92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2538 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2538  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  634    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.975656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1790  protein of unknown function DUF6 transmembrane  76.66 
 
 		 325 aa  503  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1392  hypothetical protein  78.18 
 
 		 323 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4689  hypothetical protein  68.17 
 
 		 321 aa  426  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.16874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4779  hypothetical protein  68.17 
 
 		 321 aa  425  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00613349  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4464  hypothetical protein  68.17 
 
 		 321 aa  425  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577375  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5727  hypothetical protein  68.49 
 
 		 321 aa  424  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.229908  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3783  protein of unknown function DUF6 transmembrane  67.85 
 
 		 321 aa  421  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.242799  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4751  hypothetical protein  67.85 
 
 		 321 aa  422  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.289249  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3796  hypothetical protein  67.52 
 
 		 321 aa  424  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0293258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04045  hypothetical protein  67.52 
 
 		 324 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0254567  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04082  predicted inner membrane protein  67.52 
 
 		 324 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0217591  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4763  inner membrane protein YtfF  64.8 
 
 		 321 aa  418  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4798  inner membrane protein YtfF  64.49 
 
 		 321 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4678  inner membrane protein YtfF  64.8 
 
 		 321 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.121802  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4668  inner membrane protein YtfF  64.8 
 
 		 321 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0381  hypothetical protein  68.04 
 
 		 321 aa  416  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.822543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4818  hypothetical protein  64.8 
 
 		 321 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.451451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  72.2 
 
 		 327 aa  411  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0510  hypothetical protein  61.39 
 
 		 322 aa  386  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00686238 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3644  hypothetical protein  58.04 
 
 		 347 aa  358  5e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1271  hypothetical protein  49.52 
 
 		 327 aa  275  6e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3880  hypothetical protein  37.5 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1460  hypothetical protein  35.94 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.424115 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1857  transmembrane protein  33.64 
 
 		 319 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.66 
 
 		 329 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633325  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1315  hypothetical protein  34.81 
 
 		 324 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1369  hypothetical protein  34.58 
 
 		 314 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1305  putative transmembrane protein  33.02 
 
 		 314 aa  142  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.508017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2432  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.05 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.532838  normal  0.11306 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2409  integral membrane protein  32.59 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1428  hypothetical protein  32.81 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113552  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2463  integral membrane protein  32.59 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.126131  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2029  hypothetical protein  32.59 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2556  integral membrane protein  32.59 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2052  hypothetical protein  32.91 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0439765  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1529  hypothetical protein  32.59 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.326947  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3283  hypothetical protein  32.27 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793801  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1300  hypothetical protein  32.27 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1705  DMT family permease  34.83 
 
 		 325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5306  hypothetical protein  31.83 
 
 		 327 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1280  hypothetical protein  31.73 
 
 		 327 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162856  normal  0.301034 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2016  hypothetical protein  31.82 
 
 		 321 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6081  hypothetical protein  33.12 
 
 		 321 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1996  hypothetical protein  33.12 
 
 		 321 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269533  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1898  hypothetical protein  32.58 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0082  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.7 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1748  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.17 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0355136 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2029  hypothetical protein  32.15 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0982031  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0233  putative integral membrane transmembrane protein  33.12 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3016  putative transmembrane protein  34.7 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0911  hypothetical protein  28.57 
 
 		 314 aa  125  9e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0727  hypothetical protein  30.28 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563319  normal  0.0319705 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2508  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.77 
 
 		 320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0952  hypothetical protein  31.09 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.330098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1897  hypothetical protein  33.23 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2678  hypothetical protein  30.79 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04617  integral membrane protein  28.76 
 
 		 400 aa  91.7  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.938571  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0303  hypothetical protein  27.56 
 
 		 341 aa  91.3  2e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.277394  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1941  hypothetical protein  27.81 
 
 		 315 aa  88.6  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.205515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3714  putative transmembrane protein  28.18 
 
 		 322 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.543491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5570  putative transmembrane protein  27.36 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0431678 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3565  hypothetical protein  24.76 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2469  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.72 
 
 		 293 aa  49.7  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4920  EamA family protein  23.62 
 
 		 301 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  24.37 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  27.93 
 
 		 304 aa  46.6  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  26.21 
 
 		 299 aa  46.2  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  34.52 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4910  transporter, EamA family  23.12 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  32.73 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  24.22 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  34.91 
 
 		 301 aa  43.9  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  23.74 
 
 		 303 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  23.74 
 
 		 303 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  26.56 
 
 		 299 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  23.74 
 
 		 303 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  26.56 
 
 		 299 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  26.56 
 
 		 299 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  23.74 
 
 		 303 aa  43.5  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  23.74 
 
 		 303 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  23.1 
 
 		 302 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  23.74 
 
 		 303 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  23.74 
 
 		 303 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0790  multidrug ABC transporter permease  26.56 
 
 		 154 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.544312  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1082  hypothetical protein  26.56 
 
 		 154 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0979018  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  23.74 
 
 		 303 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  27.34 
 
 		 299 aa  42.7  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  28.43 
 
 		 311 aa  42.7  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  23.74 
 
 		 303 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  23.74 
 
 		 303 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>