86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4763 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4763  inner membrane protein YtfF  100 
 
 		 321 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4798  inner membrane protein YtfF  99.69 
 
 		 321 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4678  inner membrane protein YtfF  99.69 
 
 		 321 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.121802  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4668  inner membrane protein YtfF  99.69 
 
 		 321 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4818  hypothetical protein  99.38 
 
 		 321 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.451451  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04082  predicted inner membrane protein  81.88 
 
 		 324 aa  525  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0217591  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04045  hypothetical protein  81.88 
 
 		 324 aa  525  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0254567  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4689  hypothetical protein  81.88 
 
 		 321 aa  524  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.16874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3796  hypothetical protein  81.88 
 
 		 321 aa  525  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0293258  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3783  protein of unknown function DUF6 transmembrane  81.88 
 
 		 321 aa  521  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.242799  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5727  hypothetical protein  81.88 
 
 		 321 aa  522  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.229908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4751  hypothetical protein  81.56 
 
 		 321 aa  522  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.289249  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4779  hypothetical protein  81.88 
 
 		 321 aa  522  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00613349  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4464  hypothetical protein  81.88 
 
 		 321 aa  522  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577375  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0381  hypothetical protein  81.19 
 
 		 321 aa  503  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.822543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2538  hypothetical protein  64.8 
 
 		 321 aa  418  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.975656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1790  protein of unknown function DUF6 transmembrane  63.78 
 
 		 325 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1392  hypothetical protein  66.45 
 
 		 323 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0510  hypothetical protein  58.47 
 
 		 322 aa  358  9.999999999999999e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00686238 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3644  hypothetical protein  57.1 
 
 		 347 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.41 
 
 		 327 aa  335  3.9999999999999995e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1271  hypothetical protein  47.28 
 
 		 327 aa  250  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3880  hypothetical protein  35.78 
 
 		 313 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1315  hypothetical protein  35.42 
 
 		 324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.15 
 
 		 329 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633325  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1280  hypothetical protein  35.49 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162856  normal  0.301034 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2409  integral membrane protein  35.71 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5306  hypothetical protein  35.29 
 
 		 327 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2556  integral membrane protein  35.71 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1529  hypothetical protein  35.71 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.326947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2463  integral membrane protein  35.71 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.126131  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2029  hypothetical protein  35.71 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2016  hypothetical protein  35.69 
 
 		 321 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1300  hypothetical protein  35.4 
 
 		 322 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2052  hypothetical protein  35.71 
 
 		 322 aa  156  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0439765  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3283  hypothetical protein  35.4 
 
 		 322 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793801  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2432  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.98 
 
 		 325 aa  155  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.532838  normal  0.11306 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6081  hypothetical protein  35.69 
 
 		 321 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1996  hypothetical protein  35.69 
 
 		 321 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269533  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.48 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1460  hypothetical protein  35.33 
 
 		 319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.424115 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2029  hypothetical protein  36.34 
 
 		 323 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0982031  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1898  hypothetical protein  35.53 
 
 		 324 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1705  DMT family permease  34.24 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0082  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.85 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1857  transmembrane protein  32.3 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0233  putative integral membrane transmembrane protein  35.22 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1369  hypothetical protein  31.8 
 
 		 314 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1428  hypothetical protein  32.91 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113552  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2508  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.86 
 
 		 320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1305  putative transmembrane protein  32.39 
 
 		 314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.508017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1748  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.2 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0355136 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1897  hypothetical protein  33.87 
 
 		 310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0911  hypothetical protein  30.35 
 
 		 314 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0952  hypothetical protein  35.31 
 
 		 328 aa  125  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.330098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0727  hypothetical protein  31.86 
 
 		 325 aa  122  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563319  normal  0.0319705 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3016  putative transmembrane protein  32.7 
 
 		 303 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2678  hypothetical protein  29.07 
 
 		 321 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1941  hypothetical protein  28.3 
 
 		 315 aa  102  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.205515  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0303  hypothetical protein  27.64 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.277394  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3714  putative transmembrane protein  31.16 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.543491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04617  integral membrane protein  29.33 
 
 		 400 aa  95.9  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.938571  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5570  putative transmembrane protein  31.29 
 
 		 317 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0431678 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3565  hypothetical protein  26.09 
 
 		 324 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  24.05 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  27.07 
 
 		 299 aa  53.1  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  30.91 
 
 		 313 aa  50.4  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.42 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.38 
 
 		 286 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  28.16 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  30 
 
 		 301 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  26.7 
 
 		 329 aa  46.2  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.3 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.3 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  30.43 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  25.77 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  23.17 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  25.45 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  25.45 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  24.85 
 
 		 302 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  23.6 
 
 		 299 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6627  hypothetical protein  32.81 
 
 		 299 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  23.6 
 
 		 299 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  23.6 
 
 		 299 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  22.56 
 
 		 302 aa  42.7  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0463  hypothetical protein  20.59 
 
 		 289 aa  42.7  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>