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3765  phosphoglycerate mutase  53.28 
 
 		 240 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  54.35 
 
 		 248 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  53.54 
 
 		 250 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>