25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1438 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1438  hypothetical protein  100 
 
 
547 aa  1125    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.014428 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0980  hypothetical protein  28.15 
 
 
710 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2055  hypothetical protein  24.41 
 
 
639 aa  120  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1805  hypothetical protein  25.38 
 
 
759 aa  110  8.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0192  hydrolase  26 
 
 
727 aa  95.1  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.928607  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0369  hydrolase  28.28 
 
 
724 aa  93.6  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000218288 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2384  Crm2 family CRISPR-associated protein  24.92 
 
 
776 aa  85.9  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751103  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1072  hypothetical protein  24.15 
 
 
542 aa  77.8  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1674  hypothetical protein  22.73 
 
 
454 aa  77.4  0.0000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3294  hypothetical protein  24.37 
 
 
542 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.749446 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2528  hypothetical protein  31.4 
 
 
526 aa  73.9  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1861  hypothetical protein  24.55 
 
 
545 aa  67  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.037069  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0745  metal dependent phosphohydrolase  21.36 
 
 
823 aa  66.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.196363  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1915  hypothetical protein  22.18 
 
 
527 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1836  hypothetical protein  24 
 
 
514 aa  55.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0136  hypothetical protein  23.21 
 
 
524 aa  54.3  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1378  hypothetical protein  32 
 
 
426 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1225  hypothetical protein  24.71 
 
 
505 aa  48.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1627  CRISPR-associated Csm1 family protein  27.16 
 
 
780 aa  47.8  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3380  CRISPR-associated protein, Cmr3  30.72 
 
 
494 aa  47  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.879462  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1009  hypothetical protein  24.19 
 
 
536 aa  46.2  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0658  CRISPR-associated protein, Crm2 family  21.88 
 
 
569 aa  45.4  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2692  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  29.53 
 
 
612 aa  44.7  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15150  CRISPR-associated protein, Crm2 family  29.27 
 
 
676 aa  43.9  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1484  Cmr2 family CRISPR-associated protein  28.1 
 
 
488 aa  43.5  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.752806  normal  0.296807 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>