21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1674 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1674  hypothetical protein  100 
 
 
454 aa  928    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1836  hypothetical protein  25 
 
 
514 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1009  hypothetical protein  22.06 
 
 
536 aa  86.7  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2528  hypothetical protein  21.97 
 
 
526 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1915  hypothetical protein  21.39 
 
 
527 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1072  hypothetical protein  23.82 
 
 
542 aa  83.6  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3209  hypothetical protein  30.29 
 
 
399 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1438  hypothetical protein  22.73 
 
 
547 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.014428 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3294  hypothetical protein  23.2 
 
 
542 aa  76.6  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.749446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1378  hypothetical protein  30.06 
 
 
426 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0136  hypothetical protein  21.67 
 
 
524 aa  70.9  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1861  hypothetical protein  20 
 
 
545 aa  67  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.037069  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2055  hypothetical protein  26.62 
 
 
639 aa  57  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0980  hypothetical protein  20.35 
 
 
710 aa  55.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0745  metal dependent phosphohydrolase  20.5 
 
 
823 aa  50.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.196363  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0192  hydrolase  23.08 
 
 
727 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.928607  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0369  hydrolase  28 
 
 
724 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000218288 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1028  CRISPR-associated protein, Csm1 family  28.4 
 
 
755 aa  46.2  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00145134  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2384  Crm2 family CRISPR-associated protein  32.69 
 
 
776 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751103  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3380  CRISPR-associated protein, Cmr3  22.43 
 
 
494 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.879462  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0186  hypothetical protein  24.11 
 
 
557 aa  45.1  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>