40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3380 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014213  Mesil_3380  CRISPR-associated protein, Cmr3  100 
 
 		 494 aa  1004    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.879462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1484  Cmr2 family CRISPR-associated protein  68.3 
 
 		 488 aa  678    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.752806  normal  0.296807 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0964  CRISPR-associated Cmr2 family protein  48.88 
 
 		 477 aa  370  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.662431  normal  0.765777 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2692  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  30.8 
 
 		 612 aa  176  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1823  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  40.15 
 
 		 607 aa  159  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0700  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  32.15 
 
 		 616 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00738894  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2297  CRISPR-associated protein, Crm2 family  37.6 
 
 		 616 aa  124  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0316  CRISPR-associated protein, Crm2 family  26.74 
 
 		 548 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.182847  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0579  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  39.45 
 
 		 628 aa  117  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.638626  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0658  CRISPR-associated protein, Crm2 family  31.35 
 
 		 569 aa  110  8.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1026  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  25.19 
 
 		 812 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1194  CRISPR-associated protein, Crm2 family  26.67 
 
 		 546 aa  103  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2979  CRISPR-associated protein, Crm2 family  32.42 
 
 		 623 aa  97.8  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.113889 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0649  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  29.32 
 
 		 638 aa  95.9  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15150  CRISPR-associated protein, Crm2 family  28.75 
 
 		 676 aa  89.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1317  CRISPR-associated protein, Crm2 family  31.61 
 
 		 650 aa  88.2  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0263  CRISPR-associated Cmr2 family protein  33.67 
 
 		 629 aa  87.8  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1791  CRISPR-associated protein, Crm2 family  33.56 
 
 		 637 aa  79.7  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.175791  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5328  hypothetical protein  23.45 
 
 		 540 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.213692 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0106  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  28.05 
 
 		 528 aa  73.6  0.000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1951  CRISPR-associated protein, Crm2 family  28.32 
 
 		 624 aa  71.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0627  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  26.29 
 
 		 977 aa  70.5  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.397763  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1658  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  25.51 
 
 		 731 aa  63.5  0.000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1097  metal dependent phosphohydrolase  26.55 
 
 		 735 aa  62  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1009  CRISPR-associated Csm1 family protein  26.55 
 
 		 717 aa  61.6  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1578  CRISPR-associated Cmr2 family protein  34.81 
 
 		 594 aa  57.4  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0215  Csm1 family CRISPR-associated protein  30.51 
 
 		 806 aa  52.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2055  hypothetical protein  25.19 
 
 		 639 aa  51.6  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1987  CRISPR-associated Csm1 family protein  24.7 
 
 		 548 aa  50.4  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1349  CRISPR-associated Csm1 family protein  30.56 
 
 		 848 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12837  hypothetical protein  29.94 
 
 		 812 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.867182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0744  CRISPR-associated Csm1 family protein  26 
 
 		 845 aa  47  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1438  hypothetical protein  30.72 
 
 		 547 aa  47  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.014428 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1627  CRISPR-associated Csm1 family protein  23.44 
 
 		 780 aa  47  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1674  hypothetical protein  22.43 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2461  CRISPR-associated Csm1 family protein  26.49 
 
 		 757 aa  45.1  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0456597  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0272  CRISPR-associated Cmr2 family protein  55.88 
 
 		 935 aa  45.1  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1028  CRISPR-associated protein, Csm1 family  24.04 
 
 		 755 aa  44.3  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00145134  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1072  hypothetical protein  28 
 
 		 542 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3294  hypothetical protein  30.83 
 
 		 542 aa  43.9  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.749446 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>