30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1028 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1028  CRISPR-associated protein, Csm1 family  100 
 
 		 755 aa  1540    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00145134  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1627  CRISPR-associated Csm1 family protein  28.73 
 
 		 780 aa  225  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1637  CRISPR-associated protein, Csm1 family  25.4 
 
 		 800 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.02785  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2826  CRISPR-associated protein, Csm1 family  27.36 
 
 		 737 aa  181  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1083  CRISPR-associated Csm1 family protein  25.57 
 
 		 838 aa  179  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.306115  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0612  metal dependent phosphohydrolase  25.82 
 
 		 799 aa  179  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1756  CRISPR-associated Csm1 family protein  26.8 
 
 		 808 aa  176  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1388  metal dependent phosphohydrolase  27.34 
 
 		 830 aa  176  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0744  CRISPR-associated Csm1 family protein  25.7 
 
 		 845 aa  172  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1349  CRISPR-associated Csm1 family protein  24.61 
 
 		 848 aa  169  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0699  CRISPR-associated protein, Csm1 family  24.23 
 
 		 808 aa  168  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.424994  decreased coverage  0.00221335 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2704  metal dependent phosphohydrolase  25.5 
 
 		 837 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.129115  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0215  Csm1 family CRISPR-associated protein  24.03 
 
 		 806 aa  162  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2461  CRISPR-associated Csm1 family protein  25.93 
 
 		 757 aa  155  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0456597  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1670  metal dependent phosphohydrolase  27.19 
 
 		 757 aa  153  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1009  CRISPR-associated Csm1 family protein  26.42 
 
 		 717 aa  150  9e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1097  metal dependent phosphohydrolase  25.27 
 
 		 735 aa  147  5e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3256  CRISPR-associated protein, Csm1 family  24.4 
 
 		 810 aa  144  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2475  CRISPR-associated Csm1 family protein  24.78 
 
 		 731 aa  143  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12837  hypothetical protein  23.36 
 
 		 812 aa  140  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.867182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1250  CRISPR-associated protein, Csm1 family  35.29 
 
 		 850 aa  103  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529102 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2454  CRISPR-associated protein, Csm1 family  22.59 
 
 		 761 aa  98.6  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.442356  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2050  CRISPR-associated Csm1 family protein  22.63 
 
 		 762 aa  79.7  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3443  CRISPR-associated protein, Csm1 family  21.73 
 
 		 719 aa  75.5  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.791619 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1152  CRISPR-associated Csm1 family protein  21.8 
 
 		 755 aa  70.9  0.00000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00402598  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1541  HD superfamily hydrolase  31.01 
 
 		 1032 aa  63.5  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.980767  normal  0.454227 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1977  CRISPR-associated Csm1 family protein  22.05 
 
 		 750 aa  61.6  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.757339  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1674  hypothetical protein  28.4 
 
 		 454 aa  46.2  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1484  Cmr2 family CRISPR-associated protein  24.32 
 
 		 488 aa  44.7  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.752806  normal  0.296807 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3380  CRISPR-associated protein, Cmr3  24.04 
 
 		 494 aa  44.3  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.879462  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>