63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04617 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04617  integral membrane protein  100 
 
 		 400 aa  773    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.938571  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1748  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.34 
 
 		 316 aa  251  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0355136 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2508  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.92 
 
 		 320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0727  hypothetical protein  47.59 
 
 		 325 aa  208  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563319  normal  0.0319705 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0952  hypothetical protein  47.35 
 
 		 328 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.330098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1460  hypothetical protein  42.76 
 
 		 319 aa  189  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.424115 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1857  transmembrane protein  42.81 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1315  hypothetical protein  43.84 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0911  hypothetical protein  40.83 
 
 		 314 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2052  hypothetical protein  42.81 
 
 		 322 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0439765  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0082  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.29 
 
 		 326 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5306  hypothetical protein  40.61 
 
 		 327 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1369  hypothetical protein  41.26 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2016  hypothetical protein  39.93 
 
 		 321 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6081  hypothetical protein  39.93 
 
 		 321 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1996  hypothetical protein  39.93 
 
 		 321 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269533  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1280  hypothetical protein  39.94 
 
 		 327 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162856  normal  0.301034 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2029  hypothetical protein  41.1 
 
 		 322 aa  179  9e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2463  integral membrane protein  41.1 
 
 		 322 aa  179  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.126131  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2556  integral membrane protein  41.1 
 
 		 322 aa  179  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1529  hypothetical protein  41.1 
 
 		 322 aa  179  9e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.326947  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3283  hypothetical protein  40.75 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793801  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2409  integral membrane protein  41.1 
 
 		 322 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1300  hypothetical protein  40.75 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.06 
 
 		 326 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2432  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.09 
 
 		 325 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.532838  normal  0.11306 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1898  hypothetical protein  41.64 
 
 		 324 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1305  putative transmembrane protein  40.21 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.508017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2029  hypothetical protein  41.3 
 
 		 323 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0982031  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1705  DMT family permease  43.49 
 
 		 325 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0233  putative integral membrane transmembrane protein  45.22 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1428  hypothetical protein  44.17 
 
 		 313 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113552  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3880  hypothetical protein  34.71 
 
 		 313 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0510  hypothetical protein  34.34 
 
 		 322 aa  119  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00686238 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3644  hypothetical protein  34.41 
 
 		 347 aa  117  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1271  hypothetical protein  35.71 
 
 		 327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1790  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.33 
 
 		 325 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 		 329 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633325  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2538  hypothetical protein  29.84 
 
 		 321 aa  103  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.975656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4798  inner membrane protein YtfF  31.49 
 
 		 321 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4763  inner membrane protein YtfF  31.14 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4678  inner membrane protein YtfF  31.14 
 
 		 321 aa  99.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.121802  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4668  inner membrane protein YtfF  31.14 
 
 		 321 aa  99.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1392  hypothetical protein  32.49 
 
 		 323 aa  99  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4818  hypothetical protein  31.14 
 
 		 321 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.451451  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3783  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 		 321 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.242799  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4464  hypothetical protein  29.39 
 
 		 321 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577375  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4779  hypothetical protein  29.39 
 
 		 321 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00613349  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04082  predicted inner membrane protein  30.07 
 
 		 324 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0217591  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04045  hypothetical protein  30.07 
 
 		 324 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0254567  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5727  hypothetical protein  29.07 
 
 		 321 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.229908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3796  hypothetical protein  29.76 
 
 		 321 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0293258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4689  hypothetical protein  29.07 
 
 		 321 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.16874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4751  hypothetical protein  29.76 
 
 		 321 aa  96.7  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.289249  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.38 
 
 		 327 aa  88.6  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0381  hypothetical protein  27.37 
 
 		 321 aa  87.8  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.822543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1897  hypothetical protein  30.71 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2678  hypothetical protein  37.11 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3016  putative transmembrane protein  36.11 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5570  putative transmembrane protein  29.78 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0431678 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3714  putative transmembrane protein  28.25 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.543491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1941  hypothetical protein  26.59 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.205515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3565  hypothetical protein  25.8 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28529  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>