70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1460 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1460  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  631  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.424115 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1857  transmembrane protein  87.74 
 
 		 319 aa  543  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1369  hypothetical protein  71.07 
 
 		 314 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1305  putative transmembrane protein  71.38 
 
 		 314 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.508017  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1428  hypothetical protein  73.27 
 
 		 313 aa  414  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113552  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1315  hypothetical protein  56.11 
 
 		 324 aa  347  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2052  hypothetical protein  55.17 
 
 		 322 aa  325  5e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0439765  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2409  integral membrane protein  55.17 
 
 		 322 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2029  hypothetical protein  54.86 
 
 		 322 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2463  integral membrane protein  54.86 
 
 		 322 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.126131  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2556  integral membrane protein  54.86 
 
 		 322 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1529  hypothetical protein  54.86 
 
 		 322 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.326947  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1300  hypothetical protein  54.55 
 
 		 322 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3283  hypothetical protein  54.55 
 
 		 322 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793801  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5306  hypothetical protein  54.63 
 
 		 327 aa  320  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1705  DMT family permease  55.83 
 
 		 325 aa  318  9e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2432  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.6 
 
 		 325 aa  315  6e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.532838  normal  0.11306 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6081  hypothetical protein  53.67 
 
 		 321 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1996  hypothetical protein  53.67 
 
 		 321 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269533  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2016  hypothetical protein  53.35 
 
 		 321 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1280  hypothetical protein  53.35 
 
 		 327 aa  309  4e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162856  normal  0.301034 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1898  hypothetical protein  53.35 
 
 		 324 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2029  hypothetical protein  53.14 
 
 		 323 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0982031  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0233  putative integral membrane transmembrane protein  52.58 
 
 		 326 aa  288  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.39 
 
 		 326 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0082  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.74 
 
 		 326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0952  hypothetical protein  52.08 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.330098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3880  hypothetical protein  45.77 
 
 		 313 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1748  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.03 
 
 		 316 aa  238  6.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0355136 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2508  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.13 
 
 		 320 aa  226  6e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0911  hypothetical protein  40.32 
 
 		 314 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0727  hypothetical protein  43.23 
 
 		 325 aa  209  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563319  normal  0.0319705 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1790  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.75 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04617  integral membrane protein  41.36 
 
 		 400 aa  181  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.938571  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3644  hypothetical protein  39.01 
 
 		 347 aa  176  7e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0510  hypothetical protein  38.36 
 
 		 322 aa  172  9e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00686238 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2538  hypothetical protein  35.94 
 
 		 321 aa  161  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.975656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1392  hypothetical protein  36.14 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4798  inner membrane protein YtfF  35.65 
 
 		 321 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4763  inner membrane protein YtfF  35.33 
 
 		 321 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1897  hypothetical protein  37.14 
 
 		 310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4668  inner membrane protein YtfF  35.33 
 
 		 321 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1271  hypothetical protein  37.89 
 
 		 327 aa  152  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4678  inner membrane protein YtfF  35.33 
 
 		 321 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.121802  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4818  hypothetical protein  35.33 
 
 		 321 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.451451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4689  hypothetical protein  34.38 
 
 		 321 aa  149  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.16874  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04082  predicted inner membrane protein  34.49 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0217591  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04045  hypothetical protein  34.49 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0254567  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3796  hypothetical protein  34.49 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0293258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0381  hypothetical protein  34.97 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.822543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4751  hypothetical protein  34.49 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.289249  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5727  hypothetical protein  34.49 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.229908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3016  putative transmembrane protein  34.6 
 
 		 303 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3783  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.18 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.242799  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4464  hypothetical protein  34.18 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577375  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4779  hypothetical protein  34.18 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00613349  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2678  hypothetical protein  34.38 
 
 		 321 aa  139  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.47 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.44 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633325  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3714  putative transmembrane protein  29.8 
 
 		 322 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.543491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3565  hypothetical protein  29.19 
 
 		 324 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5570  putative transmembrane protein  27.95 
 
 		 317 aa  99  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0431678 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1941  hypothetical protein  25.39 
 
 		 315 aa  97.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.205515  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0303  hypothetical protein  25.5 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.277394  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  27.24 
 
 		 302 aa  53.1  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  26.77 
 
 		 302 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  25.98 
 
 		 308 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7072  hypothetical protein  26.51 
 
 		 304 aa  47.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  26.78 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  25.1 
 
 		 302 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>