27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1977 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1977  CRISPR-associated Csm1 family protein  100 
 
 		 750 aa  1495    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.757339  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3443  CRISPR-associated protein, Csm1 family  52.97 
 
 		 719 aa  623  1e-177  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.791619 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2475  CRISPR-associated Csm1 family protein  36.92 
 
 		 731 aa  372  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1670  metal dependent phosphohydrolase  24.79 
 
 		 757 aa  219  2e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1388  metal dependent phosphohydrolase  27.7 
 
 		 830 aa  199  1.0000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2704  metal dependent phosphohydrolase  24.24 
 
 		 837 aa  194  6e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.129115  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1250  CRISPR-associated protein, Csm1 family  25.76 
 
 		 850 aa  182  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529102 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0612  metal dependent phosphohydrolase  24 
 
 		 799 aa  178  4e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1756  CRISPR-associated Csm1 family protein  25.08 
 
 		 808 aa  150  7e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0744  CRISPR-associated Csm1 family protein  25.88 
 
 		 845 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1349  CRISPR-associated Csm1 family protein  26.75 
 
 		 848 aa  131  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12837  hypothetical protein  27.38 
 
 		 812 aa  128  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.867182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1637  CRISPR-associated protein, Csm1 family  29.84 
 
 		 800 aa  120  9e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.02785  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1083  CRISPR-associated Csm1 family protein  43.93 
 
 		 838 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.306115  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3256  CRISPR-associated protein, Csm1 family  31.47 
 
 		 810 aa  99.4  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2454  CRISPR-associated protein, Csm1 family  30.88 
 
 		 761 aa  90.5  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.442356  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2050  CRISPR-associated Csm1 family protein  31.03 
 
 		 762 aa  90.1  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1627  CRISPR-associated Csm1 family protein  26.8 
 
 		 780 aa  87.4  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1009  CRISPR-associated Csm1 family protein  31.94 
 
 		 717 aa  85.1  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2826  CRISPR-associated protein, Csm1 family  33.49 
 
 		 737 aa  84.7  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1097  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 		 735 aa  82.8  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2461  CRISPR-associated Csm1 family protein  23.96 
 
 		 757 aa  79  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0456597  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1028  CRISPR-associated protein, Csm1 family  22.43 
 
 		 755 aa  70.9  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00145134  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0215  Csm1 family CRISPR-associated protein  29.95 
 
 		 806 aa  68.6  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0699  CRISPR-associated protein, Csm1 family  31.03 
 
 		 808 aa  66.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.424994  decreased coverage  0.00221335 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1361  hypothetical protein  33.33 
 
 		 919 aa  61.2  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.339781  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1541  HD superfamily hydrolase  34.41 
 
 		 1032 aa  54.3  0.000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.980767  normal  0.454227 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>