66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1315 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1315  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  630  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2432  protein of unknown function DUF6 transmembrane  79.88 
 
 		 325 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.532838  normal  0.11306 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1705  DMT family permease  79.75 
 
 		 325 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2409  integral membrane protein  72.96 
 
 		 322 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2052  hypothetical protein  73.27 
 
 		 322 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0439765  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1300  hypothetical protein  72.64 
 
 		 322 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2463  integral membrane protein  72.96 
 
 		 322 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.126131  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1529  hypothetical protein  72.96 
 
 		 322 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.326947  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3283  hypothetical protein  72.64 
 
 		 322 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793801  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2556  integral membrane protein  72.96 
 
 		 322 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2029  hypothetical protein  72.96 
 
 		 322 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2029  hypothetical protein  72.7 
 
 		 323 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0982031  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5306  hypothetical protein  74.27 
 
 		 327 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6081  hypothetical protein  73.38 
 
 		 321 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1996  hypothetical protein  73.38 
 
 		 321 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269533  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1898  hypothetical protein  74.68 
 
 		 324 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2016  hypothetical protein  73.38 
 
 		 321 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1280  hypothetical protein  70.55 
 
 		 327 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162856  normal  0.301034 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1857  transmembrane protein  57.55 
 
 		 319 aa  362  6e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1460  hypothetical protein  56.11 
 
 		 319 aa  347  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.424115 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1369  hypothetical protein  55.41 
 
 		 314 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1305  putative transmembrane protein  54.57 
 
 		 314 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.508017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3880  hypothetical protein  55.74 
 
 		 313 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1428  hypothetical protein  57.56 
 
 		 313 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113552  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.64 
 
 		 326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0082  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.98 
 
 		 326 aa  297  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0233  putative integral membrane transmembrane protein  54.3 
 
 		 326 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0952  hypothetical protein  52.88 
 
 		 328 aa  249  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.330098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2508  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.33 
 
 		 320 aa  233  5e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1748  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.45 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0355136 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0911  hypothetical protein  41.25 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0727  hypothetical protein  44.04 
 
 		 325 aa  205  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563319  normal  0.0319705 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3644  hypothetical protein  39.42 
 
 		 347 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04617  integral membrane protein  41.69 
 
 		 400 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.938571  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1790  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.58 
 
 		 325 aa  176  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1271  hypothetical protein  39.34 
 
 		 327 aa  168  9e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0510  hypothetical protein  36.48 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00686238 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4798  inner membrane protein YtfF  35.71 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4668  inner membrane protein YtfF  35.42 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4678  inner membrane protein YtfF  35.42 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.121802  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4818  hypothetical protein  35.42 
 
 		 321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.451451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4763  inner membrane protein YtfF  35.42 
 
 		 321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04082  predicted inner membrane protein  34.24 
 
 		 324 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0217591  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3796  hypothetical protein  34.24 
 
 		 321 aa  160  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0293258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04045  hypothetical protein  34.24 
 
 		 324 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0254567  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5727  hypothetical protein  33.93 
 
 		 321 aa  159  7e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.229908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4751  hypothetical protein  33.93 
 
 		 321 aa  159  9e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.289249  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4689  hypothetical protein  34.24 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.16874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3016  putative transmembrane protein  37.15 
 
 		 303 aa  158  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1392  hypothetical protein  37.22 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4779  hypothetical protein  33.94 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00613349  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4464  hypothetical protein  33.94 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577375  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3783  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.63 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.242799  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1897  hypothetical protein  38.29 
 
 		 310 aa  153  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2538  hypothetical protein  34.81 
 
 		 321 aa  152  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.975656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.05 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633325  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.06 
 
 		 327 aa  144  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0381  hypothetical protein  32.31 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.822543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2678  hypothetical protein  38.1 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3714  putative transmembrane protein  31.4 
 
 		 322 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.543491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5570  putative transmembrane protein  29.73 
 
 		 317 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0431678 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1941  hypothetical protein  28.62 
 
 		 315 aa  95.5  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.205515  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0303  hypothetical protein  23.48 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.277394  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3565  hypothetical protein  25.93 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28529  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  29.33 
 
 		 336 aa  47  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  25.18 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>