65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2052 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I2052  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  622  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0439765  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1300  hypothetical protein  97.52 
 
 
322 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2463  integral membrane protein  97.83 
 
 
322 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.126131  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1529  hypothetical protein  97.83 
 
 
322 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.326947  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2029  hypothetical protein  97.83 
 
 
322 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2556  integral membrane protein  97.83 
 
 
322 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3283  hypothetical protein  97.52 
 
 
322 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793801  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2409  integral membrane protein  97.2 
 
 
322 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5306  hypothetical protein  88.5 
 
 
327 aa  540  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2016  hypothetical protein  87.99 
 
 
321 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558153  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1996  hypothetical protein  87.99 
 
 
321 aa  534  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269533  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2029  hypothetical protein  87 
 
 
323 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0982031  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6081  hypothetical protein  87.99 
 
 
321 aa  534  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1280  hypothetical protein  85.45 
 
 
327 aa  533  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162856  normal  0.301034 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1898  hypothetical protein  88.35 
 
 
324 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1315  hypothetical protein  73.27 
 
 
324 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2432  protein of unknown function DUF6 transmembrane  72.4 
 
 
325 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.532838  normal  0.11306 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1705  DMT family permease  70.94 
 
 
325 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1857  transmembrane protein  55.17 
 
 
319 aa  328  5.0000000000000004e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1460  hypothetical protein  55.17 
 
 
319 aa  325  5e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.424115 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1369  hypothetical protein  53.33 
 
 
314 aa  311  7.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1305  putative transmembrane protein  53.02 
 
 
314 aa  305  8.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.508017  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3880  hypothetical protein  53 
 
 
313 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.47 
 
 
326 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0082  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.81 
 
 
326 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1428  hypothetical protein  55.56 
 
 
313 aa  285  7e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113552  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0233  putative integral membrane transmembrane protein  53.97 
 
 
326 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1748  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.85 
 
 
316 aa  229  4e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0355136 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0952  hypothetical protein  51.49 
 
 
328 aa  225  6e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.330098  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2508  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.66 
 
 
320 aa  217  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0911  hypothetical protein  41.69 
 
 
314 aa  209  7e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0727  hypothetical protein  43.31 
 
 
325 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563319  normal  0.0319705 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1271  hypothetical protein  40.69 
 
 
327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04617  integral membrane protein  41.78 
 
 
400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.938571  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3644  hypothetical protein  39.14 
 
 
347 aa  168  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379203  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1790  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.56 
 
 
325 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4798  inner membrane protein YtfF  36.02 
 
 
321 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4763  inner membrane protein YtfF  35.71 
 
 
321 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4678  inner membrane protein YtfF  35.71 
 
 
321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.121802  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4668  inner membrane protein YtfF  35.71 
 
 
321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4818  hypothetical protein  35.71 
 
 
321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.451451  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0510  hypothetical protein  36.22 
 
 
322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00686238 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1392  hypothetical protein  34.73 
 
 
323 aa  145  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04045  hypothetical protein  32.42 
 
 
324 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0254567  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1897  hypothetical protein  37.54 
 
 
310 aa  143  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.325254 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04082  predicted inner membrane protein  32.42 
 
 
324 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0217591  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3796  hypothetical protein  32.42 
 
 
321 aa  143  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0293258  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5727  hypothetical protein  32.11 
 
 
321 aa  142  8e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.229908  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4751  hypothetical protein  32.12 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.289249  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4689  hypothetical protein  32.12 
 
 
321 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.16874  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2538  hypothetical protein  32.91 
 
 
321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.975656  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3016  putative transmembrane protein  34.6 
 
 
303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4779  hypothetical protein  32.12 
 
 
321 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00613349  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4464  hypothetical protein  32.12 
 
 
321 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577375  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.29 
 
 
329 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633325  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3783  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.82 
 
 
321 aa  138  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.242799  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.06 
 
 
327 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0381  hypothetical protein  31.78 
 
 
321 aa  135  7.000000000000001e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.822543  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2678  hypothetical protein  34.59 
 
 
321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3714  putative transmembrane protein  30.46 
 
 
322 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.543491  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5570  putative transmembrane protein  30.23 
 
 
317 aa  95.9  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0431678 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1941  hypothetical protein  27.94 
 
 
315 aa  92.8  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.205515  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3565  hypothetical protein  28.53 
 
 
324 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28529  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0303  hypothetical protein  25.53 
 
 
341 aa  85.5  0.000000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.277394  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  24.46 
 
 
315 aa  42.7  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>