37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1484 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014213  Mesil_3380  CRISPR-associated protein, Cmr3  68.3 
 
 		 494 aa  678    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.879462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1484  Cmr2 family CRISPR-associated protein  100 
 
 		 488 aa  995    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.752806  normal  0.296807 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0964  CRISPR-associated Cmr2 family protein  51.84 
 
 		 477 aa  398  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.662431  normal  0.765777 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1823  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  41.47 
 
 		 607 aa  159  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0579  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  29.28 
 
 		 628 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.638626  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0700  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  35.53 
 
 		 616 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00738894  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2297  CRISPR-associated protein, Crm2 family  40.87 
 
 		 616 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2692  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  34.01 
 
 		 612 aa  126  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0316  CRISPR-associated protein, Crm2 family  25.82 
 
 		 548 aa  121  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.182847  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1194  CRISPR-associated protein, Crm2 family  26.09 
 
 		 546 aa  107  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0658  CRISPR-associated protein, Crm2 family  36.22 
 
 		 569 aa  107  6e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0649  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  38 
 
 		 638 aa  97.8  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2979  CRISPR-associated protein, Crm2 family  35.53 
 
 		 623 aa  97.4  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.113889 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1317  CRISPR-associated protein, Crm2 family  34.02 
 
 		 650 aa  92.8  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1026  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  30.81 
 
 		 812 aa  92  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0263  CRISPR-associated Cmr2 family protein  35.62 
 
 		 629 aa  91.3  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15150  CRISPR-associated protein, Crm2 family  32.78 
 
 		 676 aa  82  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1791  CRISPR-associated protein, Crm2 family  32.67 
 
 		 637 aa  80.5  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.175791  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1658  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  22.88 
 
 		 731 aa  76.6  0.0000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0106  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  20.65 
 
 		 528 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0627  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  26.64 
 
 		 977 aa  73.6  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.397763  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5328  hypothetical protein  22.87 
 
 		 540 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.213692 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1951  CRISPR-associated protein, Crm2 family  28.31 
 
 		 624 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1578  CRISPR-associated Cmr2 family protein  35.85 
 
 		 594 aa  63.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0215  Csm1 family CRISPR-associated protein  29.58 
 
 		 806 aa  55.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2055  hypothetical protein  24 
 
 		 639 aa  52.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1987  CRISPR-associated Csm1 family protein  23.61 
 
 		 548 aa  52.4  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1627  CRISPR-associated Csm1 family protein  23 
 
 		 780 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1097  metal dependent phosphohydrolase  26.87 
 
 		 735 aa  49.3  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12837  hypothetical protein  34.04 
 
 		 812 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.867182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1009  CRISPR-associated Csm1 family protein  26.87 
 
 		 717 aa  48.9  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2461  CRISPR-associated Csm1 family protein  24.87 
 
 		 757 aa  46.2  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0456597  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1349  CRISPR-associated Csm1 family protein  29.63 
 
 		 848 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0745  metal dependent phosphohydrolase  21.86 
 
 		 823 aa  44.7  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.196363  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1028  CRISPR-associated protein, Csm1 family  24.32 
 
 		 755 aa  44.7  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00145134  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0369  hydrolase  28 
 
 		 724 aa  43.9  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000218288 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1438  hypothetical protein  28.1 
 
 		 547 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.014428 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>