13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1805 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1805  hypothetical protein  100 
 
 
759 aa  1486    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0980  hypothetical protein  47.4 
 
 
710 aa  609  1e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1438  hypothetical protein  25.38 
 
 
547 aa  110  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.014428 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2055  hypothetical protein  22.63 
 
 
639 aa  87.8  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0745  metal dependent phosphohydrolase  23.99 
 
 
823 aa  73.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.196363  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0192  hydrolase  25.53 
 
 
727 aa  70.1  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.928607  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2384  Crm2 family CRISPR-associated protein  24.55 
 
 
776 aa  66.6  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751103  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0369  hydrolase  25.12 
 
 
724 aa  60.8  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000218288 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1861  hypothetical protein  24.53 
 
 
545 aa  54.3  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.037069  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2528  hypothetical protein  28.07 
 
 
526 aa  51.6  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1151  hypothetical protein  25.32 
 
 
541 aa  49.7  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1072  hypothetical protein  23.82 
 
 
542 aa  47  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1836  hypothetical protein  23.15 
 
 
514 aa  44.7  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>