46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1092 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1092  membrane protein  100 
 
 		 277 aa  554  1e-157  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2353  hypothetical protein  38.98 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  30.86 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  34.95 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  30.32 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  33.1 
 
 		 250 aa  53.5  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  34.06 
 
 		 239 aa  53.1  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  31.97 
 
 		 997 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  28.57 
 
 		 234 aa  53.1  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  28.16 
 
 		 240 aa  52.8  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  29.78 
 
 		 240 aa  52.4  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  37.06 
 
 		 250 aa  52  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  33.09 
 
 		 248 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  34.62 
 
 		 255 aa  49.3  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0244  outer membrane protein  36.36 
 
 		 241 aa  48.9  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  27.59 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  34.9 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  30.41 
 
 		 453 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  26.63 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1437  hypothetical protein  32.91 
 
 		 223 aa  47.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  31.39 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1088  porin  56.52 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4374  putative outer-membrane protein  29.19 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0925  porin  35.81 
 
 		 243 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.743956  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1561  outer membrane protein  43.66 
 
 		 212 aa  47  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1234  porin  56.52 
 
 		 211 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248035  hitchhiker  0.0000166827 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2145  outer membrane protein  35.42 
 
 		 274 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.225218  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  36.07 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  32 
 
 		 240 aa  46.2  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  26.15 
 
 		 283 aa  46.2  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  29.07 
 
 		 228 aa  45.8  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  33.54 
 
 		 238 aa  45.8  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  28.76 
 
 		 454 aa  45.4  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2756  putative outer membrane protein  28.32 
 
 		 247 aa  45.8  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841875  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  28.29 
 
 		 449 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32.58 
 
 		 207 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  35.37 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  26.82 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  27.27 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  29.32 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0072  outer membrane immunogenic protein  26.72 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.17135e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6718  hypothetical protein  27.75 
 
 		 550 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0901  outer membrane autotransporter  28.26 
 
 		 638 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4129  putative outer membrane protein  28.57 
 
 		 250 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  26.9 
 
 		 225 aa  42.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  29.77 
 
 		 566 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>