19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3294 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1072  hypothetical protein  95.94 
 
 		 542 aa  1070    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3294  hypothetical protein  100 
 
 		 542 aa  1116    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.749446 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1861  hypothetical protein  64.59 
 
 		 545 aa  717    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.037069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1674  hypothetical protein  23.2 
 
 		 454 aa  76.6  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1438  hypothetical protein  24.37 
 
 		 547 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.014428 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1836  hypothetical protein  20.76 
 
 		 514 aa  65.5  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1915  hypothetical protein  22.38 
 
 		 527 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20500  hypothetical protein  24.7 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.49751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2528  hypothetical protein  24.87 
 
 		 526 aa  58.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1378  hypothetical protein  28.02 
 
 		 426 aa  56.2  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0192  hydrolase  25.63 
 
 		 727 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.928607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3206  hypothetical protein  32.05 
 
 		 125 aa  53.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.453952  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0136  hypothetical protein  24.03 
 
 		 524 aa  52.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0980  hypothetical protein  21.7 
 
 		 710 aa  50.8  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1194  CRISPR-associated protein, Crm2 family  26.73 
 
 		 546 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1009  hypothetical protein  22.33 
 
 		 536 aa  47.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2055  hypothetical protein  19.37 
 
 		 639 aa  47.4  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3380  CRISPR-associated protein, Cmr3  30.83 
 
 		 494 aa  43.9  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.879462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0369  hydrolase  22.81 
 
 		 724 aa  43.5  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000218288 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>