32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2461 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2461  CRISPR-associated Csm1 family protein  100 
 
 		 757 aa  1554    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0456597  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12837  hypothetical protein  37.03 
 
 		 812 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.867182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1756  CRISPR-associated Csm1 family protein  38.51 
 
 		 808 aa  503  1e-141  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1009  CRISPR-associated Csm1 family protein  29.05 
 
 		 717 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1097  metal dependent phosphohydrolase  29.22 
 
 		 735 aa  274  3e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1627  CRISPR-associated Csm1 family protein  27.4 
 
 		 780 aa  206  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2704  metal dependent phosphohydrolase  27.12 
 
 		 837 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.129115  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1670  metal dependent phosphohydrolase  30.28 
 
 		 757 aa  178  3e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1637  CRISPR-associated protein, Csm1 family  30.37 
 
 		 800 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.02785  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0215  Csm1 family CRISPR-associated protein  24.19 
 
 		 806 aa  169  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1349  CRISPR-associated Csm1 family protein  24.65 
 
 		 848 aa  162  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1388  metal dependent phosphohydrolase  24.87 
 
 		 830 aa  161  3e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1083  CRISPR-associated Csm1 family protein  26.42 
 
 		 838 aa  160  7e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.306115  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0699  CRISPR-associated protein, Csm1 family  27.54 
 
 		 808 aa  156  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.424994  decreased coverage  0.00221335 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1028  CRISPR-associated protein, Csm1 family  25.93 
 
 		 755 aa  155  2.9999999999999998e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00145134  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0612  metal dependent phosphohydrolase  25.24 
 
 		 799 aa  154  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2475  CRISPR-associated Csm1 family protein  23.66 
 
 		 731 aa  145  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1250  CRISPR-associated protein, Csm1 family  26.9 
 
 		 850 aa  141  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529102 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3256  CRISPR-associated protein, Csm1 family  24.12 
 
 		 810 aa  105  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2826  CRISPR-associated protein, Csm1 family  20.43 
 
 		 737 aa  95.5  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0744  CRISPR-associated Csm1 family protein  25.56 
 
 		 845 aa  92.8  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3443  CRISPR-associated protein, Csm1 family  30.98 
 
 		 719 aa  91.7  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.791619 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2454  CRISPR-associated protein, Csm1 family  34.9 
 
 		 761 aa  83.2  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.442356  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2050  CRISPR-associated Csm1 family protein  29.51 
 
 		 762 aa  75.1  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1977  CRISPR-associated Csm1 family protein  26.62 
 
 		 750 aa  74.3  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.757339  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1152  CRISPR-associated Csm1 family protein  20.67 
 
 		 755 aa  53.9  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00402598  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1361  hypothetical protein  27.4 
 
 		 919 aa  51.2  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.339781  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1484  Cmr2 family CRISPR-associated protein  24.87 
 
 		 488 aa  46.2  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.752806  normal  0.296807 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1823  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  25.35 
 
 		 607 aa  46.6  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1987  CRISPR-associated Csm1 family protein  26.06 
 
 		 548 aa  45.4  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3380  CRISPR-associated protein, Cmr3  26.49 
 
 		 494 aa  45.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.879462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2055  hypothetical protein  26.35 
 
 		 639 aa  44.3  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>