92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A4464 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_4779  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  634    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00613349  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4464  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  634    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577375  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04045  hypothetical protein  99.07 
 
 		 324 aa  630  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0254567  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04082  predicted inner membrane protein  99.07 
 
 		 324 aa  630  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0217591  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5727  hypothetical protein  98.75 
 
 		 321 aa  627  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.229908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4689  hypothetical protein  99.38 
 
 		 321 aa  629  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.16874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3796  hypothetical protein  99.07 
 
 		 321 aa  630  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0293258  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3783  protein of unknown function DUF6 transmembrane  99.07 
 
 		 321 aa  626  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.242799  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4751  hypothetical protein  98.13 
 
 		 321 aa  626  1e-178  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.289249  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4678  inner membrane protein YtfF  81.88 
 
 		 321 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.121802  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4668  inner membrane protein YtfF  81.88 
 
 		 321 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4763  inner membrane protein YtfF  81.88 
 
 		 321 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4798  inner membrane protein YtfF  81.56 
 
 		 321 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4818  hypothetical protein  81.88 
 
 		 321 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.451451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0381  hypothetical protein  83.49 
 
 		 321 aa  510  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.822543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2538  hypothetical protein  68.17 
 
 		 321 aa  425  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.975656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1790  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.56 
 
 		 325 aa  411  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1392  hypothetical protein  66.12 
 
 		 323 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0510  hypothetical protein  58.79 
 
 		 322 aa  368  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00686238 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.99 
 
 		 327 aa  347  1e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3644  hypothetical protein  53.16 
 
 		 347 aa  331  1e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1271  hypothetical protein  45.37 
 
 		 327 aa  244  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.16 
 
 		 329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633325  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3880  hypothetical protein  35.22 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1315  hypothetical protein  33.94 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1460  hypothetical protein  34.18 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.424115 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1280  hypothetical protein  33.23 
 
 		 327 aa  142  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162856  normal  0.301034 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5306  hypothetical protein  33.44 
 
 		 327 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2556  integral membrane protein  32.12 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2029  hypothetical protein  32.12 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1529  hypothetical protein  32.12 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.326947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2409  integral membrane protein  31.82 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2463  integral membrane protein  32.12 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.126131  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2016  hypothetical protein  33.13 
 
 		 321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1300  hypothetical protein  31.82 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3283  hypothetical protein  31.82 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793801  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2052  hypothetical protein  32.12 
 
 		 322 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0439765  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1996  hypothetical protein  33.13 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269533  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6081  hypothetical protein  33.13 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1857  transmembrane protein  32.81 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2432  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.2 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.532838  normal  0.11306 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0911  hypothetical protein  31.82 
 
 		 314 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1428  hypothetical protein  32.91 
 
 		 313 aa  133  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113552  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1705  DMT family permease  32.41 
 
 		 325 aa  132  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.3 
 
 		 326 aa  132  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2029  hypothetical protein  32.61 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0982031  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1748  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.29 
 
 		 316 aa  129  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0355136 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1898  hypothetical protein  32.31 
 
 		 324 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1305  putative transmembrane protein  30.86 
 
 		 314 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.508017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0082  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.68 
 
 		 326 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0233  putative integral membrane transmembrane protein  32.08 
 
 		 326 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1369  hypothetical protein  31.58 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2508  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.79 
 
 		 320 aa  124  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3016  putative transmembrane protein  31.11 
 
 		 303 aa  123  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1897  hypothetical protein  31.95 
 
 		 310 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0727  hypothetical protein  28.93 
 
 		 325 aa  112  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563319  normal  0.0319705 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2678  hypothetical protein  30.48 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0952  hypothetical protein  30.63 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.330098  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0303  hypothetical protein  25.78 
 
 		 341 aa  96.3  6e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.277394  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3565  hypothetical protein  26.01 
 
 		 324 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1941  hypothetical protein  25.87 
 
 		 315 aa  92.4  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.205515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04617  integral membrane protein  28.72 
 
 		 400 aa  89.7  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.938571  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3714  putative transmembrane protein  27.84 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.543491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5570  putative transmembrane protein  27.78 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0431678 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  23.15 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  24.54 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.5 
 
 		 305 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.5 
 
 		 305 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  30.92 
 
 		 301 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  24.24 
 
 		 302 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  24.24 
 
 		 302 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  31.5 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  23.03 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  24.07 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  24.07 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  24.07 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  24.7 
 
 		 302 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  24.69 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.52 
 
 		 294 aa  46.6  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.93 
 
 		 286 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  24.51 
 
 		 296 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  24.4 
 
 		 302 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.44 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  27.13 
 
 		 315 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0790  multidrug ABC transporter permease  24.6 
 
 		 154 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.544312  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1082  hypothetical protein  24.6 
 
 		 154 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0979018  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  25.24 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  23.46 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  24.28 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  23.24 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2469  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.38 
 
 		 293 aa  43.9  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17200  predicted permease, DMT superfamily  29.21 
 
 		 358 aa  43.1  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0071959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>