95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0233 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0233  putative integral membrane transmembrane protein  100 
 
 		 326 aa  628  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  84.31 
 
 		 326 aa  541  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0082  protein of unknown function DUF6 transmembrane  84.31 
 
 		 326 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1857  transmembrane protein  52.55 
 
 		 319 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1460  hypothetical protein  52.58 
 
 		 319 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.424115 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1315  hypothetical protein  54.3 
 
 		 324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2016  hypothetical protein  53.64 
 
 		 321 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5306  hypothetical protein  52.98 
 
 		 327 aa  294  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6081  hypothetical protein  53.31 
 
 		 321 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1996  hypothetical protein  53.31 
 
 		 321 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269533  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1369  hypothetical protein  54.07 
 
 		 314 aa  293  4e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2052  hypothetical protein  53.97 
 
 		 322 aa  292  6e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0439765  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2556  integral membrane protein  53.64 
 
 		 322 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2463  integral membrane protein  53.64 
 
 		 322 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.126131  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1529  hypothetical protein  53.64 
 
 		 322 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.326947  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2029  hypothetical protein  53.64 
 
 		 322 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1300  hypothetical protein  53.31 
 
 		 322 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2409  integral membrane protein  53.31 
 
 		 322 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3283  hypothetical protein  53.31 
 
 		 322 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793801  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1280  hypothetical protein  52.98 
 
 		 327 aa  287  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162856  normal  0.301034 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1898  hypothetical protein  54.07 
 
 		 324 aa  285  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2029  hypothetical protein  54.87 
 
 		 323 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0982031  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1305  putative transmembrane protein  53.75 
 
 		 314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.508017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1705  DMT family permease  55.08 
 
 		 325 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2432  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.98 
 
 		 325 aa  278  8e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.532838  normal  0.11306 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0952  hypothetical protein  55.52 
 
 		 328 aa  265  5.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.330098  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1428  hypothetical protein  51.48 
 
 		 313 aa  263  4e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113552  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1748  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.84 
 
 		 316 aa  246  4.9999999999999997e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0355136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3880  hypothetical protein  47.1 
 
 		 313 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2508  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.84 
 
 		 320 aa  230  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0727  hypothetical protein  49.32 
 
 		 325 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563319  normal  0.0319705 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0911  hypothetical protein  44 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04617  integral membrane protein  45.59 
 
 		 400 aa  171  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.938571  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0510  hypothetical protein  39.23 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00686238 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3644  hypothetical protein  40.06 
 
 		 347 aa  163  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1271  hypothetical protein  38.66 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1790  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.92 
 
 		 325 aa  152  7e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4798  inner membrane protein YtfF  36.16 
 
 		 321 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4763  inner membrane protein YtfF  35.85 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.62 
 
 		 329 aa  146  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633325  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4678  inner membrane protein YtfF  35.85 
 
 		 321 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.121802  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4668  inner membrane protein YtfF  35.85 
 
 		 321 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4818  hypothetical protein  35.85 
 
 		 321 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.451451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1897  hypothetical protein  36.22 
 
 		 310 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3016  putative transmembrane protein  35.48 
 
 		 303 aa  142  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4689  hypothetical protein  32.39 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.16874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3796  hypothetical protein  32.39 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0293258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04045  hypothetical protein  32.39 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0254567  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04082  predicted inner membrane protein  32.39 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0217591  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2538  hypothetical protein  33.12 
 
 		 321 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.975656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5727  hypothetical protein  32.39 
 
 		 321 aa  137  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.229908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4751  hypothetical protein  32.39 
 
 		 321 aa  136  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.289249  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3783  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.39 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.242799  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4779  hypothetical protein  32.08 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00613349  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4464  hypothetical protein  32.08 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577375  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1392  hypothetical protein  35.24 
 
 		 323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2678  hypothetical protein  33.94 
 
 		 321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.08 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0381  hypothetical protein  32.91 
 
 		 321 aa  122  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.822543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3714  putative transmembrane protein  30.69 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.543491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1941  hypothetical protein  27.78 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.205515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5570  putative transmembrane protein  29.31 
 
 		 317 aa  99.4  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0431678 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3565  hypothetical protein  30.87 
 
 		 324 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28529  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0303  hypothetical protein  24.19 
 
 		 341 aa  91.7  1e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.277394  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  28.57 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  26.87 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  26.46 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  27.46 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  26.91 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  27.12 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  27.12 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  26.78 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  25.35 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  27.11 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  25.35 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  24.91 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  25.35 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 		 286 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 		 312 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.4 
 
 		 287 aa  50.4  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1776  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.27 
 
 		 308 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  29.91 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17200  predicted permease, DMT superfamily  29.55 
 
 		 358 aa  49.7  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0071959  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.69 
 
 		 292 aa  49.7  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.29 
 
 		 305 aa  49.3  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.29 
 
 		 305 aa  49.3  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.55 
 
 		 325 aa  47  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.41 
 
 		 301 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  25.26 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1646  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.73 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  27.72 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  21.76 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  31.09 
 
 		 287 aa  43.1  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  24.42 
 
 		 296 aa  42.7  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  28.12 
 
 		 294 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>