12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0192 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0369  hydrolase  71.98 
 
 		 724 aa  1011    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000218288 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0192  hydrolase  100 
 
 		 727 aa  1479    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.928607  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2384  Crm2 family CRISPR-associated protein  30.83 
 
 		 776 aa  305  2.0000000000000002e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751103  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1438  hypothetical protein  26 
 
 		 547 aa  95.1  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.014428 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0980  hypothetical protein  27.92 
 
 		 710 aa  79  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2055  hypothetical protein  21.58 
 
 		 639 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1805  hypothetical protein  25.85 
 
 		 759 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0745  metal dependent phosphohydrolase  24.9 
 
 		 823 aa  55.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.196363  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3294  hypothetical protein  25.63 
 
 		 542 aa  55.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.749446 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1861  hypothetical protein  25.72 
 
 		 545 aa  54.7  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.037069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1072  hypothetical protein  25.25 
 
 		 542 aa  50.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1674  hypothetical protein  23.08 
 
 		 454 aa  48.9  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>