30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2055 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2055  hypothetical protein  100 
 
 		 639 aa  1309    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1438  hypothetical protein  24.41 
 
 		 547 aa  120  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.014428 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0980  hypothetical protein  21.73 
 
 		 710 aa  99.8  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1805  hypothetical protein  22.63 
 
 		 759 aa  88.2  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2384  Crm2 family CRISPR-associated protein  28.8 
 
 		 776 aa  85.5  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751103  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0369  hydrolase  22.75 
 
 		 724 aa  78.2  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000218288 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0745  metal dependent phosphohydrolase  22.57 
 
 		 823 aa  75.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.196363  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0192  hydrolase  21.58 
 
 		 727 aa  73.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.928607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1823  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  27.85 
 
 		 607 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0964  CRISPR-associated Cmr2 family protein  26 
 
 		 477 aa  57  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.662431  normal  0.765777 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1674  hypothetical protein  26.62 
 
 		 454 aa  57  0.0000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20500  hypothetical protein  24.75 
 
 		 467 aa  55.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.49751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1072  hypothetical protein  20.82 
 
 		 542 aa  53.5  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1627  CRISPR-associated Csm1 family protein  25.88 
 
 		 780 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1484  Cmr2 family CRISPR-associated protein  24 
 
 		 488 aa  52.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.752806  normal  0.296807 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0700  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  26.9 
 
 		 616 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00738894  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3380  CRISPR-associated protein, Cmr3  25.19 
 
 		 494 aa  51.6  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.879462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1836  hypothetical protein  22.52 
 
 		 514 aa  51.2  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1861  hypothetical protein  23.45 
 
 		 545 aa  47.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.037069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0263  CRISPR-associated Cmr2 family protein  24.18 
 
 		 629 aa  47  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1151  hypothetical protein  25.13 
 
 		 541 aa  46.6  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0136  hypothetical protein  20.94 
 
 		 524 aa  47  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3294  hypothetical protein  19.37 
 
 		 542 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.749446 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2528  hypothetical protein  22 
 
 		 526 aa  46.2  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0649  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  24.68 
 
 		 638 aa  46.2  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1225  hypothetical protein  24.06 
 
 		 505 aa  45.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2461  CRISPR-associated Csm1 family protein  26.35 
 
 		 757 aa  44.3  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0456597  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3209  hypothetical protein  21.54 
 
 		 399 aa  44.3  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2979  CRISPR-associated protein, Crm2 family  23.14 
 
 		 623 aa  43.9  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.113889 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1009  hypothetical protein  23.95 
 
 		 536 aa  44.3  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>