17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0980 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0980  hypothetical protein  100 
 
 
710 aa  1421    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1805  hypothetical protein  47.26 
 
 
759 aa  580  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1438  hypothetical protein  28.15 
 
 
547 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.014428 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2055  hypothetical protein  21.73 
 
 
639 aa  99.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0192  hydrolase  27.92 
 
 
727 aa  79  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.928607  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2528  hypothetical protein  26.01 
 
 
526 aa  64.7  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0369  hydrolase  23.72 
 
 
724 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000218288 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0745  metal dependent phosphohydrolase  19.38 
 
 
823 aa  62  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.196363  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0136  hypothetical protein  21.1 
 
 
524 aa  61.6  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1836  hypothetical protein  22.43 
 
 
514 aa  60.1  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2384  Crm2 family CRISPR-associated protein  26.45 
 
 
776 aa  60.1  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751103  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1674  hypothetical protein  20.35 
 
 
454 aa  55.1  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1861  hypothetical protein  23.25 
 
 
545 aa  51.2  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.037069  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3294  hypothetical protein  21.7 
 
 
542 aa  50.8  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.749446 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1915  hypothetical protein  20.88 
 
 
527 aa  50.8  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1072  hypothetical protein  21.07 
 
 
542 aa  50.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1290  metal dependent phosphohydrolase  24.52 
 
 
914 aa  46.6  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>