90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3644 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3644  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  671    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0510  hypothetical protein  77.81 
 
 		 322 aa  490  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00686238 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1790  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.12 
 
 		 325 aa  375  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2538  hypothetical protein  58.04 
 
 		 321 aa  358  5e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.975656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4668  inner membrane protein YtfF  57.1 
 
 		 321 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4678  inner membrane protein YtfF  57.1 
 
 		 321 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.121802  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4818  hypothetical protein  57.1 
 
 		 321 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.451451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4763  inner membrane protein YtfF  57.1 
 
 		 321 aa  342  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1392  hypothetical protein  62.14 
 
 		 323 aa  341  9e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4798  inner membrane protein YtfF  56.77 
 
 		 321 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04082  predicted inner membrane protein  52.81 
 
 		 324 aa  335  5.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0217591  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04045  hypothetical protein  52.81 
 
 		 324 aa  335  5.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0254567  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4689  hypothetical protein  53.48 
 
 		 321 aa  335  7e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.16874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3796  hypothetical protein  53.16 
 
 		 321 aa  335  9e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0293258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5727  hypothetical protein  53.48 
 
 		 321 aa  334  1e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.229908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4751  hypothetical protein  53.16 
 
 		 321 aa  334  2e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.289249  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4779  hypothetical protein  53.16 
 
 		 321 aa  331  1e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00613349  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4464  hypothetical protein  53.16 
 
 		 321 aa  331  1e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577375  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3783  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.16 
 
 		 321 aa  331  1e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.242799  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.95 
 
 		 327 aa  323  3e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0381  hypothetical protein  53.87 
 
 		 321 aa  313  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.822543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1271  hypothetical protein  57.37 
 
 		 327 aa  305  8.000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3880  hypothetical protein  38.96 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1315  hypothetical protein  39.42 
 
 		 324 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1460  hypothetical protein  39.01 
 
 		 319 aa  176  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.424115 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5306  hypothetical protein  38.75 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1280  hypothetical protein  39.87 
 
 		 327 aa  170  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162856  normal  0.301034 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.44 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2432  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.81 
 
 		 325 aa  169  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.532838  normal  0.11306 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2016  hypothetical protein  38.66 
 
 		 321 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6081  hypothetical protein  38.66 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1996  hypothetical protein  38.66 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269533  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1857  transmembrane protein  38.65 
 
 		 319 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2409  integral membrane protein  38.84 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2052  hypothetical protein  39.14 
 
 		 322 aa  168  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0439765  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1529  hypothetical protein  38.53 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.326947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2463  integral membrane protein  38.53 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.126131  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2029  hypothetical protein  38.53 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2556  integral membrane protein  38.53 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3283  hypothetical protein  38.23 
 
 		 322 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793801  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1300  hypothetical protein  38.23 
 
 		 322 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1898  hypothetical protein  38.92 
 
 		 324 aa  165  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0082  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.62 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1369  hypothetical protein  39.94 
 
 		 314 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2029  hypothetical protein  39.81 
 
 		 323 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0982031  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1305  putative transmembrane protein  38.63 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.508017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1705  DMT family permease  38.36 
 
 		 325 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1748  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.15 
 
 		 316 aa  155  8e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0355136 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1428  hypothetical protein  38.53 
 
 		 313 aa  153  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113552  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0233  putative integral membrane transmembrane protein  40.06 
 
 		 326 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0952  hypothetical protein  40.74 
 
 		 328 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.330098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.23 
 
 		 329 aa  142  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633325  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2508  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.31 
 
 		 320 aa  135  8e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0911  hypothetical protein  30.99 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3016  putative transmembrane protein  33.12 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0727  hypothetical protein  33.65 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563319  normal  0.0319705 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2678  hypothetical protein  33.97 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1897  hypothetical protein  33.12 
 
 		 310 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04617  integral membrane protein  33.12 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.938571  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3565  hypothetical protein  30.16 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28529  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0303  hypothetical protein  26.03 
 
 		 341 aa  103  6e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.277394  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1941  hypothetical protein  28.79 
 
 		 315 aa  96.3  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.205515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3714  putative transmembrane protein  28.91 
 
 		 322 aa  93.6  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.543491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5570  putative transmembrane protein  28 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0431678 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  25.41 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  24.34 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  24.34 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  24.01 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  24.34 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  24.01 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.5 
 
 		 286 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  24.09 
 
 		 308 aa  54.3  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  26.62 
 
 		 299 aa  50.4  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2469  protein of unknown function DUF6 transmembrane  19.84 
 
 		 293 aa  50.4  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  23.05 
 
 		 305 aa  49.7  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0463  hypothetical protein  22.71 
 
 		 289 aa  49.7  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  25.25 
 
 		 299 aa  46.6  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  24.22 
 
 		 299 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  25.97 
 
 		 289 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  26.97 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  22.43 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  24.16 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  25.64 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  27.7 
 
 		 293 aa  43.9  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  23.43 
 
 		 296 aa  43.5  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  25.45 
 
 		 301 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  26.67 
 
 		 301 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  23.15 
 
 		 299 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  23.15 
 
 		 299 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  23.15 
 
 		 299 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>